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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G014080
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 3655234-3658647 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3339 bp · TkA01G014080|TK1151|cDNA

TCATGTTATTTTCATAAATTTCTTCATCTTAATTAAATAATCTCATTCCCATCTTCATTACACTTAAATCTAAACTCCAGAAGATGACCAGAGCATGTGAAGACAACCATCTTTTTATAGGAAACAAACAAGATCACCACCATTAGAATATGCTTTAAAGTTTTTAAAGATCGTCACCATCGCCGCCACCGCATCACCACCATGGACCACCGATATTCTTTTCCGCCATTAAAACTCACGCCGATATCATTTACCTACCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2706 bp · TkA01G014080|TK1151|CDS

ATGTTTTTTTTGGTCTTTGAATCAATGAGAAGTTTATTGCCACAATGCTGCTACTTCACCGCGAGTTCGCTGTTGCTAATTGCATTCCTGTCGCCGGCGGCTGTCGATCAGGTGGCGGCAGCGGCGTCCGAGAAAGAGATCCTGCTTCAGTTCAAAGGTAACATAACAAGCGACCCTTACAATAGTTTGATTTCATGGAATTCTAGTACAGATCAGTGTAGAGATTATAGCGGTGTGTTTTGTGATTCTTTTGGGAATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

901 aa · TkA01G014080|TK1151|PROTEIN

MFFLVFESMRSLLPQCCYFTASSLLLIAFLSPAAVDQVAAAASEKEILLQFKGNITSDPYNSLISWNSSTDQCRDYSGVFCDSFGNVYKIVLWNTSLGGVLSPSLSELKSLRILTLFGNRFTGNIPPEFQELTTLWKINVSSNALSGSIPEFLGDLNSIRFLDLSRNGFEGSIPSSLFKVCEKTKFISLSHNNLSGALPIIVNNCLNLEGFDVSFNSLTGEFPSQICEIPPLSYLSVRNNMLTGTVHEQVSNCQRLELLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G014080
TK1151 IDTkA01G014080
OH-1004 IDLXL04_005825
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 84.363
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G014080
位置Chr01:3655234-3658647 (-)
描述Similar to At1g12460: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g12460
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12460 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g12460。 暂无已核实直接文献
At3g56370 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶IRK。 暂无已核实直接文献
At3g28040 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 暂无已核实直接文献
At5g01890 富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶，可能参与维管组织发育。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005825 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048481 plant ovule development 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090511 periclinal cell division 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12460
ath:AT3G28040
ath:AT3G56370
ath:AT5G01890
ath:AT5G07180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.864
排名 1 · TkA01G014080 · TK1151
内质网0.094
排名 2 · TkA01G014080 · TK1151
细胞质0.057
排名 3 · TkA01G014080 · TK1151
细胞核0.042
排名 4 · TkA01G014080 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA01G014080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18303Saf_2TM15-52 aa
PF08263LRRNT_242-82 aa
PF13855LRR_886-145 aa
PF00560LRR_189-108 aa
PF12799LRR_491-121 aa
PF23598LRR_14101-165 aa
PF00560LRR_1110-132 aa
PF13855LRR_8110-168 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G014080PF18303Saf_2TM15520.02415.0
TkA01G014080PF08263LRRNT_242821.8e-0732.0
TkA01G014080PF13855LRR_8861457.5e-2484.0
TkA01G014080PF00560LRR_1891084.7e-33106.8
TkA01G014080PF12799LRR_4911216.6e-1761.9
TkA01G014080PF23598LRR_141011651.8e-1763.9
TkA01G014080PF00560LRR_11101324.7e-33106.8
TkA01G014080PF13855LRR_81101687.5e-2484.0
TkA01G014080PF00560LRR_11351564.7e-33106.8
TkA01G014080PF12799LRR_41381676.6e-1761.9
TkA01G014080PF23211LRR_LRWD11491752.18.7
TkA01G014080PF00560LRR_11581784.7e-33106.8
TkA01G014080PF13855LRR_81722157.5e-2484.0
TkA01G014080PF00560LRR_11852054.7e-33106.8
TkA01G014080PF23598LRR_141852611.8e-1763.9
TkA01G014080PF12799LRR_41862186.6e-1761.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGE4拟南芥sp|C0LGE4|Y1124_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1246064.000%Swiss-Prot高置信
Q9LY03拟南芥sp|Q9LY03|IRK_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK40.500%Swiss-Prot低置信
Q9LRT1拟南芥sp|Q9LRT1|Y3804_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g2804038.600%Swiss-Prot低置信
Q9LZV7拟南芥sp|Q9LZV7|PXC2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC237.000%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393034.800%Swiss-Prot低置信

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