LXL04_018560 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_018560

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 14668298-14670886 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1086 bp · LXL04_018560|LXL04_018560|OH1004|cDNA

ATGAAAGACGCTCACGACCAAATCTTTTCATCGCACAAATTGCTGTCAATGGAAGCTCAAGTGGGGATGTCTAGTCACGGCGGAGTCGTGGAGGGCCCTACCGCGGTGAAGTTTTTACAAAAGCAGCAGACGGTGGCGCCGTCTCCTTCCCCACGTCAACACCAACATCAGCAGTCAGCGGAGATAGGCACGGTACCACAGCTTCTAGCTGGCGGTATTGCTGGTGCTTTTAGCAAAACATGCACGGCTCCACTCGCACG...

CDS

下载 CDS FASTA

1086 bp · LXL04_018560|LXL04_018560|OH1004|CDS

ATGAAAGACGCTCACGACCAAATCTTTTCATCGCACAAATTGCTGTCAATGGAAGCTCAAGTGGGGATGTCTAGTCACGGCGGAGTCGTGGAGGGCCCTACCGCGGTGAAGTTTTTACAAAAGCAGCAGACGGTGGCGCCGTCTCCTTCCCCACGTCAACACCAACATCAGCAGTCAGCGGAGATAGGCACGGTACCACAGCTTCTAGCTGGCGGTATTGCTGGTGCTTTTAGCAAAACATGCACGGCTCCACTCGCACG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

361 aa · LXL04_018560|LXL04_018560|OH1004|PROTEIN

MKDAHDQIFSSHKLLSMEAQVGMSSHGGVVEGPTAVKFLQKQQTVAPSPSPRQHQHQQSAEIGTVPQLLAGGIAGAFSKTCTAPLARLTILFQVQGMHSEVALLTRPCIWNEALRIANEEGFRAFWKGNLVTIAHRLPYTAVNFYAYEQFKKLLKSVPRIGNNSESAAAEACVHFVGGGMSGITAAMATYPLDLVRTRLAAQRSTIYYHGIGHALRTIIRDEGCIGLYKGLGATLLGVGPSIAISFSVYEMLRSNWKLHR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018560`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018560

位置 Chr04:14668298-14670886 (-)

描述 Similar to mcfB: Mitochondrial substrate carrier family protein B

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g01100`	线粒体腺苷酸载体，通过线粒体内膜的反交换机制特异性催化 ATP、ADP 和 AMP 的运输。	Identification and characterization of ADNT1, a novel mitochondrial adenine nucleotide transporter from Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.130310

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018560 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程

GO:0015866 ADP transport 生物过程

GO:0015867 ATP transport 生物过程

GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程

GO:0051503 adenine nucleotide transport 生物过程

GO:0071277 cellular response to calcium ion 生物过程

GO:1990544 mitochondrial ATP transmembrane transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0000295 adenine nucleotide transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0005347 ATP transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ddi:DDB_G0285599

hsa:29957

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.889

排名 1 · LXL04_018560 · OH-1004

细胞质0.050

排名 2 · LXL04_018560 · OH-1004

细胞核0.032

排名 3 · LXL04_018560 · OH-1004

质体0.030

排名 4 · LXL04_018560 · OH-1004

细胞膜0.023

排名 5 · LXL04_018560 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00153.33Mito_carr64-155 aa

PF00153.33Mito_carr172-256 aa

PF00153.33Mito_carr264-358 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018560	`PF00153.33`	Mito_carr	64	155	1.3e-73	243.5
LXL04_018560	`PF00153.33`	Mito_carr	172	256	1.3e-73	243.5
LXL04_018560	`PF00153.33`	Mito_carr	264	358	1.3e-73	243.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O04619`	拟南芥	Mitochondrial adenine nucleotide transporter ADNT1	37.338%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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