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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G534850
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 134220137-134224483 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1965 bp · TkA01G534850|TK1151|cDNA

ATGGAAGAATCGCCGAGCGCCACCGAAGCCGCCAAAATCTGCTCAATTCAATGTGATCCAATACAAAACCCCACCGGCGGTTGCATAGCCCTCTGCTCTTCCATCTGTGGCTACTTCTGTAACATCAGCGATTCATCTCCGCCGCTACAATCACCAACGCCGTTGCCCACCGACGGTTTTATCCTCAGTACACCAACCCCAAAACACCACCACTCACCACTTAGTCTTCCCCTCAAGATCTCCCTTGTAATCCTTGTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1965 bp · TkA01G534850|TK1151|CDS

ATGGAAGAATCGCCGAGCGCCACCGAAGCCGCCAAAATCTGCTCAATTCAATGTGATCCAATACAAAACCCCACCGGCGGTTGCATAGCCCTCTGCTCTTCCATCTGTGGCTACTTCTGTAACATCAGCGATTCATCTCCGCCGCTACAATCACCAACGCCGTTGCCCACCGACGGTTTTATCCTCAGTACACCAACCCCAAAACACCACCACTCACCACTTAGTCTTCCCCTCAAGATCTCCCTTGTAATCCTTGTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

654 aa · TkA01G534850|TK1151|PROTEIN

MEESPSATEAAKICSIQCDPIQNPTGGCIALCSSICGYFCNISDSSPPLQSPTPLPTDGFILSTPTPKHHHSPLSLPLKISLVILVVTFSLFLLYTLYKFYTVWYRSRRRRSPPPSPETQETHDEFLDHDVLDHPIWYIRTIGLQPSVISAITVVKYSKTDGLIEETNCSVCLSEFEEDETLRLLPKCNHAFHISCIDTWLRSHTNCPLCRAGIVKNTTSSSSDQNLDDSGRTEETRLAIPIPEEVNREERQSELDRQSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G534850
TK1151 IDTkA01G534850
OH-1004 IDLXL04_001443
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G534850
位置Chr01:134220137-134224483 (-)
描述Similar to 2ODD19: 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10500 在体外将水杨酸 转化为 2,3-二羟基苯甲酸 和 2,5-DHBA，但在体内仅转化为 2,3-DHBA。
DOWNY MILDEW RESISTANT 6 and DMR6-LIKE OXYGENASE 1 are partially redundant but distinct suppressors of immunity in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12719
At4g10490 将水杨酸（SA）转化为2,3-二羟基苯甲酸（2,3-DHBA）（基于相似性推测）。
DOWNY MILDEW RESISTANT 6 and DMR6-LIKE OXYGENASE 1 are partially redundant but distinct suppressors of immunity in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12719

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0480200 参与褪黑素降解。 暂无已核实直接文献
Os08g0560000 参与芽发育和水杨酸（SA）稳态的调节。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001443 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0002239 response to oomycetes 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0046244 salicylic acid catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016706 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity 分子功能
GO:0031418 L-ascorbic acid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G10490
ath:AT4G10500
dosa:Os08g0480200
dosa:Os08g0560000
osa:4345848
osa:4346321
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.574
排名 1 · TkA01G534850 · TK1151
细胞核0.408
排名 2 · TkA01G534850 · TK1151
细胞膜0.130
排名 3 · TkA01G534850 · TK1151
内质网0.064
排名 4 · TkA01G534850 · TK1151
溶酶体／液泡0.048
排名 5 · TkA01G534850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17120zf-RING_1629-41 aa
PF07010Endomucin42-101 aa
PF13920zf-C3HC4_3166-214 aa
PF11793FANCL_C166-206 aa
PF11789zf-Nse167-210 aa
PF17120zf-RING_16167-210 aa
PF13639zf-RING_2168-211 aa
PF12678zf-rbx1168-211 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G534850PF17120zf-RING_1629419.56.6
TkA01G534850PF07010Endomucin421010.08813.4
TkA01G534850PF13920zf-C3HC4_31662140.001519.0
TkA01G534850PF11793FANCL_C1662060.04814.7
TkA01G534850PF11789zf-Nse1672103.28.4
TkA01G534850PF17120zf-RING_161672109.56.6
TkA01G534850PF13639zf-RING_21682117.4e-1452.4
TkA01G534850PF12678zf-rbx11682111.8e-1041.6
TkA01G534850PF17123zf-RING_111681972e-1040.9
TkA01G534850PF13923zf-C3HC4_21682104.3e-0833.5
TkA01G534850PF14634zf-RING_51682117.8e-0523.3
TkA01G534850PF21202SLX1_C1682020.6711.0
TkA01G534850PF00097zf-C3HC41692101.2e-0732.2
TkA01G534850PF13445zf-RING_UBOX1692088.5e-0523.2
TkA01G534850PF24921RING_XB3-XBAT311692150.3411.7
TkA01G534850PF00628PHD1692031.49.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZSA8拟南芥sp|Q9ZSA8|DLO1_ARATH Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 139.900%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSA7拟南芥sp|Q9ZSA7|DLO2_ARATH Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 238.600%Swiss-Prot中等置信
Q6Z244水稻sp|Q6Z244|ODD19_ORYSJ 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 1946.900%Swiss-Prot低置信
Q6YYX9水稻sp|Q6YYX9|SLC1_ORYSJ Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase SLC142.100%Swiss-Prot低置信

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