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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G549110
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 137949037-137949819 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

507 bp · TkA01G549110|TK1151|cDNA

ATGCTTGATATGTCGAAGAAGGAAGCTAAATCAAAAAATAGCCTTGAAAATTATCCTAGCAAAGGATTGTATGGAAATGATGCAAATTTCGAAATTGGTGCGCTGAAAAACATGAAGAACCTAATGTTACTTCAACTTAACTATATAACGTTTTCTGGGAAATACAGTAAGTTTCCCAGAATGTTACGATTACTGAGGTGGCATGGATTTTCTCTAGAGGCTATACCAGCTGACATTTCATTGGACAAGTTGGTAATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

507 bp · TkA01G549110|TK1151|CDS

ATGCTTGATATGTCGAAGAAGGAAGCTAAATCAAAAAATAGCCTTGAAAATTATCCTAGCAAAGGATTGTATGGAAATGATGCAAATTTCGAAATTGGTGCGCTGAAAAACATGAAGAACCTAATGTTACTTCAACTTAACTATATAACGTTTTCTGGGAAATACAGTAAGTTTCCCAGAATGTTACGATTACTGAGGTGGCATGGATTTTCTCTAGAGGCTATACCAGCTGACATTTCATTGGACAAGTTGGTAATTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

168 aa · TkA01G549110|TK1151|PROTEIN

MLDMSKKEAKSKNSLENYPSKGLYGNDANFEIGALKNMKNLMLLQLNYITFSGKYSKFPRMLRLLRWHGFSLEAIPADISLDKLVILDMSYSRLTRVWDDMKVIGSLKILNLSHSRDLINTPDFGRLSSLESLILAGCSSLVKVDESIATLKKLSILDLGDCTRLRDF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G549110
TK1151 IDTkA01G549110
OH-1004 IDLXL04_001297
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 8.433
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G549110
位置Chr01:137949037-137949819 (+)
描述Similar to RUN1: Disease resistance protein RUN1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g11170 推定的抗病蛋白At4g11170。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001297 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
GO:0050135 NADP+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0061809 NAD+ nucleosidase activity, cyclic ADP-ribose generating 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.584
排名 1 · TkA01G549110 · TK1151
细胞质0.332
排名 2 · TkA01G549110 · TK1151
细胞膜0.095
排名 3 · TkA01G549110 · TK1151
内质网0.077
排名 4 · TkA01G549110 · TK1151
质体0.040
排名 5 · TkA01G549110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_832-48 aa
PF12799LRR_433-49 aa
PF23598LRR_1434-111 aa
PF25013LRR_Zer-135-94 aa
PF23247LRR_RPS235-41 aa
PF00560LRR_144-48 aa
PF12799LRR_472-94 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2172-138 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G549110PF13855LRR_832487.9e-0626.3
TkA01G549110PF12799LRR_433498.3e-0523.4
TkA01G549110PF23598LRR_14341110.000221.0
TkA01G549110PF25013LRR_Zer-135940.0001622.6
TkA01G549110PF23247LRR_RPS235410.1612.6
TkA01G549110PF00560LRR_144480.02215.5
TkA01G549110PF12799LRR_472948.3e-0523.4
TkA01G549110PF25019LRR_R13L1-DRL21721380.0008420.0
TkA01G549110PF23247LRR_RPS2781100.1612.6
TkA01G549110PF13855LRR_8811157.9e-0626.3
TkA01G549110PF13855LRR_8831387.9e-0626.3
TkA01G549110PF07725LRR_3831000.01415.9
TkA01G549110PF00560LRR_183950.02215.5
TkA01G549110PF12799LRR_4841158.3e-0523.4
TkA01G549110PF23952LRR_EndoS991670.03615.0
TkA01G549110PF25013LRR_Zer-11041630.0001622.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O82500拟南芥sp|O82500|Y4117_ARATH Putative disease resistance protein At4g1117036.100%Swiss-Prot低置信

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