橡胶生物合成专题

围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。

本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。

当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258

下载当前筛选候选基因 TSV

跨物种研究参考

此处的 1 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。

1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。

2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。

3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。

杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。

1杜仲点击查看 · 1 个来源 · trans-1,4-polyisoprene

下载当前跨物种参考 TSV

物种与材料	参考基因/序列 ID	通路步骤	证据与边界	来源
杜仲Eucommia ulmoidestrans-1,4-polyisopreneTransgenic roots	`EuIPI`AB041629.2IDI	异戊二烯供体杜仲胶前体供给参考	A_direct_genetic_experiment EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。 Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions.	10.1186/1472-6750-12-78Overexpression of EuIPI increases trans-polyisoprene accumulation

杜仲 · EuIPI

序列 IDAB041629.2

步骤异戊二烯供体 · IDI

证据EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。

边界Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions.

来源10.1186/1472-6750-12-78

通路导航与候选分布

MVA · MVA 甲羟戊酸途径

High 40 · Medium 3 · Low 4 MEP · MEP 非甲羟戊酸途径

High 23 · Medium 0 · Low 36 IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体

271

High 141 · Medium 83 · Low 47 CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶

High 0 · Medium 0 · Low 5 REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白

High 0 · Medium 0 · Low 7 Rubber · 橡胶生物合成

288

High 1 · Medium 287 · Low 0 Terpenoid · 萜类代谢

380

High 72 · Medium 107 · Low 201 Latex/root · 乳胶/根相关候选

4466

High 231 · Medium 1284 · Low 2951

377 MVA/MEP 与异戊二烯

点击筛选 · High 204 · Medium 86 · Low 87 4466 乳胶/根相关候选

点击筛选 · High 231 · Medium 1284 · Low 2951 300 橡胶生物合成

点击筛选 · High 1 · Medium 287 · Low 12 380 萜类代谢

点击筛选 · High 72 · Medium 107 · Low 201

候选基因表

当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 60/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。

基因 ID	通路/步骤	等级	证据层	位置	关键证据	操作
`TkA01G076710` TK1151: TkA01G076710 OH-1004: LXL04_005198	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:157614920-157616823 -	GO:0016740	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G073300` TK1151: TkA01G073300;TkA03G097210 OH-1004: LXL04_005248	萜类代谢萜类代谢	中等置信分数 6	功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:158888329-158892117 +	go:0010436 carotenoid dioxygenase activity 分子功能	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA03G042580` TK1151: TkA03G042580 OH-1004: LXL04_005268	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:159322606-159327435 +	go:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G061130` TK1151: TkA01G061130 OH-1004: LXL04_005365	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:161767099-161769144 +	go:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G048970` TK1151: TkA01G048970 OH-1004: LXL04_005447	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:164261593-164262553 -	go:0006970 response to osmotic stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA03G453190` TK1151: TkA03G453190 OH-1004: LXL04_005456	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:164549986-164552593 +	go:0010311 lateral root formation 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G043610` TK1151: TkA01G043610;TkA03G526010;TkA08G073090 OH-1004: LXL04_005481	萜类代谢萜类代谢	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:165126249-165126932 -	GO:0006720	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G016400` TK1151: TkA01G016400 OH-1004: LXL04_005800	MVA/MEP 与异戊二烯异戊二烯供体	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:173577927-173579741 -	GO:0016114	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G016400` TK1151: TkA01G016400 OH-1004: LXL04_005800	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:173577927-173579741 -	GO:0016114	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G004350` TK1151: TkA01G004350;TkA03G421100;TkA03G421120;TkA04G040120;TkA04G043700 OH-1004: LXL04_005959	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:176367527-176372388 -	GO:0016740	基因详情表达蛋白组 JBrowse