橡胶草重测序数据集

GSA CRA009020：Taraxacum kok-saghyz F1 作图群体的全基因组重测序数据。本站提供官方元数据索引、样本检索、文件校验值和原始下载直链。

如何使用

先按样本名、Run、Experiment 或 BioSample 编号检索；再在对应行打开 Read 1 / Read 2 的官方 HTTPS 链接。下载前可用表中的 MD5 校验文件完整性。需要批量处理时，下载完整元数据 TSV，再根据 Run 编号选择文件。

证据边界：这是可下载原始数据的官方目录，不是本站生成的 SNP/VCF 变异查询结果。原始 FASTQ 仍由 GSA 托管，本站不镜像这批大文件。NCBI PRJNA1058564 页面已核验为 “No public data is linked”；请以 GSA CRA009020 为真实公开数据源。

GSA 项目主页 GSA HTTPS 目录下载完整元数据 TSV

129样本

129配对 WGS Run

2 × 150 bpIllumina NovaSeq 6000

CRA009020GSA 项目号

对应表型数据

本项目对应论文补充表 S7，包含 F1 作图群体 129 个论文样本的天然橡胶含量（NR content）及六个主要 QTL 基因型。论文样本编号为 R01–R129；由于 GSA CRA009020 的公开样本名为 164L、X5H 和 F1-*，没有公开的一一对应表，因此网站保留论文原始编号，不虚构样本映射。

下载表型 TSV

来源：Yang et al., BMC Genomics 2023, CRA009020/GVM000440；性状：天然橡胶含量（%）。

样本与文件目录

共匹配 129 条；当前每页 20 条。文件名、文件大小和 MD5 来自 GSA CRA009020.xlsx。

样本	Run / Experiment	实验信息	Read 1	Read 2
F1-21 SAMC997364	`CRR618603` CRX553521	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618603_f1.fq.gz` 2,686,936,906 bytes MD5 864a2695e3d396e70b366aa182cd00b8	HTTPS `CRR618603_r2.fq.gz` 2,773,743,682 bytes MD5 d260065274469eaed50eec03c6e6a4aa
F1-30 SAMC997365	`CRR618604` CRX553522	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618604_f1.fq.gz` 2,626,403,275 bytes MD5 f617fb6656da153fb86afe715b907250	HTTPS `CRR618604_r2.fq.gz` 2,742,591,993 bytes MD5 a51958c872791adce89a897ecd096bbd
F1-33 SAMC997366	`CRR618605` CRX553523	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618605_f1.fq.gz` 2,435,270,336 bytes MD5 1f5918c37a418c3e6b0a760b697acafc	HTTPS `CRR618605_r2.fq.gz` 2,559,335,856 bytes MD5 a7b4c7cbab099ac66152ceceb0cbd790
F1-34 SAMC997367	`CRR618606` CRX553524	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618606_f1.fq.gz` 2,517,285,357 bytes MD5 26497e088c4f89ece23310ef6bf8bd68	HTTPS `CRR618606_r2.fq.gz` 2,658,944,090 bytes MD5 8d1717ee8fea4ccc87e715ec6600384f
F1-36 SAMC997368	`CRR618607` CRX553525	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618607_f1.fq.gz` 2,079,978,166 bytes MD5 9749d10b2ff056913f50bdd768b368bf	HTTPS `CRR618607_r2.fq.gz` 2,172,537,903 bytes MD5 01f51bb016fed4d62c6cae45cd96c0e8
F1-37 SAMC997369	`CRR618608` CRX553526	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618608_f1.fq.gz` 2,290,975,011 bytes MD5 15b051afb83684de7b57f5bd56db00c8	HTTPS `CRR618608_r2.fq.gz` 2,374,891,769 bytes MD5 b0bce43517885fa6c1137dadb70474d2
F1-40 SAMC997370	`CRR618609` CRX553527	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618609_f1.fq.gz` 2,186,164,607 bytes MD5 db42db8563ee212398b724147bc66925	HTTPS `CRR618609_r2.fq.gz` 2,304,273,340 bytes MD5 6855616147cc3220cf15943d8a831dfc
F1-42 SAMC997371	`CRR618610` CRX553528	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618610_f1.fq.gz` 2,411,688,143 bytes MD5 104452636f68fd78d228952824ce80a5	HTTPS `CRR618610_r2.fq.gz` 2,523,743,917 bytes MD5 07a7cdb9ce72c3cd8b5a9bb6bb0a7e6d
F1-43 SAMC997372	`CRR618611` CRX553529	Illumina NovaSeq 6000 WGS · PAIRED · leaf maturation stage	HTTPS `CRR618611_f1.fq.gz` 2,475,704,404 bytes MD5 320db3d52a98f68c2600ae7c6a239ba5	HTTPS `CRR618611_r2.fq.gz` 2,567,077,039 bytes MD5 63002b24521c6e652c9100ca8048e21a

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