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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G596250
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 150124867-150128554 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3446 bp · TkA01G596250|TK1151|cDNA

TTGAAATTCACTGTCGTTATCTTATATTAATAACTCTATTGAAAAAATAACCTAAAAGATTTGCACCCACAAATATTTTCTAGATTTTTTTAATAATGTTGATTGAAAATAAACTATAATTAAAATCCCCTTAAGCATGTTATTTCTTTTTCTCTCTCTTTCTCTCTCATACAATCACGGATGCACGCAGCAGCAAGGTTCTGCGTCAATGGTGGTGACCGCCGGCTAGGTTTAATTTAACCCACACTTTCATCAACACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2871 bp · TkA01G596250|TK1151|CDS

ATGTCGATCTCAAACGCTACTCATGATGGGTGTTCATCATCATCACCAAGATCAGCGAAAATCGCGAATCTGATCCGTCATTTTACAAACACCATGAAATCCGGCGGTCTTAAGTTCAAAGACCGGTGTAAAAAACCCACACAAGTACACGCCCTTACCATCAACTCCATTTTGTCATCATCATCATCATCGAACAGTGATGAATCGTCAACGCTCCCATTCGTCAATGCTAAATCGCTTCTTCCTTATGGGCTCCCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

956 aa · TkA01G596250|TK1151|PROTEIN

MSISNATHDGCSSSSPRSAKIANLIRHFTNTMKSGGLKFKDRCKKPTQVHALTINSILSSSSSSNSDESSTLPFVNAKSLLPYGLPNTHLIEPPIDPHLNPLDFINSISDLYRRITHSSSESESCRLYLEQYALFCAVGDPKLLRRSLQSAREHAVDIHSKVVLSAWLRYERREDELVGISAMDCIGKVLECPKSALSNNVYDPSHSVFDRCQCVDENASDNLNVAGPLTSLDDEFLVHGNDDEIVWFCIGYEVITCLRP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G596250
TK1151 IDTkA01G596250
OH-1004 IDLXL04_000648
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G596250
位置Chr01:150124867-150128554 (-)
描述Similar to ETO1: Ethylene-overproduction protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51770 乙烯途径的重要调节剂，通过调节 1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶 的稳定性发挥作用。
Regulation of ethylene gas biosynthesis by the Arabidopsis ETO1 protein.2004 · DOI: 10.1038/nature02516
Arabidopsis ETO1 specifically interacts with and negatively regulates type 2 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthases.2005 · DOI: 10.1186/1471-2229-5-14
The BTB ubiquitin ligases ETO1, EOL1 and EOL2 act collectively to regulate ethylene biosynthesis in Arabidopsis by controlling type-2 ACC synthase levels.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03693.x
At5g58550 乙烯通路的潜在调节因子，通过调节1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶（ACS）酶的稳定性发挥作用。
The BTB ubiquitin ligases ETO1, EOL1 and EOL2 act collectively to regulate ethylene biosynthesis in Arabidopsis by controlling type-2 ACC synthase levels.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03693.x
At4g02680 可能是乙烯途径的调控因子，通过调节 1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶 (ACS) 酶的稳定性来发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000648 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010364 regulation of ethylene biosynthetic process 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0017145 stem cell division 生物过程
GO:0035864 response to potassium ion 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0046683 response to organophosphorus 生物过程
GO:2000069 regulation of post-embryonic root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51770
ath:AT4G02680
ath:AT5G58550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.559
排名 1 · TkA01G596250 · TK1151
细胞核0.422
排名 2 · TkA01G596250 · TK1151
线粒体0.099
排名 3 · TkA01G596250 · TK1151
细胞膜0.042
排名 4 · TkA01G596250 · TK1151
内质网0.036
排名 5 · TkA01G596250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30484ETO1_C103-173 aa
PF24575TPR_Slam110-129 aa
PF30481ETO1_N119-179 aa
PF30484ETO1_C406-610 aa
PF24575TPR_Slam409-467 aa
PF29407CFAP70_TPR_C429-492 aa
PF13431TPR_17447-462 aa
PF00515TPR_1448-474 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G596250PF30484ETO1_C1031737.6e-190630.6
TkA01G596250PF24575TPR_Slam1101290.3112.2
TkA01G596250PF30481ETO1_N1191792e-2176.5
TkA01G596250PF30484ETO1_C4066107.6e-190630.6
TkA01G596250PF24575TPR_Slam4094670.3112.2
TkA01G596250PF29407CFAP70_TPR_C4294924.9e-0523.7
TkA01G596250PF13431TPR_174474620.2112.7
TkA01G596250PF00515TPR_14484749.9e-1554.4
TkA01G596250PF07719TPR_24484746.6e-1348.4
TkA01G596250PF13181TPR_84484756.6e-0832.8
TkA01G596250PF13424TPR_124485044.4e-0627.5
TkA01G596250PF13374TPR_104484754.5e-0524.0
TkA01G596250PF13371TPR_94494750.6110.9
TkA01G596250PF13414TPR_114554721.6e-0525.2
TkA01G596250PF25062ARM_TT21_N4575080.949.9
TkA01G596250PF13428TPR_144845099.9e-0523.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65020拟南芥sp|O65020|ETO1_ARATH Ethylene-overproduction protein 160.000%Swiss-Prot高置信
Q9LV01拟南芥sp|Q9LV01|ETOL2_ARATH ETO1-like protein 255.800%Swiss-Prot高置信
Q9ZQX6拟南芥sp|Q9ZQX6|ETOL1_ARATH ETO1-like protein 149.300%Swiss-Prot中等置信

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