基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_022993
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 16658740-16681422
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA12915 bp · LXL04_022993|LXL04_022993|OH1004|cDNA
ATGGCTAAAAGAAGGAGAAATTCTACACAACCATCTTCATCAAGAGGCAATgatgatgctaatgatgatgCTAATGATGCTAATTGGCTGCATAATGACTTCGAAAATCAAGATTACGGCGAAGACGAATTTGTTGATGAAACACCTACGGTTGATGTTATTAGTGACGACTCCGGCGAAGAAAACATCCCAAAACGTAACCCCAAACGTAACCCAAAACGTATCCCAAAACATATCCCGAAGAAAAGAAAACTCGATCA...
CDS
下载 CDS FASTA12915 bp · LXL04_022993|LXL04_022993|OH1004|CDS
ATGGCTAAAAGAAGGAGAAATTCTACACAACCATCTTCATCAAGAGGCAATGATGATGCTAATGATGATGCTAATGATGCTAATTGGCTGCATAATGACTTCGAAAATCAAGATTACGGCGAAGACGAATTTGTTGATGAAACACCTACGGTTGATGTTATTAGTGACGACTCCGGCGAAGAAAACATCCCAAAACGTAACCCCAAACGTAACCCAAAACGTATCCCAAAACATATCCCGAAGAAAAGAAAACTCGATCA...
4304 aa · LXL04_022993|LXL04_022993|OH1004|PROTEIN
MAKRRRNSTQPSSSRGNDDANDDANDANWLHNDFENQDYGEDEFVDETPTVDVISDDSGEENIPKRNPKRNPKRIPKHIPKKRKLDQAELRKRINPARRGEGKGHAPCWVAFDTQWIREEDGVEKKYGESNPENQQSDDDKQSKLSFKKDPSGEGHVYTWKHDEVRIAKAILGIFTIGELPFKWLENEACIELVNALNGRVILPSRHTASRNVAQLYLDERSKLLKHLSNPNTAVHLTTDTWTSPCQRKNYMVVTAHFID...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_022993 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_022993 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:16658740-16681422 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to Putative AC transposase | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。 水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006310 DNA recombination 生物过程 GO:0032196 transposition 生物过程 GO:0003677 DNA binding 分子功能 GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | 暂无功能描述 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.786
细胞质0.355
线粒体0.045
细胞膜0.026
细胞外0.025
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF27041.1ZBED1_RNase-like238-321 aaPF27039.1ZBED1_RNase-like_helical333-429 aaPF14372.13hAT-like_RNase-H469-560 aaPF05699.20Dimer_Tnp_hAT617-698 aaPF27041.1ZBED1_RNase-like1035-1118 aaPF27039.1ZBED1_RNase-like_helical1130-1226 aaPF14372.13hAT-like_RNase-H1266-1357 aaPF05699.20Dimer_Tnp_hAT1414-1495 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_022993 | PF27041.1 | ZBED1_RNase-like | 238 | 321 | 1.2e-95 | 314.6 |
| LXL04_022993 | PF27039.1 | ZBED1_RNase-like_helical | 333 | 429 | 8.6e-105 | 345.4 |
| LXL04_022993 | PF14372.13 | hAT-like_RNase-H | 469 | 560 | 2.6e-56 | 188.5 |
| LXL04_022993 | PF05699.20 | Dimer_Tnp_hAT | 617 | 698 | 5e-139 | 453.2 |
| LXL04_022993 | PF27041.1 | ZBED1_RNase-like | 1035 | 1118 | 1.2e-95 | 314.6 |
| LXL04_022993 | PF27039.1 | ZBED1_RNase-like_helical | 1130 | 1226 | 8.6e-105 | 345.4 |
| LXL04_022993 | PF14372.13 | hAT-like_RNase-H | 1266 | 1357 | 2.6e-56 | 188.5 |
| LXL04_022993 | PF05699.20 | Dimer_Tnp_hAT | 1414 | 1495 | 5e-139 | 453.2 |
| LXL04_022993 | PF27041.1 | ZBED1_RNase-like | 1860 | 1943 | 1.2e-95 | 314.6 |
| LXL04_022993 | PF27039.1 | ZBED1_RNase-like_helical | 1955 | 2051 | 8.6e-105 | 345.4 |
| LXL04_022993 | PF14372.13 | hAT-like_RNase-H | 2091 | 2182 | 2.6e-56 | 188.5 |
| LXL04_022993 | PF05699.20 | Dimer_Tnp_hAT | 2239 | 2320 | 5e-139 | 453.2 |
| LXL04_022993 | PF27041.1 | ZBED1_RNase-like | 2700 | 2783 | 1.2e-95 | 314.6 |
| LXL04_022993 | PF27039.1 | ZBED1_RNase-like_helical | 2795 | 2891 | 8.6e-105 | 345.4 |
| LXL04_022993 | PF14372.13 | hAT-like_RNase-H | 2931 | 3022 | 2.6e-56 | 188.5 |
| LXL04_022993 | PF05699.20 | Dimer_Tnp_hAT | 3079 | 3160 | 5e-139 | 453.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。