橡胶生物合成专题

围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。

本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。

当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258

下载当前筛选候选基因 TSV

跨物种研究参考

此处的 4 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。

1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。

2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。

3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。

杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。

4巴西橡胶树点击查看 · 2 个来源 · cis-1,4-polyisoprene

下载当前跨物种参考 TSV

物种与材料	参考基因/序列 ID	通路步骤	证据与边界	来源
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneRubber particles	`HRBP`LC057267CPTL	CPT/CPTLHRT1复合体辅助亚基	A_direct_experiment HRBP作为HRT1橡胶粒子复合体辅助亚基被报道。 Complex-support evidence, not a stand-alone catalytic claim.	10.7554/eLife.19022Identification and reconstitution of the rubber biosynthetic machinery on rubber particles from Hevea brasiliensis
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneRubber particles	`HRT1`BAB71776.2;AB061234.3CPT	CPT/CPTL橡胶粒子上的顺式异戊二烯基转移酶	A_direct_experiment HRT1在去污剂清洗的橡胶粒子上显示体外橡胶转移酶活性，HRT1-REF-HRBP复合体提高活性。 Direct evidence in Hevea rubber particles; not direct validation in rubber dandelion.	10.7554/eLife.19022Identification and reconstitution of the rubber biosynthetic machinery on rubber particles from Hevea brasiliensis
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneLatex and recombinant enzyme	`HRT2`Q8W3U4;AB064661.2CPT	CPT/CPTL乳胶表达的顺式异戊二烯基转移酶参考	A_enzyme_experiment HRT2为顺式异戊二烯基转移酶和乳胶表达参考。 Do not claim direct reconstitution of 高置信-molecular-weight natural rubber by HRT2 alone.	10.1046/j.1432-1033.2003.03863.xMolecular cloning expression and characterization of cDNA encoding cis-prenyltransferases from Hevea brasiliensis
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneRubber particles	`REF`REF complex memberREF	REF/SRPP 橡胶颗粒橡胶粒子复合体成员	A_complex_evidence HRT1 and HRBP/REF particle-complex evidence; REF is not displayed as a stand-alone catalytic proof. Not a stand-alone catalytic proof.	10.7554/eLife.19022Identification and reconstitution of the rubber biosynthetic machinery on rubber particles from Hevea brasiliensis

巴西橡胶树 · HRBP

序列 IDLC057267

步骤CPT/CPTL · CPTL

证据HRBP作为HRT1橡胶粒子复合体辅助亚基被报道。

边界Complex-support evidence, not a stand-alone catalytic claim.

来源10.7554/eLife.19022

巴西橡胶树 · HRT1

序列 IDBAB71776.2;AB061234.3

步骤CPT/CPTL · CPT

证据HRT1在去污剂清洗的橡胶粒子上显示体外橡胶转移酶活性，HRT1-REF-HRBP复合体提高活性。

边界Direct evidence in Hevea rubber particles; not direct validation in rubber dandelion.

来源10.7554/eLife.19022

巴西橡胶树 · HRT2

序列 IDQ8W3U4;AB064661.2

步骤CPT/CPTL · CPT

证据HRT2为顺式异戊二烯基转移酶和乳胶表达参考。

边界Do not claim direct reconstitution of 高置信-molecular-weight natural rubber by HRT2 alone.

来源10.1046/j.1432-1033.2003.03863.x

巴西橡胶树 · REF

序列 IDREF complex member

步骤REF/SRPP 橡胶颗粒 · REF

证据HRT1 and HRBP/REF particle-complex evidence; REF is not displayed as a stand-alone catalytic proof.

边界Not a stand-alone catalytic proof.

来源10.7554/eLife.19022

通路导航与候选分布

MVA · MVA 甲羟戊酸途径

High 40 · Medium 3 · Low 4 MEP · MEP 非甲羟戊酸途径

High 23 · Medium 0 · Low 36 IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体

271

High 141 · Medium 83 · Low 47 CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶

High 0 · Medium 0 · Low 5 REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白

High 0 · Medium 0 · Low 7 Rubber · 橡胶生物合成

288

High 1 · Medium 287 · Low 0 Terpenoid · 萜类代谢

380

High 72 · Medium 107 · Low 201 Latex/root · 乳胶/根相关候选

4466

High 231 · Medium 1284 · Low 2951

377 MVA/MEP 与异戊二烯

点击筛选 · High 204 · Medium 86 · Low 87 4466 乳胶/根相关候选

点击筛选 · High 231 · Medium 1284 · Low 2951 300 橡胶生物合成

点击筛选 · High 1 · Medium 287 · Low 12 380 萜类代谢

点击筛选 · High 72 · Medium 107 · Low 201

候选基因表

当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 112/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。

基因 ID	通路/步骤	等级	证据层	位置	关键证据	操作
`TkA01G444990` TK1151: TkA01G444990;TkA02G602440;TkA04G140090;TkA04G304850;TkA05G034120 OH-1004: LXL04_037394	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104807.1:9128946-9131515 +	GO:0016740	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA04G314210` TK1151: TkA04G314210 OH-1004: LXL04_037498	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI	CM104807.1:12291431-12293480 -	go:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`LXL04_037620` TK1151: - OH-1004: LXL04_037620	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位Swiss-Prot	CM104807.1:16327381-16327879 -	GO:0008299	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`LXL04_037635` TK1151: - OH-1004: LXL04_037635	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104807.1:16803609-16805784 +	GO:0016740	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA04G333960` TK1151: TkA04G333960 OH-1004: LXL04_037684	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104807.1:18233468-18238668 +	go:0008631 intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkAUNG057010` TK1151: TkAUNG057010;TkA04G344010 OH-1004: LXL04_037739	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104807.1:19770544-19773947 +	go:0006950 response to stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G007950` TK1151: TkA02G007950;TkA04G357040 OH-1004: LXL04_037881	萜类代谢萜类代谢	中等置信分数 6	功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104807.1:24085326-24087158 +	go:0010436 carotenoid dioxygenase activity 分子功能	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA04G358450` TK1151: TkA04G358450 OH-1004: LXL04_037890	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104807.1:24463156-24467226 +	GO:0016740	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`LXL04_037944` TK1151: - OH-1004: LXL04_037944	橡胶生物合成橡胶生物合成	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104807.1:25923792-25925584 +	GO:0008299	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA02G016770` TK1151: TkA02G016770 OH-1004: LXL04_037955	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	中等置信分数 6	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104807.1:26825664-26826023 +	go:0006970 response to osmotic stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse