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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024119
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 81451393-81452578 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

888 bp · LXL04_024119|LXL04_024119|OH1004|cDNA

ATGGAGCACAATCAAGGAACCTATGATCATGAAGACCCGTTAGAACTGCCTCCAGGCTTTCGTTTTCATCCTACTGATGACGAACTCATCATTCACTACTTATATCGGAAGGTGTTTGATGATTATTTTGAAAGTCGAGCCATTGGAGACGTTGATTTGAACAAACTCGAACCATGGGAGCTTCCATTGAGGGCGAAAACAGGGGAAAATGAATGGTATTTCTTTTGTGTTAGAGATCGAAAATACCCAACTGGTTTAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

888 bp · LXL04_024119|LXL04_024119|OH1004|CDS

ATGGAGCACAATCAAGGAACCTATGATCATGAAGACCCGTTAGAACTGCCTCCAGGCTTTCGTTTTCATCCTACTGATGACGAACTCATCATTCACTACTTATATCGGAAGGTGTTTGATGATTATTTTGAAAGTCGAGCCATTGGAGACGTTGATTTGAACAAACTCGAACCATGGGAGCTTCCATTGAGGGCGAAAACAGGGGAAAATGAATGGTATTTCTTTTGTGTTAGAGATCGAAAATACCCAACTGGTTTAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

295 aa · LXL04_024119|LXL04_024119|OH1004|PROTEIN

MEHNQGTYDHEDPLELPPGFRFHPTDDELIIHYLYRKVFDDYFESRAIGDVDLNKLEPWELPLRAKTGENEWYFFCVRDRKYPTGLRTNRATEMGYWKATGKDREIYKSKTLVGMKKTLVFYKGRAPKGEKTNWIMHEFRLEGKLALKNLPASAKGEWVISKVFEKSYGGKKVHISGVSSISYSCNEDEFESSKLPPLTESMQEQKPSKEDLIETFNKSIAMMPSMNDNLLGFSNTQMAPNIEYLQYHDPSILMLLIDKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024119
TK1151 IDTkA06G178610
OH-1004 IDLXL04_024119
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024119
位置Chr05:81451393-81452578 (+)
描述Similar to NAC100: NAC domain-containing protein 100
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61430 结合于参与叶绿素分解过程基因的启动子区域，如NYC1、SGR1、SGR2和PAO。 暂无已核实直接文献
At5g07680 含NAC结构域的蛋白79。 暂无已核实直接文献
At5g39610 转录激活因子，可结合靶基因启动子上的特定双部分基序 5'-[ACG][CA]GT[AG](5-6n)[CT]AC[AG]-3'。
The delayed leaf senescence mutants of Arabidopsis, ore1, ore3, and ore9 are tolerant to oxidative stress.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch110
Trifurcate feed-forward regulation of age-dependent cell death involving miR164 in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1126/science.1166386
Forward and reverse genetics to identify genes involved in the age-related resistance response in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1364-3703.2009.00557.x
A gene regulatory network controlled by the NAC transcription factor ANAC092/AtNAC2/ORE1 during salt-promoted senescence.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04151.x
ORS1, an H₂O₂-responsive NAC transcription factor, controls senescence in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq080
NAC transcription factor ORE1 and senescence-induced BIFUNCTIONAL NUCLEASE1 (BFN1) constitute a regulatory cascade in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst012
ORE1 balances leaf senescence against maintenance by antagonizing G2-like-mediated transcription.2013 · DOI: 10.1038/embor.2013.24
At3g29035 转录激活剂，可与特定二分基序 5'-[AG]CGT[AG][AG][CT]ACGCAA-3' 上靶基因启动子中的 DNA 结合。
ORS1, an H₂O₂-responsive NAC transcription factor, controls senescence in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq080
At5g53950 STM 和 KNAT6 转录激活剂。
Shoot apical meristem and cotyledon formation during Arabidopsis embryogenesis: interaction among the CUP-SHAPED COTYLEDON and SHOOT MERISTEMLESS genes.1999 · DOI: 10.1242/dev.126.8.1563
Involvement of CUP-SHAPED COTYLEDON genes in gynoecium and ovule development in Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1093/pcp/41.1.60
Roles of PIN-FORMED1 and MONOPTEROS in pattern formation of the apical region of the Arabidopsis embryo.2002 · DOI: 10.1242/dev.129.17.3965
The CUP-SHAPED COTYLEDON genes promote adventitious shoot formation on calli.2003 · DOI: 10.1093/pcp/pcg038
MicroRNA regulation of NAC-domain targets is required for proper formation and separation of adjacent embryonic, vegetative, and floral organs.2004 · DOI: 10.1016/j.cub.2004.06.022
MicroRNA regulation of the CUC genes is required for boundary size control in Arabidopsis meristems.2004 · DOI: 10.1242/dev.01320
The early extra petals1 mutant uncovers a role for microRNA miR164c in regulating petal number in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1016/j.cub.2005.02.017
KNAT6: an Arabidopsis homeobox gene involved in meristem activity and organ separation.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.041988
The balance between the MIR164A and CUC2 genes controls leaf margin serration in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.045617
Arabidopsis CUP-SHAPED COTYLEDON3 regulates postembryonic shoot meristem and organ boundary formation.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.045716
Plants expressing a miR164-resistant CUC2 gene reveal the importance of post-meristematic maintenance of phyllotaxy in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1242/dev.02774
Redundancy and specialization among plant microRNAs: role of the MIR164 family in developmental robustness.2007 · DOI: 10.1242/dev.02817
Genes involved in organ separation in Arabidopsis: an analysis of the cup-shaped cotyledon mutant.1997 · DOI: 10.1105/tpc.9.6.841

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024119 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010072 primary shoot apical meristem specification 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010223 secondary shoot formation 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G29035
ath:AT5G07680
ath:AT5G39610
ath:AT5G53950
ath:AT5G61430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.958
排名 1 · LXL04_024119 · OH-1004
细胞质0.098
排名 2 · LXL04_024119 · OH-1004
细胞膜0.042
排名 3 · LXL04_024119 · OH-1004
内质网0.033
排名 4 · LXL04_024119 · OH-1004
质体0.016
排名 5 · LXL04_024119 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365.21NAM17-141 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024119PF02365.21NAM171416.7e-48162.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLJ2拟南芥NAC domain-containing protein 10068.159%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FLR3拟南芥NAC domain-containing protein 7966.834%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FKA0拟南芥NAC domain-containing protein 9250.000%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LJW3拟南芥NAC domain-containing protein 5946.273%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O04017拟南芥Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 262.802%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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