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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

LXL04_004607
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 141437501-141438304 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

780 bp · LXL04_004607|LXL04_004607|OH1004|cDNA

ATGCTCGATCAAACACAAACCAGAGCTCCATTCGTCGTCACTCTCACCATCCTCTGCACTGAATTGTTTCAAATCGAAGAAACTGGAAGAGGCGTACTGGTATACCTCAGAGGACACGAAGGTCGAGGCATCGGATTAGGGCATCTATTGATCAGTGAATTTGAAGCTTTAAATTCAAATTGTTTGTTGTGTATATCCCCTTCCCGGCACCATATCCTTTCATTTGTCAGCGATGGACGCCTGGTTCGTCGTCATCGTCT...

780 bp · LXL04_004607|LXL04_004607|OH1004|CDS

ATGCTCGATCAAACACAAACCAGAGCTCCATTCGTCGTCACTCTCACCATCCTCTGCACTGAATTGTTTCAAATCGAAGAAACTGGAAGAGGCGTACTGGTATACCTCAGAGGACACGAAGGTCGAGGCATCGGATTAGGGCATCTATTGATCAGTGAATTTGAAGCTTTAAATTCAAATTGTTTGTTGTGTATATCCCCTTCCCGGCACCATATCCTTTCATTTGTCAGCGATGGACGCCTGGTTCGTCGTCATCGTCT...

259 aa · LXL04_004607|LXL04_004607|OH1004|PROTEIN

MLDQTQTRAPFVVTLTILCTELFQIEETGRGVLVYLRGHEGRGIGLGHLLISEFEALNSNCLLCISPSRHHILSFVSDGRLVRRHRLPLRRRPPQIIRTISTASYGPTWRLFRRNLASEILHPARKWVLQILLGRLQEQKEDAGIKVIDHFTYAMLCLLVLMCFGEKLDEHQINEISRVQREMLFRNRLKEFEQLHENREDVLIPLIQSRIEATKSKPQFEDDRIVVYVDTLVNLQLPEEDGNNENGGKLTDKEMIWGF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_004607
TK1151 IDTkA01G130870
OH-1004 IDLXL04_004607
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 40.541
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_004607
位置Chr01:141437501-141438304 (-)
描述Similar to CYP89A2: Cytochrome P450 89A2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g64900 细胞色素 P450 89A2。 暂无已核实直接文献
At3g03470 通过非极性初级荧光叶绿素分解代谢物 脱羰作用参与叶绿素分解。
At5g04660 体外催化生理性不饱和脂肪酸的环氧化。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004607 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程
GO:0019395 fatty acid oxidation 生物过程
GO:0033310 chlorophyll a catabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003958 NADPH-hemoprotein reductase activity 分子功能
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64900
ath:AT3G03470
ath:AT5G04660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

内质网0.376
排名 1 · LXL04_004607 · OH-1004
细胞质0.312
排名 2 · LXL04_004607 · OH-1004
细胞核0.214
排名 3 · LXL04_004607 · OH-1004
线粒体0.077
排名 4 · LXL04_004607 · OH-1004
细胞膜0.066
排名 5 · LXL04_004607 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42602拟南芥Cytochrome P450 89A241.489%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SRQ1拟南芥Cytochrome P450 89A935.484%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LZ31拟南芥Cytochrome P450 77A423.494%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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