杜仲 · EuIPI
序列 IDAB041629.2
步骤异戊二烯供体 · IDI
证据EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。
边界Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions.
橡胶生物合成专题
围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。
本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。
当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。
跨物种研究参考
此处的 1 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。
1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。
2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。
3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。
杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。
| 物种与材料 | 参考基因/序列 ID | 通路步骤 | 证据与边界 | 来源 |
|---|---|---|---|---|
| 杜仲Eucommia ulmoidestrans-1,4-polyisopreneTransgenic roots | EuIPIAB041629.2IDI | 异戊二烯供体杜仲胶前体供给参考 | A_direct_genetic_experiment EuIPI过表达与反式聚异戊二烯积累增加相关。 Trans-polyisoprene comparator only; excluded from natural cis-rubber 候选 conclusions. | 10.1186/1472-6750-12-78Overexpression of EuIPI increases trans-polyisoprene accumulation |
杜仲 · EuIPI
通路导航与候选分布
MVA · MVA 甲羟戊酸途径
47
High 40 · Medium 3 · Low 4
MEP · MEP 非甲羟戊酸途径
59
High 23 · Medium 0 · Low 36
IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体
271
High 141 · Medium 83 · Low 47
CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶
5
High 0 · Medium 0 · Low 5
REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白
7
High 0 · Medium 0 · Low 7
Rubber · 橡胶生物合成
288
High 1 · Medium 287 · Low 0
Terpenoid · 萜类代谢
380
High 72 · Medium 107 · Low 201
Latex/root · 乳胶/根相关候选
4466
High 231 · Medium 1284 · Low 2951
候选基因表
当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 11/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。
| 基因 ID | 通路/步骤 | 等级 | 证据层 | 位置 | 关键证据 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
TkA01G561850TK1151: TkA01G561850 OH-1004: LXL04_001090 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
高置信 分数 10 |
功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:19989751-19992525 - |
go:0009824 amp dimethylallyltransferase activity 分子功能 | |
TkA01G526400TK1151: TkA01G526400 OH-1004: LXL04_001550 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
高置信 分数 10 |
GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达 | CM104799.1:28958260-28959614 + |
GO:0006720 | |
TkA01G522970TK1151: TkA01G522970 OH-1004: LXL04_001598 |
MVA/MEP 与异戊二烯 MVA 甲羟戊酸途径 |
高置信 分数 10 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:29822753-29827340 - |
GO:0008299 | |
TkA01G492590TK1151: TkA01G492590 OH-1004: LXL04_002002 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
高置信 分数 10 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:38809573-38810232 - |
go:0006970 response to osmotic stress 生物过程 | |
TkA01G475480TK1151: TkA01G475480;TkA07G186220;TkA07G186860 OH-1004: LXL04_002187 |
萜类代谢 萜类代谢 |
高置信 分数 10 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:43509327-43511401 + |
GO:0010333 | |
TkA01G402800TK1151: TkA01G402800 OH-1004: LXL04_003034 |
萜类代谢 萜类代谢 |
高置信 分数 10 |
功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:65386113-65404532 - |
go:0010686 tetracyclic triterpenoid biosynthetic process 生物过程 | |
LXL04_003040TK1151: - OH-1004: LXL04_003040 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
高置信 分数 10 |
GO表达定位Swiss-Prot | CM104799.1:65621689-65621968 - |
GO:0016114 | |
TkA01G387270TK1151: TkA01G387270;TkA01G556620;TkA08G142540 OH-1004: LXL04_003181 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
高置信 分数 10 |
功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达 | CM104799.1:70368002-70371154 - |
go:0004311 geranylgeranyl diphosphate synthase activity 分子功能 | |
TkA01G105050TK1151: TkA01G105050 OH-1004: LXL04_004824 |
乳胶/根相关候选 乳胶/根相关候选 |
高置信 分数 10 |
GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI | CM104799.1:147918774-147922111 - |
go:0010015 root morphogenesis 生物过程 | |
TkA01G095270TK1151: TkA01G095270 OH-1004: LXL04_004939 |
MVA/MEP 与异戊二烯 异戊二烯供体 |
高置信 分数 10 |
功能注释GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达 | CM104799.1:150602539-150603477 + |
go:0004663 rab geranylgeranyltransferase activity 分子功能 |
证据边界
当前结果来自注释、GO/KEGG、同源、预测定位、结构域、表达/蛋白组和网络数据库的整合候选证据。High/Medium/Low 表示数据库证据密度和一致性，不代表已经完成湿实验验证；乳胶/根相关集合是候选背景，不应直接解读为橡胶生物合成酶。