TkA01G599520 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G599520

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150988285-150990745 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

369 bp · TkA01G599520|TK1151|cDNA

ATGTCTTTCTCGGACCTTAGTCGGTCGTCTTCTATGCGTCTTAATCAAGACATTCAGAGCTTCGGGCCTGATTTGTTTGATTTTATATTGAGCGAGCTCCGAGCTGTAACTCAGAATTTCTCGAGTAATTTCTTGCTGGGTGAAGGAGGGTTCGGGAAGGTGCACAAGGGTTATGTCGATGAAAGCATGAGAGCGGGATTGAAAGCTCAACCCGTTGCTGTTAAGCTTCTTGATATTGAAGGATTACAGGGTCATCGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

369 bp · TkA01G599520|TK1151|CDS

ATGTCTTTCTCGGACCTTAGTCGGTCGTCTTCTATGCGTCTTAATCAAGACATTCAGAGCTTCGGGCCTGATTTGTTTGATTTTATATTGAGCGAGCTCCGAGCTGTAACTCAGAATTTCTCGAGTAATTTCTTGCTGGGTGAAGGAGGGTTCGGGAAGGTGCACAAGGGTTATGTCGATGAAAGCATGAGAGCGGGATTGAAAGCTCAACCCGTTGCTGTTAAGCTTCTTGATATTGAAGGATTACAGGGTCATCGAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

122 aa · TkA01G599520|TK1151|PROTEIN

MSFSDLSRSSSMRLNQDIQSFGPDLFDFILSELRAVTQNFSSNFLLGEGGFGKVHKGYVDESMRAGLKAQPVAVKLLDIEGLQGHREWLITRSTEKLREVEGGSFSEGSADRRSSGDRNPAV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G599520`
TK1151 ID	TkA01G599520
OH-1004 ID	LXL04_000612
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.180 / OH-1004 75.155 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G599520

位置 Chr01:150988285-150990745 (+)

描述 Similar to PBL15: Probable serine/threonine-protein kinase PBL15

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g61590`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献
`At2g05940`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与抗病性。	xopAC-triggered immunity against Xanthomonas depends on Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase genes PBL2 and RIPK.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0073469 Pseudomonas syringae Effector AvrPphB Suppresses AvrB-Induced Activation of RPM1 but Not AvrRpm1-Induced Activation.2015 · DOI: 10.1094/mpmi-08-14-0248-r
`At5g35580`	参与防御反应。	PBL13 Is a Serine/Threonine Protein Kinase That Negatively Regulates Arabidopsis Immune Responses.2015 · DOI: 10.1104/pp.15.01391

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000612 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0012501 programmed cell death 生物过程

GO:0032491 detection of molecule of fungal origin 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0050777 negative regulation of immune response 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0062207 regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程

GO:1901141 regulation of lignin biosynthetic process 生物过程

GO:1903428 positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G61590

ath:AT2G05940

ath:AT5G35580

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.527

排名 1 · TkA01G599520 · TK1151

细胞核0.398

排名 2 · TkA01G599520 · TK1151

细胞膜0.148

排名 3 · TkA01G599520 · TK1151

线粒体0.087

排名 4 · TkA01G599520 · TK1151

内质网0.058

排名 5 · TkA01G599520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr45-83 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G599520	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	45	83	0.0044	17.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SY91`	拟南芥	sp\|Q9SY91\|PBL15_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL15	71.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9ZUF4`	拟南芥	sp\|Q9ZUF4\|RIPK_ARATH Serine/threonine-protein kinase RIPK	61.500%	Swiss-Prot	高置信
`F4JZW1`	拟南芥	sp\|F4JZW1\|PBL13_ARATH Serine/threonine-protein kinase PBL13	58.200%	Swiss-Prot	高置信

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