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橡胶生物合成专题

围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。

本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。

当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258
示例 TkA01G624900LXL04_000258
下载当前筛选候选基因 TSV

跨物种研究参考

此处的 8 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。

1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。
2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。
3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。
杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。
8短角蒲公英点击查看 · 3 个来源 · cis-1,4-polyisoprene
下载当前跨物种参考 TSV
物种与材料参考基因/序列 ID通路步骤证据与边界来源
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRNAi laticifers with polymer and particle assaysTbCPT1JQ991925.1CPTCPT/CPTL乳管特异顺式异戊二烯基转移酶A_direct_experiment
TbCPT1为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.		10.1104/pp.111.187880Laticifer-specific cis-prenyltransferase silencing affects natural rubber biosynthesis in Taraxacum brevicorniculatum
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRNAi laticifers with polymer and particle assaysTbCPT2JQ991926.1CPTCPT/CPTL乳管特异顺式异戊二烯基转移酶A_direct_experiment
TbCPT2为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.		10.1104/pp.111.187880Laticifer-specific cis-prenyltransferase silencing affects natural rubber biosynthesis in Taraxacum brevicorniculatum
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRNAi laticifers with polymer and particle assaysTbCPT3JQ991927.1CPTCPT/CPTL乳管特异顺式异戊二烯基转移酶A_direct_experiment
TbCPT3为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.		10.1104/pp.111.187880Laticifer-specific cis-prenyltransferase silencing affects natural rubber biosynthesis in Taraxacum brevicorniculatum
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisopreneRubber-particle extraction and heterologous assaysTbSRPP1JQ991928.1SRPPREF/SRPP 橡胶颗粒小橡胶粒子蛋白A_direct_experiment
TbSRPP1为橡胶颗粒形成相关的直接实验参考。
External particle-protein evidence, not direct validation in T. kok-saghyz.		10.1111/tpj.13829Small rubber particle proteins from Taraxacum brevicorniculatum are associated with rubber particle formation
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA recordsTbRTAKP763637.1RTA乳胶/根相关橡胶转移酶激活因子参考B_sequence_resource
序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
单条序列记录本身不是功能证明。		KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA recordsTbFDPS1KJ911908.1FDPS异戊二烯供体异戊二烯供体合成参考B_sequence_resource
序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
单条序列记录本身不是功能证明。		KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA recordsTbFDPS2KJ911910.1FDPS异戊二烯供体异戊二烯供体合成参考B_sequence_resource
序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
单条序列记录本身不是功能证明。		KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records
短角蒲公英Taraxacum brevicorniculatumcis-1,4-polyisoprenePublic cDNA recordsTbREFMF471639.1REFREF/SRPP 橡胶颗粒橡胶粒子蛋白参考B_sequence_resource
序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
单条序列记录本身不是功能证明。		KP763637.1;MF471639.1;KJ911908.1;KJ911910.1Taraxacum brevicorniculatum rubber pathway sequence records

短角蒲公英 · TbCPT1

序列 IDJQ991925.1
步骤CPT/CPTL · CPT
证据TbCPT1为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
边界External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.

短角蒲公英 · TbCPT2

序列 IDJQ991926.1
步骤CPT/CPTL · CPT
证据TbCPT2为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
边界External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.

短角蒲公英 · TbCPT3

序列 IDJQ991927.1
步骤CPT/CPTL · CPT
证据TbCPT3为近缘蒲公英乳管特异顺式橡胶合成直接实验参考。
边界External evidence in T. brevicorniculatum, not direct validation in T. kok-saghyz.

短角蒲公英 · TbSRPP1

序列 IDJQ991928.1
步骤REF/SRPP 橡胶颗粒 · SRPP
证据TbSRPP1为橡胶颗粒形成相关的直接实验参考。
边界External particle-protein evidence, not direct validation in T. kok-saghyz.

短角蒲公英 · TbRTA

序列 IDKP763637.1
步骤乳胶/根相关 · RTA
证据序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
边界单条序列记录本身不是功能证明。

短角蒲公英 · TbFDPS1

序列 IDKJ911908.1
步骤异戊二烯供体 · FDPS
证据序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
边界单条序列记录本身不是功能证明。

短角蒲公英 · TbFDPS2

序列 IDKJ911910.1
步骤异戊二烯供体 · FDPS
证据序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
边界单条序列记录本身不是功能证明。

短角蒲公英 · TbREF

序列 IDMF471639.1
步骤REF/SRPP 橡胶颗粒 · REF
证据序列记录支持精确 ID 查询和后续同源比对，但不能单独证明功能。
边界单条序列记录本身不是功能证明。

通路导航与候选分布

MVA · MVA 甲羟戊酸途径
47
High 40 · Medium 3 · Low 4 MEP · MEP 非甲羟戊酸途径
59
High 23 · Medium 0 · Low 36 IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体
271
High 141 · Medium 83 · Low 47 CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶
5
High 0 · Medium 0 · Low 5 REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白
7
High 0 · Medium 0 · Low 7 Rubber · 橡胶生物合成
288
High 1 · Medium 287 · Low 0 Terpenoid · 萜类代谢
380
High 72 · Medium 107 · Low 201 Latex/root · 乳胶/根相关候选
4466
High 231 · Medium 1284 · Low 2951
377 MVA/MEP 与异戊二烯
点击筛选 · High 204 · Medium 86 · Low 87 4466 乳胶/根相关候选
点击筛选 · High 231 · Medium 1284 · Low 2951 300 橡胶生物合成
点击筛选 · High 1 · Medium 287 · Low 12 380 萜类代谢
点击筛选 · High 72 · Medium 107 · Low 201

候选基因表

当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 3/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。

基因 ID通路/步骤等级证据层位置关键证据操作
TkA01G096550
TK1151: TkA01G096550;TkA03G456750;TkA06G444790;TkA07G080470;TkA07G081160
OH-1004: LXL04_027626		 萜类代谢
萜类代谢		 高置信
分数 20		 GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达 CM104804.1:20642652-20645944
+		 GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse
TkA07G425430
TK1151: TkA07G425430
OH-1004: LXL04_030713		 MVA/MEP 与异戊二烯
MEP 非甲羟戊酸途径		 高置信
分数 20		 功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 CM104804.1:121251815-121254315
+		 GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse
LXL04_034585
TK1151: -
OH-1004: LXL04_034585		 萜类代谢
萜类代谢		 高置信
分数 20		 GO表达定位Swiss-Prot CM104805.1:108323232-108323511
+		 GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse
LXL04_037620
TK1151: -
OH-1004: LXL04_037620		 MVA/MEP 与异戊二烯
MEP 非甲羟戊酸途径		 高置信
分数 20		 功能注释GO表达定位Swiss-Prot CM104807.1:16327381-16327879
-		 GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse
TkA03G471060
TK1151: TkA03G471060
OH-1004: LXL04_009775		 萜类代谢
萜类代谢		 高置信
分数 18		 功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达 CM104800.1:133158566-133162047
+		 GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse
TkA02G535660
TK1151: TkA02G535660
OH-1004: LXL04_012842		 MVA/MEP 与异戊二烯
MVA 甲羟戊酸途径		 高置信
分数 18		 功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 CM104801.1:19628006-19630012
+		 GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse
TkA02G448690
TK1151: TkA02G448690
OH-1004: LXL04_014183		 MVA/MEP 与异戊二烯
MVA 甲羟戊酸途径		 高置信
分数 18		 功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 CM104801.1:43288238-43290024
+		 GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse
TkAUNG090180
TK1151: TkAUNG090180;TkA02G276590;TkA02G276600;TkA06G031130
OH-1004: LXL04_026028		 萜类代谢
萜类代谢		 高置信
分数 18		 GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达 CM104803.1:119913581-119918492
-		 GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse
LXL04_028189
TK1151: -
OH-1004: LXL04_028189		 MVA/MEP 与异戊二烯
MVA 甲羟戊酸途径		 高置信
分数 18		 GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 CM104804.1:33787973-33788663
-		 GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse
LXL04_028191
TK1151: -
OH-1004: LXL04_028191		 MVA/MEP 与异戊二烯
MVA 甲羟戊酸途径		 高置信
分数 18		 GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 CM104804.1:33794453-33797605
-		 GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

TkA01G096550

萜类代谢萜类代谢高置信 · 分数 20
统一 IDTkA01G096550;TkA03G456750;TkA06G444790;TkA07G080470;TkA07G081160
位置CM104804.1:20642652-20645944 +
证据层GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达
关键证据GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse

TkA07G425430

MVA/MEP 与异戊二烯MEP 非甲羟戊酸途径高置信 · 分数 20
统一 IDTkA07G425430
位置CM104804.1:121251815-121254315 +
证据层功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达
关键证据GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

LXL04_034585

萜类代谢萜类代谢高置信 · 分数 20
统一 ID-
位置CM104805.1:108323232-108323511 +
证据层GO表达定位Swiss-Prot
关键证据GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse

LXL04_037620

MVA/MEP 与异戊二烯MEP 非甲羟戊酸途径高置信 · 分数 20
统一 ID-
位置CM104807.1:16327381-16327879 -
证据层功能注释GO表达定位Swiss-Prot
关键证据GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

TkA03G471060

萜类代谢萜类代谢高置信 · 分数 18
统一 IDTkA03G471060
位置CM104800.1:133158566-133162047 +
证据层功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达
关键证据GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse

TkA02G535660

MVA/MEP 与异戊二烯MVA 甲羟戊酸途径高置信 · 分数 18
统一 IDTkA02G535660
位置CM104801.1:19628006-19630012 +
证据层功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达
关键证据GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

TkA02G448690

MVA/MEP 与异戊二烯MVA 甲羟戊酸途径高置信 · 分数 18
统一 IDTkA02G448690
位置CM104801.1:43288238-43290024 +
证据层功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达
关键证据GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

TkAUNG090180

萜类代谢萜类代谢高置信 · 分数 18
统一 IDTkAUNG090180;TkA02G276590;TkA02G276600;TkA06G031130
位置CM104803.1:119913581-119918492 -
证据层GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达
关键证据GO:0010333
基因详情表达蛋白组JBrowse

LXL04_028189

MVA/MEP 与异戊二烯MVA 甲羟戊酸途径高置信 · 分数 18
统一 ID-
位置CM104804.1:33787973-33788663 -
证据层GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达
关键证据GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

LXL04_028191

MVA/MEP 与异戊二烯MVA 甲羟戊酸途径高置信 · 分数 18
统一 ID-
位置CM104804.1:33794453-33797605 -
证据层GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达
关键证据GO:0008299
基因详情表达蛋白组JBrowse

证据边界

当前结果来自注释、GO/KEGG、同源、预测定位、结构域、表达/蛋白组和网络数据库的整合候选证据。High/Medium/Low 表示数据库证据密度和一致性，不代表已经完成湿实验验证；乳胶/根相关集合是候选背景，不应直接解读为橡胶生物合成酶。