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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G127030
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 32108421-32113166 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1068 bp · TkA01G127030|TK1151|cDNA

ATGGAGCATGTGTCCTGCTTTGCAAATGAATGCCCCAACCTGAAACTACTTCTTCATGTATCCACAGCTTATGTATCTGGTGAAAAGTCTGGAATCATATTAGAGATGCCATTTAAAATGGGTGAGACATTGAATGGAAGTAATGATCTGGATATTAGAGAAGAGAAGAGGGTAACAACAGAGACACATAGACAACTCGTCGGTGAGAAGGCTAATGAGGAATCCATGTCATGTGCAATGAAGGATCTTGGTATTCAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1068 bp · TkA01G127030|TK1151|CDS

ATGGAGCATGTGTCCTGCTTTGCAAATGAATGCCCCAACCTGAAACTACTTCTTCATGTATCCACAGCTTATGTATCTGGTGAAAAGTCTGGAATCATATTAGAGATGCCATTTAAAATGGGTGAGACATTGAATGGAAGTAATGATCTGGATATTAGAGAAGAGAAGAGGGTAACAACAGAGACACATAGACAACTCGTCGGTGAGAAGGCTAATGAGGAATCCATGTCATGTGCAATGAAGGATCTTGGTATTCAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

355 aa · TkA01G127030|TK1151|PROTEIN

MEHVSCFANECPNLKLLLHVSTAYVSGEKSGIILEMPFKMGETLNGSNDLDIREEKRVTTETHRQLVGEKANEESMSCAMKDLGIQRAKLHGWPNVYVFTKAMGEMLLVEGLRQDVPLVILRPTIIASTCKEPFPGWMEGIKTIDSFIAVYGKGRTSCFLADPDKVLDIIPADMVINVMIVAMAAHINKPYSKTVYHVGSSMSNPINISTFKNFLADYFAKNPLVSRQGKPIIRSKRITLLSSMRSFKRYIMFRYMIPIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G127030
TK1151 IDTkA01G127030
OH-1004 IDLXL04_004664
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 77.465 / OH-1004 97.865
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G127030
位置Chr01:32108421-32113166 (+)
描述Similar to FAR4: Probable fatty acyl-CoA reductase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g44540 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Three Arabidopsis fatty acyl-coenzyme A reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, generate primary fatty alcohols associated with suberin deposition.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.158238
Identification of an Arabidopsis fatty alcohol:caffeoyl-Coenzyme A acyltransferase required for the synthesis of alkyl hydroxycinnamates in root waxes.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201822
At5g22500 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Three Arabidopsis fatty acyl-coenzyme A reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, generate primary fatty alcohols associated with suberin deposition.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.158238
Identification of an Arabidopsis fatty alcohol:caffeoyl-Coenzyme A acyltransferase required for the synthesis of alkyl hydroxycinnamates in root waxes.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201822
At4g33790 催化脂肪酰辅酶A还原为脂肪醇。
CER4 encodes an alcohol-forming fatty acyl-coenzyme A reductase involved in cuticular wax production in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.086785
At3g44550 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Three Arabidopsis fatty acyl-coenzyme A reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, generate primary fatty alcohols associated with suberin deposition.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.158238
Identification of an Arabidopsis fatty alcohol:caffeoyl-Coenzyme A acyltransferase required for the synthesis of alkyl hydroxycinnamates in root waxes.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201822
Identification of amino acids conferring chain length substrate specificities on fatty alcohol-forming reductases FAR5 and FAR8 from Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.499715

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004664 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0035336 long-chain fatty-acyl-CoA metabolic process 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0080019 alcohol-forming very long-chain fatty acyl-CoA reductase activity 分子功能
GO:0102965 alcohol-forming long-chain fatty acyl-CoA reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AAD38039
ath:AT3G44540
ath:AT3G44550
ath:AT4G33790
ath:AT5G22500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.256
排名 1 · TkA01G127030 · TK1151
内质网0.246
排名 2 · TkA01G127030 · TK1151
细胞质0.147
排名 3 · TkA01G127030 · TK1151
质体0.110
排名 4 · TkA01G127030 · TK1151
线粒体0.087
排名 5 · TkA01G127030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07993NAD_binding_43-179 aa
PF23288KOW6_SPT5154-169 aa
PF03015Sterile279-355 aa
PF23288KOW6_SPT5297-330 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G127030PF07993NAD_binding_431792.3e-31109.6
TkA01G127030PF23288KOW6_SPT51541690.07213.8
TkA01G127030PF03015Sterile2793553.3e-1143.9
TkA01G127030PF23288KOW6_SPT52973300.07213.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LXN3拟南芥sp|Q9LXN3|FACR4_ARATH Probable fatty acyl-CoA reductase 451.700%Swiss-Prot高置信
Q39152拟南芥sp|Q39152|FACR1_ARATH Fatty acyl-CoA reductase 148.400%Swiss-Prot中等置信
Q93ZB9拟南芥sp|Q93ZB9|FACR3_ARATH Fatty acyl-CoA reductase 349.000%Swiss-Prot中等置信
Q0WRB0拟南芥sp|Q0WRB0|FACR5_ARATH Probable fatty acyl-CoA reductase 544.600%Swiss-Prot中等置信

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