短角蒲公英 · TbCPT1
序列 IDJQ991925.1
步骤CPT/CPTL · CPT
证据TbCPT1为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
边界External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.
橡胶生物合成专题
围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。
本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。
当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。
跨物种研究参考
此处的 8 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。
1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。
2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。
3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。
杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。
| 物种与材料 | 参考基因/序列 ID | 通路步骤 | 证据与边界 | 来源 |
|---|---|---|---|---|
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRNAi laticifers with polymer and particle assays | TbCPT1JQ991925.1CPT | CPT/CPTL乳管特异顺式异戊二烯基转移酶 | A_direct_experiment TbCPT1为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。 External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz. | 10.1104/pp.111.187880Laticifer-specific cis-prenyltransferase silencing affects natural rubber biosynthesis in Taraxacum brevicorniculatum |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRNAi laticifers with polymer and particle assays | TbCPT2JQ991926.1CPT | CPT/CPTL乳管特异顺式异戊二烯基转移酶 | A_direct_experiment TbCPT2为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。 External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz. | 10.1104/pp.111.187880Laticifer-specific cis-prenyltransferase silencing affects natural rubber biosynthesis in Taraxacum brevicorniculatum |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRNAi laticifers with polymer and particle assays | TbCPT3JQ991927.1CPT | CPT/CPTL乳管特异顺式异戊二烯基转移酶 | A_direct_experiment TbCPT3为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。 External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz. | 10.1104/pp.111.187880Laticifer-specific cis-prenyltransferase silencing affects natural rubber biosynthesis in Taraxacum brevicorniculatum |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRubber-particle extraction and heterologous assays | TbSRPP1JQ991928.1SRPP | REF/SRPP 橡胶颗粒小橡胶粒子蛋白 | A_direct_experiment TbSRPP1为橡胶颗粒形成相关的直接实验参考。 External particle-protein evidence, not direct validation in T. kok-saghyz. | 10.1111/tpj.13829Small rubber particle proteins from Taraxacum brevicorniculatum are associated with rubber particle formation |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA records | TbRTAKP763637.1RTA | 乳胶/根相关橡胶转移酶激活因子参考 | B_sequence_resource 序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。 单条序列记录本身不是功能证明。 | KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA records | TbFDPS1KJ911908.1FDPS | 异戊二烯供体异戊二烯供体合成参考 | B_sequence_resource 序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。 单条序列记录本身不是功能证明。 | KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA records | TbFDPS2KJ911910.1FDPS | 异戊二烯供体异戊二烯供体合成参考 | B_sequence_resource 序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。 单条序列记录本身不是功能证明。 | KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records |
| 短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA records | TbREFMF471639.1REF | REF/SRPP 橡胶颗粒橡胶粒子蛋白参考 | B_sequence_resource 序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。 单条序列记录本身不是功能证明。 | KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records |
短角蒲公英 · TbCPT1
短角蒲公英 · TbCPT2
短角蒲公英 · TbCPT3
短角蒲公英 · TbSRPP1
短角蒲公英 · TbRTA
短角蒲公英 · TbFDPS1
短角蒲公英 · TbFDPS2
短角蒲公英 · TbREF
通路导航与候选分布
MVA · MVA 甲羟戊酸途径
47
High 40 · Medium 3 · Low 4
MEP · MEP 非甲羟戊酸途径
59
High 23 · Medium 0 · Low 36
IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体
271
High 141 · Medium 83 · Low 47
CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶
5
High 0 · Medium 0 · Low 5
REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白
7
High 0 · Medium 0 · Low 7
Rubber · 橡胶生物合成
288
High 1 · Medium 287 · Low 0
Terpenoid · 萜类代谢
380
High 72 · Medium 107 · Low 201
Latex/root · 乳胶/根相关候选
4466
High 231 · Medium 1284 · Low 2951
候选基因表
当前筛选共 300 条候选，每页显示 10 条；当前为第 30/30 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。
| 基因 ID | 通路/步骤 | 等级 | 证据层 | 位置 | 关键证据 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
LXL04_007103TK1151: - OH-1004: LXL04_007103 |
橡胶生物合成 橡胶颗粒相关蛋白 |
低置信 分数 2 |
功能注释表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104800.1:36284675-36285673 - |
lxl04_007103 similar to at3g05500: ref/srpp-like protein at3g05500 (arabidopsis thaliana ox=3702) | |
LXL04_008538TK1151: - OH-1004: LXL04_008538 |
橡胶生物合成 顺式异戊二烯转移酶 |
低置信 分数 2 |
功能注释表达定位PfamSwiss-Prot共表达 | CM104800.1:102148073-102150399 - |
lxl04_008538 similar to cpt1: coleoptile phototropism protein 1 (oryza sativa subsp. japonica ox=39947) | |
LXL04_013139TK1151: - OH-1004: LXL04_013139 |
橡胶生物合成 顺式异戊二烯转移酶 |
低置信 分数 2 |
GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达 | CM104801.1:24689434-24689868 + |
go:0050267 rubber cis-polyprenylcistransferase activity 分子功能 | |
TkA02G466190TK1151: TkA02G466190;TkA02G466270 OH-1004: LXL04_013887 |
橡胶生物合成 顺式异戊二烯转移酶 |
低置信 分数 2 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104801.1:37511054-37514799 - |
go:0050267 rubber cis-polyprenylcistransferase activity 分子功能 | |
TkA05G048860TK1151: TkA05G048860 OH-1004: LXL04_019393 |
橡胶生物合成 顺式异戊二烯转移酶 |
低置信 分数 2 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104802.1:30311697-30312670 + |
go:0050267 rubber cis-polyprenylcistransferase activity 分子功能 | |
TkA02G514830TK1151: TkA02G514830;TkA05G057980 OH-1004: LXL04_019522 |
橡胶生物合成 顺式异戊二烯转移酶 |
低置信 分数 2 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104802.1:32936688-32939074 + |
go:0050267 rubber cis-polyprenylcistransferase activity 分子功能 | |
TkA05G282200TK1151: TkA05G282200 OH-1004: LXL04_020647 |
橡胶生物合成 橡胶颗粒相关蛋白 |
低置信 分数 2 |
功能注释表达定位PfamSwiss-Prot共表达 | CM104802.1:101203355-101204845 + |
lxl04_020647 similar to at1g67360: ref/srpp-like protein at1g67360 (arabidopsis thaliana ox=3702) | |
TkA04G476990TK1151: TkA04G476990 OH-1004: LXL04_038913 |
橡胶生物合成 橡胶颗粒相关蛋白 |
低置信 分数 2 |
功能注释表达定位PfamSwiss-Prot共表达 | CM104807.1:53163010-53164253 - |
lxl04_038913 similar to at3g05500: ref/srpp-like protein at3g05500 (arabidopsis thaliana ox=3702) | |
TkA04G478030TK1151: TkA04G478030;TkA04G487760 OH-1004: LXL04_038922 |
橡胶生物合成 橡胶颗粒相关蛋白 |
低置信 分数 2 |
功能注释表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104807.1:53378436-53379778 - |
lxl04_038922 similar to at3g05500: ref/srpp-like protein at3g05500 (arabidopsis thaliana ox=3702) | |
LXL04_038923TK1151: - OH-1004: LXL04_038923 |
橡胶生物合成 橡胶颗粒相关蛋白 |
低置信 分数 2 |
功能注释表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104807.1:53405450-53406671 - |
lxl04_038923 similar to at3g05500: ref/srpp-like protein at3g05500 (arabidopsis thaliana ox=3702) |
证据边界
当前结果来自注释、GO/KEGG、同源、预测定位、结构域、表达/蛋白组和网络数据库的整合候选证据。High/Medium/Low 表示数据库证据密度和一致性，不代表已经完成湿实验验证；乳胶/根相关集合是候选背景，不应直接解读为橡胶生物合成酶。