基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_038862
当前版本: OH-1004
染色体: Chr09
坐标: 52100776-52103178
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1077 bp · LXL04_038862|LXL04_038862|OH1004|cDNA
ATGGCGAGATCGTCGATCCATTTCACGTTAGCAACTGTAGCTCTGTTCTTAGTCTCTTCAGCCGTCGCCGAATACCTGACATTGACACAAGATACCTTCGAGAAGGAGGTCGGTCAAGATCGCGACGCTCTCGTGGAGTTCTACGCTCCCTGGTGTGGGTACTGCAAAAAGATCGCACCTGAATATGAAAGACTTGGTAATGGCTTCAAGAAGGCAAAATCCGTATTAATTGGAAAGGTGGATTGTGATGAAGATAAGGA...
CDS
下载 CDS FASTA1077 bp · LXL04_038862|LXL04_038862|OH1004|CDS
ATGGCGAGATCGTCGATCCATTTCACGTTAGCAACTGTAGCTCTGTTCTTAGTCTCTTCAGCCGTCGCCGAATACCTGACATTGACACAAGATACCTTCGAGAAGGAGGTCGGTCAAGATCGCGACGCTCTCGTGGAGTTCTACGCTCCCTGGTGTGGGTACTGCAAAAAGATCGCACCTGAATATGAAAGACTTGGTAATGGCTTCAAGAAGGCAAAATCCGTATTAATTGGAAAGGTGGATTGTGATGAAGATAAGGA...
358 aa · LXL04_038862|LXL04_038862|OH1004|PROTEIN
MARSSIHFTLATVALFLVSSAVAEYLTLTQDTFEKEVGQDRDALVEFYAPWCGYCKKIAPEYERLGNGFKKAKSVLIGKVDCDEDKDICTKYEVTGYPTFKWFPKGSLEPKKYDGERTADKFADFVNSQAGTYVKVSAVGSNVVSLTSENFNKIVMDNTKHVLVEFSAPWCGHCQNLAPIYESLGDAFKNEADVVIANVNTDNNKKIAERYEVQGIPKLILFSKDNKDGEGYGGALDLEGLVSFINEKCGTSRDEEGQLT...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_038862 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_038862 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr09:52100776-52103178 (+) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to Probable protein disulfide-isomerase A6 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:0009553 embryo sac development 生物过程 GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程 GO:0048868 pollen tube development 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G47470 dosa:Os01g0339900 dosa:Os05g0156300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.812
细胞质0.138
溶酶体／液泡0.109
细胞外0.074
高尔基体0.057
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00085.27Thioredoxin26-127 aaPF04756.20OST3_OST652-136 aaPF04756.20OST3_OST6140-228 aaPF00085.27Thioredoxin143-246 aaPF14595.13Thioredoxin_9144-229 aaPF20207.5PedC-like145-225 aaPF13098.14Thioredoxin_2155-239 aaPF07749.18ERp29264-357 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_038862 | PF00085.27 | Thioredoxin | 26 | 127 | 1.8e-62 | 208.5 |
| LXL04_038862 | PF04756.20 | OST3_OST6 | 52 | 136 | 3e-17 | 63.7 |
| LXL04_038862 | PF04756.20 | OST3_OST6 | 140 | 228 | 3e-17 | 63.7 |
| LXL04_038862 | PF00085.27 | Thioredoxin | 143 | 246 | 1.8e-62 | 208.5 |
| LXL04_038862 | PF14595.13 | Thioredoxin_9 | 144 | 229 | 6.6e-06 | 26.8 |
| LXL04_038862 | PF20207.5 | PedC-like | 145 | 225 | 1.2e-08 | 35.6 |
| LXL04_038862 | PF13098.14 | Thioredoxin_2 | 155 | 239 | 4.8e-13 | 50.2 |
| LXL04_038862 | PF07749.18 | ERp29 | 264 | 357 | 2.6e-22 | 80.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。