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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G547980
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 137656130-137660871 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2583 bp · TkA01G547980|TK1151|cDNA

TTTACTCTTGATAATGTTATTTGGGCAGACCCGCAGTCCAGTACGGGACTACGGGCAAATTATGCATTGATCCGAATACCGAGCACAAAAGGAGCAAGTACATGGCGCCTTTCATTTCAAATTAACCTCTTCTCAAAATCAAACATTCATTCTCCACTTGATTTCCCTTTTCGAATCTAGGGTGAACAAGAATGATTGTAAGAACGCCTCTACCTAAGAAACGAAGGTCCGATACGACCGGCAACTCGGAGAGCCCTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1629 bp · TkA01G547980|TK1151|CDS

ATGATTGTAAGAACGCCTCTACCTAAGAAACGAAGGTCCGATACGACCGGCAACTCGGAGAGCCCTAACTCTGATGGCCGTTTGGTGATCTTCGAGGACCTGCCGGAGCCGGAACCCTCTCACCAACATTCCGATCAGATGCTTTGCACCTACCAGTGCCGGCAACTGGTCAAGGCAGATTTCATAGATGCTTTAAGCAGTGCAGAGAAGCAATCACAAAGTTATCAATCCAAACTTGAGGCAATGAATGATGACTTCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

542 aa · TkA01G547980|TK1151|PROTEIN

MIVRTPLPKKRRSDTTGNSESPNSDGRLVIFEDLPEPEPSHQHSDQMLCTYQCRQLVKADFIDALSSAEKQSQSYQSKLEAMNDDFHKSETERMKFRDQLLYAEQELAAARAREESLQDQLLKEINESQERLKKQIHVHSELEIKFKKEMDLRKNAESLLSSAEEKANLLEGKLSHVSESIEREKVRLQKDLTQLKQESKLSISRISADLEKMECKANNSEKEATMLKEQLENLQNQLNECLHEKNEVEKKLSTLTYQET...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G547980
TK1151 IDTkA01G547980
OH-1004 IDLXL04_001313
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.232 / OH-1004 73.773
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G547980
位置Chr01:137656130-137660871 (+)
描述Similar to MAD1: Mitotic spindle checkpoint protein MAD1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49880 执行有丝分裂检查点所需，该检查点监视着丝粒-纺锤体附着过程，并在该过程未完成时延迟后期的开始。
Functional interaction between the Arabidopsis orthologs of spindle assembly checkpoint proteins MAD1 and MAD2 and the nucleoporin NUA.2012 · DOI: 10.1007/s11103-012-9903-4

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001313 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007094 mitotic spindle assembly checkpoint signaling 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051315 attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore 生物过程
GO:0090235 regulation of metaphase plate congression 生物过程
GO:0090267 positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint 生物过程
GO:0099606 microtubule plus-end directed mitotic chromosome migration 生物过程
GO:1901990 regulation of mitotic cell cycle phase transition 生物过程
GO:1902426 deactivation of mitotic spindle assembly checkpoint 生物过程
GO:0000776 kinetochore 细胞组分
GO:0000922 spindle pole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G49880
cge:100689352
hsa:8379
mmu:17120
spo:2540320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.537
排名 1 · TkA01G547980 · TK1151
细胞核0.360
排名 2 · TkA01G547980 · TK1151
高尔基体0.083
排名 3 · TkA01G547980 · TK1151
细胞膜0.080
排名 4 · TkA01G547980 · TK1151
内质网0.042
排名 5 · TkA01G547980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04102SlyX67-92 aa
PF05557MAD72-389 aa
PF04102SlyX115-115 aa
PF04102SlyX118-141 aa
PF25884At5g19230119-133 aa
PF04102SlyX170-208 aa
PF25884At5g19230187-249 aa
PF04102SlyX210-259 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G547980PF04102SlyX67920.02915.7
TkA01G547980PF05557MAD723894.6e-0626.1
TkA01G547980PF04102SlyX1151150.02915.7
TkA01G547980PF04102SlyX1181410.02915.7
TkA01G547980PF25884At5g192301191331.39.5
TkA01G547980PF04102SlyX1702080.02915.7
TkA01G547980PF25884At5g192301872491.39.5
TkA01G547980PF04102SlyX2102590.02915.7
TkA01G547980PF04102SlyX2742900.02915.7
TkA01G547980PF04102SlyX3573950.02915.7
TkA01G547980PF05557MAD3905214.6e-0626.1
TkA01G547980PF04102SlyX3964420.02915.7
TkA01G547980PF25884At5g192304304601.39.5
TkA01G547980PF04102SlyX4524970.02915.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LTY1拟南芥sp|Q9LTY1|MAD1_ARATH Mitotic spindle checkpoint protein MAD154.600%Swiss-Prot高置信

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