RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_039177
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 61588404-61591662 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2856 bp · LXL04_039177|LXL04_039177|OH1004|cDNA

ATGGGATTTCACTATATTTTCATCTTCTATCTTGTATTTTTGTTTCCAATTTCAAGCTCTAATGGAAACACCATTGTTAACGAGTCTGAGTTCTTCACAGTTATGAAAAGATCTCTTTCCGGCAACCCTCTGGGTGACTGGGCCGGAAAAAATGTATGCAACTACACAGGGATAACCTGCAACCATTTAGGGCGTGTAGTCAAGATTGATATTTCAGGGTGGAGCTTATCTGGCCGCTTCCCAGAAAACATATGTTTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2856 bp · LXL04_039177|LXL04_039177|OH1004|CDS

ATGGGATTTCACTATATTTTCATCTTCTATCTTGTATTTTTGTTTCCAATTTCAAGCTCTAATGGAAACACCATTGTTAACGAGTCTGAGTTCTTCACAGTTATGAAAAGATCTCTTTCCGGCAACCCTCTGGGTGACTGGGCCGGAAAAAATGTATGCAACTACACAGGGATAACCTGCAACCATTTAGGGCGTGTAGTCAAGATTGATATTTCAGGGTGGAGCTTATCTGGCCGCTTCCCAGAAAACATATGTTTTTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

951 aa · LXL04_039177|LXL04_039177|OH1004|PROTEIN

MGFHYIFIFYLVFLFPISSSNGNTIVNESEFFTVMKRSLSGNPLGDWAGKNVCNYTGITCNHLGRVVKIDISGWSLSGRFPENICFYLPELKSLNIGHNDIHGDFPYSITNCSLLEELTTTHTNLAGKLPDMSPMVSLRFLDMSSCSFTGKFPMSFINLTNLEVVNFNENTGFDLWRLPDDIFRLTKLRSMILSSCMVSGSVPKSIGNMTSLVDLELSGNFLVGPVPREIGLLQNLQLIELYYNELTGRLPEELGNLTGL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_039177
TK1151 IDTkA04G512740
OH-1004 IDLXL04_039177
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_039177
位置Chr09:61588404-61591662 (+)
描述Similar to CEPR1: Receptor protein-tyrosine kinase CEPR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49660 受体激酶参与 C 末端编码的植物信号肽 的感知以及根和芽发育的后续调节。
XYLEM INTERMIXED WITH PHLOEM1, a leucine-rich repeat receptor-like kinase required for stem growth and vascular development in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1489-6
CEP5 and XIP1/CEPR1 regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw231
At1g09970 在病原体相关分子模式 诱导的模式触发免疫 信号传导中发挥作用。
RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4
The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献
At3g19700 通过负调控合胞体胚乳的细胞化来调节种子大小。
MINISEED3 (MINI3), a WRKY family gene, and HAIKU2 (IKU2), a leucine-rich repeat (LRR) KINASE gene, are regulators of seed size in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0508418102
At1g72180 受体激酶，参与感知 C 端编码植物信号肽 (CEP) 及随后对根和芽的发育调控。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039177 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009960 endosperm development 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0010555 response to mannitol 生物过程
GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09970
ath:AT1G28440
ath:AT1G72180
ath:AT3G19700
ath:AT5G49660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.869
排名 1 · LXL04_039177 · OH-1004
内质网0.086
排名 2 · LXL04_039177 · OH-1004
细胞质0.060
排名 3 · LXL04_039177 · OH-1004
细胞核0.037
排名 4 · LXL04_039177 · OH-1004
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · LXL04_039177 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14113-220 aa
PF23598.2LRR_14229-314 aa
PF13855.13LRR_8384-438 aa
PF13855.13LRR_8402-462 aa
PF12799.14LRR_4426-463 aa
PF13855.13LRR_8427-486 aa
PF23598.2LRR_14431-508 aa
PF13855.13LRR_8451-510 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_039177PF23598.2LRR_141132201.6e-2280.5
LXL04_039177PF23598.2LRR_142293141.6e-2280.5
LXL04_039177PF13855.13LRR_83844384.8e-2691.0
LXL04_039177PF13855.13LRR_84024624.8e-2691.0
LXL04_039177PF12799.14LRR_44264632.6e-2691.8
LXL04_039177PF13855.13LRR_84274864.8e-2691.0
LXL04_039177PF23598.2LRR_144315081.6e-2280.5
LXL04_039177PF13855.13LRR_84515104.8e-2691.0
LXL04_039177PF00069.32Pkinase6509265.4e-45154.6
LXL04_039177PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr6519276.1e-38131.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FGL5拟南芥Receptor protein-tyrosine kinase CEPR162.842%Swiss-Prot强数据库同源证据
F4I2N7拟南芥Receptor-like protein kinase 740.303%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SGP2拟南芥Receptor-like protein kinase HSL139.893%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LJM4拟南芥Receptor-like protein kinase HAIKU237.309%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C7T7拟南芥Receptor protein-tyrosine kinase CEPR239.242%Swiss-Prot中等数据库同源证据

JBrowse

在基因组浏览器中查看