橡胶生物合成专题

围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。

本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。

当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258

下载当前筛选候选基因 TSV

跨物种研究参考

此处的 1 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。

1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。

2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。

3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。

杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。

1杜仲点击查看 · 1 个来源 · trans-1,4-polyisoprene

下载当前跨物种参考 TSV

物种与材料	参考基因/序列 ID	通路步骤	证据与边界	来源
杜仲Eucommia ulmoidestrans-1,4-polyisopreneTransgenic roots	`EuIPI`AB041629.2IDI	异戊二烯供体杜仲胶前体供给参考	A_direct_genetic_experiment EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。 Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions.	10.1186/1472-6750-12-78Overexpression of EuIPI increases trans-polyisoprene accumulation

杜仲 · EuIPI

序列 IDAB041629.2

步骤异戊二烯供体 · IDI

证据EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。

边界Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions.

来源10.1186/1472-6750-12-78

通路导航与候选分布

MVA · MVA 甲羟戊酸途径

High 40 · Medium 3 · Low 4 MEP · MEP 非甲羟戊酸途径

High 23 · Medium 0 · Low 36 IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体

271

High 141 · Medium 83 · Low 47 CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶

High 0 · Medium 0 · Low 5 REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白

High 0 · Medium 0 · Low 7 Rubber · 橡胶生物合成

288

High 1 · Medium 287 · Low 0 Terpenoid · 萜类代谢

380

High 72 · Medium 107 · Low 201 Latex/root · 乳胶/根相关候选

4466

High 231 · Medium 1284 · Low 2951

377 MVA/MEP 与异戊二烯

点击筛选 · High 204 · Medium 86 · Low 87 4466 乳胶/根相关候选

点击筛选 · High 231 · Medium 1284 · Low 2951 300 橡胶生物合成

点击筛选 · High 1 · Medium 287 · Low 12 380 萜类代谢

点击筛选 · High 72 · Medium 107 · Low 201

候选基因表

当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 31/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。

基因 ID	通路/步骤	等级	证据层	位置	关键证据	操作
`TkA02G487080` TK1151: TkA02G487080 OH-1004: LXL04_013579	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位Swiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:32066132-32068071 +	go:0010311 lateral root formation 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G466600` TK1151: TkA02G466600 OH-1004: LXL04_013883	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:37390928-37394035 +	go:0009611 response to wounding 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G465740` TK1151: TkA02G465740 OH-1004: LXL04_013897	MVA/MEP 与异戊二烯异戊二烯供体	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:37655768-37658163 +	go:0004663 rab geranylgeranyltransferase activity 分子功能	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G271310` TK1151: TkA02G271310;TkA02G273690;TkA02G447740;TkA05G055900 OH-1004: LXL04_014203	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:43617682-43619090 +	go:0009611 response to wounding 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G447450` TK1151: TkA02G447450 OH-1004: LXL04_014210	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:43688792-43692934 -	go:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`LXL04_014538` TK1151: - OH-1004: LXL04_014538	MVA/MEP 与异戊二烯异戊二烯供体	高置信分数 8	GO表达定位Swiss-Prot	CM104801.1:51953503-51954015 -	GO:0016114	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkAUNG067090` TK1151: TkAUNG067090;TkA02G412780 OH-1004: LXL04_014563	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:52555152-52555952 -	go:0006970 response to osmotic stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G380070` TK1151: TkA02G380070 OH-1004: LXL04_014975	MVA/MEP 与异戊二烯异戊二烯供体	高置信分数 8	功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104801.1:60671970-60675023 +	go:0004452 isopentenyl-diphosphate delta-isomerase activity 分子功能	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkAUNG003600` TK1151: TkAUNG003600;TkA02G312130 OH-1004: LXL04_015585	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104801.1:76845639-76852238 +	go:0006979 response to oxidative stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkAUNG003650` TK1151: TkAUNG003650;TkA04G394970 OH-1004: LXL04_015587	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104801.1:76879897-76884579 +	go:0006979 response to oxidative stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse