参考基因组比较
展示 TK1151 与 OH-1004 两个橡胶草材料的组装诊断、GFF 基因目录和后续同源/共线性 ID 对照入口。
TK1151 和 OH-1004 是同一物种不同材料,不是同一品种的简单版本升级。本模块定位为两个橡胶草参考基因组之间的基因同源与共线性 ID 对照。
比较概览
ID 对照记录
84884
TK1151 / OH-1004 基因层对照
共线性区块
427
JCVI/MCScanX 锚点区块
High 置信区块
302
高一致性块
Medium 置信区块
125
保留为辅助证据
参考组装摘要
TK1151
TK1151TK1151_GWHBCHF00000000
gap 数: 1917 · 端粒扫描序列: 9
双端支持: 0
证据类型: GFF gene catalog + DIAMOND/RBH + JCVI/MCScanX anchors
OH-1004
OH1004OH1004_GCA_047496595.1
gap 数: 131 · 端粒扫描序列: 711
双端支持: 0
证据类型: GFF gene catalog + DIAMOND/RBH + JCVI/MCScanX anchors
Gene 目录统计
| 参考 | 材料 | 基因数 |
|---|---|---|
TK1151 | TK1151 | 45224 |
OH1004 | OH-1004 | 40057 |
基因目录示例
| 参考基因组 | 基因 ID | 位置 | 描述 |
|---|---|---|---|
| TK1151 | TkAUNG000010 |
GWHBCHF00000001:2719-3172 | TK1151 |
| TK1151 | TkAUNG000020 |
GWHBCHF00000001:3584-5635 | TK1151 |
| TK1151 | TkAUNG000050 |
GWHBCHF00000001:9900-14018 | TK1151 |
| TK1151 | TkAUNG000080 |
GWHBCHF00000001:22628-29341 | TK1151 |
| TK1151 | TkAUNG000100 |
GWHBCHF00000001:41094-42316 | TK1151 |
| TK1151 | TkAUNG000140 |
GWHBCHF00000001:51240-53271 | TK1151 |