基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029984
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 104971099-104976970
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2049 bp · LXL04_029984|LXL04_029984|OH1004|cDNA
ATGGATTTCGTTGAAGGAGTTGGTGAAAGCTCTTCACCGCCTAGGAGTTTTGGAGGTTTCAGCGGCTACGAGATAGTGAATGATGTGTATAATCGGTTACTGGAGATTGGCAACGACGAAGCTACTACTCAACCTGAATTTCGTGATCAATTGGCTGCTCACTTCATTCGATTACCTGCTAGTTATGCCCTGGATATCAACTTGAATAGAGTTGAAGATGTATTGCTACATCAGAAGCTCCTTATACTGGCAAAAGACCC...
CDS
下载 CDS FASTA2049 bp · LXL04_029984|LXL04_029984|OH1004|CDS
ATGGATTTCGTTGAAGGAGTTGGTGAAAGCTCTTCACCGCCTAGGAGTTTTGGAGGTTTCAGCGGCTACGAGATAGTGAATGATGTGTATAATCGGTTACTGGAGATTGGCAACGACGAAGCTACTACTCAACCTGAATTTCGTGATCAATTGGCTGCTCACTTCATTCGATTACCTGCTAGTTATGCCCTGGATATCAACTTGAATAGAGTTGAAGATGTATTGCTACATCAGAAGCTCCTTATACTGGCAAAAGACCC...
682 aa · LXL04_029984|LXL04_029984|OH1004|PROTEIN
MDFVEGVGESSSPPRSFGGFSGYEIVNDVYNRLLEIGNDEATTQPEFRDQLAAHFIRLPASYALDINLNRVEDVLLHQKLLILAKDPENRPVFHVRFLENYGTQVDGDEDQQEVSVGPELSHDKKPEMDVEACSKLEDLNLEVRSTSLDKGKENLDVDSFKRQDDIHVPIHEVIFSAVDKPKLLSQLSALVSDIGLNIREAHVFSTTDGYSLDVFVVDGWPLQETKTLHEAMERAIARSEGSWCGSKRSKSAIERASFVD...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029984 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029984 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:104971099-104976970 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to STY46: Serine/threonine-protein kinase STY46 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程 GO:0010344 seed oilbody biogenesis 生物过程 GO:0045995 regulation of embryonic development 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0071244 cellular response to carbon dioxide 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程 GO:2000030 regulation of response to red or far red light 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G62400 ath:AT2G17700 ath:AT2G24360 ath:AT4G35780 ath:AT4G38470 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.463
细胞核0.315
细胞膜0.264
高尔基体0.093
内质网0.079
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01842.32ACT172-219 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr269-515 aaPF00069.32Pkinase270-512 aaPF03109.23ABC1339-415 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029984 | PF01842.32 | ACT | 172 | 219 | 7e-06 | 26.4 |
| LXL04_029984 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 269 | 515 | 2.5e-73 | 247.3 |
| LXL04_029984 | PF00069.32 | Pkinase | 270 | 512 | 6.6e-58 | 196.9 |
| LXL04_029984 | PF03109.23 | ABC1 | 339 | 415 | 3e-07 | 30.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
F4JTP5 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase STY46 | 50.888% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8RWL6 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase STY17 | 47.826% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O22558 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase STY8 | 47.940% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9ZQ31 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase STY13 | 47.656% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q2MHE4 | 拟南芥 | Serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT1 | 47.451% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |