杜仲 · EuIPI
序列 IDAB041629.2
步骤异戊二烯供体 · IDI
证据EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。
边界Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions.
橡胶生物合成专题
围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。
本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。
当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。
跨物种研究参考
此处的 1 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。
1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。
2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。
3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。
杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。
| 物种与材料 | 参考基因/序列 ID | 通路步骤 | 证据与边界 | 来源 |
|---|---|---|---|---|
| 杜仲Eucommia ulmoidestrans-1,4-polyisopreneTransgenic roots | EuIPIAB041629.2IDI | 异戊二烯供体杜仲胶前体供给参考 | A_direct_genetic_experiment EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。 Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions. | 10.1186/1472-6750-12-78Overexpression of EuIPI increases trans-polyisoprene accumulation |
杜仲 · EuIPI
通路导航与候选分布
MVA · MVA 甲羟戊酸途径
47
High 40 · Medium 3 · Low 4
MEP · MEP 非甲羟戊酸途径
59
High 23 · Medium 0 · Low 36
IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体
271
High 141 · Medium 83 · Low 47
CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶
5
High 0 · Medium 0 · Low 5
REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白
7
High 0 · Medium 0 · Low 7
Rubber · 橡胶生物合成
288
High 1 · Medium 287 · Low 0
Terpenoid · 萜类代谢
380
High 72 · Medium 107 · Low 201
Latex/root · 乳胶/根相关候选
4466
High 231 · Medium 1284 · Low 2951
候选基因表
当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 120/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。
| 基因 ID | 通路/步骤 | 等级 | 证据层 | 位置 | 关键证据 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
LXL04_001434TK1151: - OH-1004: LXL04_001434 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位PfamSwiss-Prot | CM104799.1:26698903-26701656 - |
go:0009611 response to wounding 生物过程 | |
TkA01G535530TK1151: TkA01G535530 OH-1004: LXL04_001435 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位Swiss-Prot | CM104799.1:26748937-26751552 - |
go:0009611 response to wounding 生物过程 | |
TkA01G535520TK1151: TkA01G535520 OH-1004: LXL04_001436 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:26752384-26754375 + |
go:0004659 prenyltransferase activity 分子功能 | |
TkA01G534590TK1151: TkA01G534590 OH-1004: LXL04_001446 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:27019487-27023786 + |
go:0080022 primary root development 生物过程 | |
TkA01G534320TK1151: TkA01G534320;TkA03G412050;TkA03G434240;TkA04G385280;TkA05G332640 OH-1004: LXL04_001448 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:27075069-27085311 + |
go:0009651 response to salt stress 生物过程 | |
TkA01G533320TK1151: TkA01G533320;TkA01G533360;TkA07G392350 OH-1004: LXL04_001469 |
萜类代谢 萜类代谢 |
中等置信 分数 4 |
功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:27318309-27321893 - |
go:0004506 squalene monooxygenase activity 分子功能 | |
TkA01G520790TK1151: TkA01G520790 OH-1004: LXL04_001636 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:30685933-30688335 + |
go:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分 | |
TkA01G518570TK1151: TkA01G518570 OH-1004: LXL04_001691 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位Swiss-Prot共表达 | CM104799.1:31408294-31409771 + |
go:0004659 prenyltransferase activity 分子功能 | |
LXL04_001694TK1151: - OH-1004: LXL04_001694 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:31470361-31482256 - |
go:0006979 response to oxidative stress 生物过程 | |
TkA01G515090TK1151: TkA01G515090 OH-1004: LXL04_001750 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
中等置信 分数 4 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:32497783-32499106 + |
go:0006970 response to osmotic stress 生物过程 |
证据边界
当前结果来自注释、GO/KEGG、同源、预测定位、结构域、表达/蛋白组和网络数据库的整合候选证据。High/Medium/Low 表示数据库证据密度和一致性，不代表已经完成湿实验验证；乳胶/根相关集合是候选背景，不应直接解读为橡胶生物合成酶。