蛋白质组查询

输入基因或蛋白 ID,勾选一个或多个数据集,查看蛋白丰度、重复鉴定和双向电泳证据。

3 可选数据集 · 3 独立公共项目 · 56 定量样本,另有3个成熟根鉴定重复

不同项目分别展示、独立计算图的刻度,不直接比较跨项目蛋白相对强度。已解析到同一基因的别名不重复计入;一个基因关联多个蛋白组时,各组单独统计。

示例

转录组表达量查询

下载本次定量数据集与基因 TSV · 36 条定量记录

正常流乳与乳汁不外流材料的根蛋白组 · 无标记相对定量强度

来源项目号: PRIDE PXD011773
原论文: 查看研究设计
样本与定量: 36 个定量样本 · 9040 个蛋白组 · MaxQuant
研究物种: 橡胶草
取样组织/样品: 根组织(整根总蛋白)
处理与比较方式: 正常流乳对照、正常流乳转基因对照与乳汁不外流双转基因材料,按三个生长周龄比较。
取样周龄: 8、12、24周龄
分组与重复: 每个周龄与材料组合4个生物学重复;3种材料×3个周龄×4个重复,共36个定量样本。
材料/分组材料含义
正常流乳对照论文的正常流乳背景对照;源表标记为WT。
正常流乳转基因对照仅表达核糖核酸酶抑制蛋白的转基因对照,能正常流出乳汁。
乳汁不外流株系核糖核酸酶及其抑制蛋白双转基因材料,乳汁不外流。

无标记相对定量以蛋白组为单位。跨版本基因映射保留证据等级,不能据此认定唯一蛋白鉴定;源零值保留,不等于蛋白不存在。

ID 解析

输入 ID显示 ID关联查询 ID蛋白组定量记录状态
LXL04_005139LXL04_005139LXL04_005139590136已解析

分组统计

下载当前数据集与基因 TSV

按取样周龄与材料分组计算每个蛋白组的平均相对强度、标准差、标准误及生物学重复数,保留源零值;图示为平均相对强度,各数据集刻度独立。

LXL04_005139 · 8周龄 正常流乳对照 · 蛋白组 59012.05e+08
LXL04_005139 · 8周龄 正常流乳转基因对照 · 蛋白组 59012.4e+08
LXL04_005139 · 8周龄 乳汁不外流株系 · 蛋白组 59012.49e+08
LXL04_005139 · 12周龄 正常流乳对照 · 蛋白组 59012.32e+08
LXL04_005139 · 12周龄 正常流乳转基因对照 · 蛋白组 59012.18e+08
LXL04_005139 · 12周龄 乳汁不外流株系 · 蛋白组 59012.31e+08
LXL04_005139 · 24周龄 正常流乳对照 · 蛋白组 59012.76e+08
LXL04_005139 · 24周龄 正常流乳转基因对照 · 蛋白组 59012.76e+08
LXL04_005139 · 24周龄 乳汁不外流株系 · 蛋白组 59013.25e+08
基因 / 蛋白 ID蛋白组组织/样品材料/分组取样周龄平均强度标准差标准误重复数单位
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)正常流乳对照8周龄2.0536e+082.2759e+071.13795e+074无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照8周龄2.40325e+082.45426e+071.22713e+074无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系8周龄2.49402e+081.07242e+085.36212e+074无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)正常流乳对照12周龄2.32478e+083.80014e+071.90007e+074无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照12周龄2.1765e+082.27911e+071.13956e+074无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系12周龄2.30955e+081.5012e+077.506e+064无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)正常流乳对照24周龄2.7573e+086.11189e+073.05594e+074无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照24周龄2.76088e+081.39262e+076.96308e+064无标记相对定量强度
LXL04_0051395901根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系24周龄3.24705e+088.71579e+074.3579e+074无标记相对定量强度

样本蛋白丰度明细

基因 / 蛋白 ID蛋白组样本组织/样品材料/分组取样周龄重复丰度单位来源
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复1
PAP73
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照8周龄生物学重复1187750000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复2
PAP74
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照8周龄生物学重复2225390000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复3
PAP75
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照8周龄生物学重复3183660000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复4
PAP76
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照8周龄生物学重复4224640000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复1
PAP77
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照8周龄生物学重复1215900000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复2
PAP78
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照8周龄生物学重复2260510000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复3
PAP79
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照8周龄生物学重复3262370000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复4
PAP80
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照8周龄生物学重复4222520000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复1
PAP81
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系8周龄生物学重复1226430000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复2
PAP82
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系8周龄生物学重复2135430000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复3
PAP83
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系8周龄生物学重复3394060000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_00513959018周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复4
PAP84
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系8周龄生物学重复4241690000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复1
PAP85
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照12周龄生物学重复1217420000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复2
PAP86
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照12周龄生物学重复2274600000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复3
PAP87
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照12周龄生物学重复3250290000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复4
PAP88
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照12周龄生物学重复4187600000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复1
PAP89
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照12周龄生物学重复1248620000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复2
PAP90
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照12周龄生物学重复2212510000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复3
PAP91
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照12周龄生物学重复3193800000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复4
PAP92
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照12周龄生物学重复4215670000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复1
PAP93
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系12周龄生物学重复1218020000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复2
PAP94
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系12周龄生物学重复2248490000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复3
PAP95
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系12周龄生物学重复3218890000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590112周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复4
PAP96
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系12周龄生物学重复4238420000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复1
PAP97
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照24周龄生物学重复1299890000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复2
PAP98
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照24周龄生物学重复2272940000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复3
PAP99
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照24周龄生物学重复3192980000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳对照 · 生物学重复4
PAP100
根组织(整根总蛋白)正常流乳对照24周龄生物学重复4337110000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复1
PAP101
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照24周龄生物学重复1266170000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复2
PAP102
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照24周龄生物学重复2272270000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复3
PAP103
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照24周龄生物学重复3269270000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 正常流乳转基因对照 · 生物学重复4
PAP104
根组织(整根总蛋白)正常流乳转基因对照24周龄生物学重复4296640000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复1
PAP105
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系24周龄生物学重复1233350000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复2
PAP106
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系24周龄生物学重复2292820000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复3
PAP107
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系24周龄生物学重复3440330000.0无标记相对定量强度PXD011773
LXL04_005139590124周龄 · 乳汁不外流株系 · 生物学重复4
PAP108
根组织(整根总蛋白)乳汁不外流株系24周龄生物学重复4332320000.0无标记相对定量强度PXD011773
数据来源与蛋白鉴定说明

PRIDE PXD011773 · MaxQuant · 108 个原始质谱文件

归档源标签8d、12d、24d在原论文中对应8、12、24周龄。页面依据论文显示周龄,下载保留源标签,并附核实后的周龄字段。

下载文件原有字段保留源表标签;核实周龄、组织、重复类型及中文材料名称位于附加字段。

LXL04_005139

蛋白组 5901 · 肽段: 12 · 唯一肽段: 8 · 序列覆盖度: 23.4%

映射证据: 来源映射标签(原标签见下载)

来源蛋白 ID: evm.model.utg3471.5|evm.TU.utg3471.5|utg3471|GWHAAAA00007534.:40449-40523,;evm.model.utg34121.2|evm.TU.utg34121.2|utg34121|GWHAAAA00028788.:13258-13411,;evm.model.utg15882.6|evm.TU.utg15882.6|utg15882|GWHAAAA00007700.:22072-22447,

样本设计与原始文件目录
实验取样周龄材料/分组重复原始文件数
PAP738周龄正常流乳对照生物学重复13
PAP748周龄正常流乳对照生物学重复23
PAP758周龄正常流乳对照生物学重复33
PAP768周龄正常流乳对照生物学重复43
PAP778周龄正常流乳转基因对照生物学重复13
PAP788周龄正常流乳转基因对照生物学重复23
PAP798周龄正常流乳转基因对照生物学重复33
PAP808周龄正常流乳转基因对照生物学重复43
PAP818周龄乳汁不外流株系生物学重复13
PAP828周龄乳汁不外流株系生物学重复23
PAP838周龄乳汁不外流株系生物学重复33
PAP848周龄乳汁不外流株系生物学重复43
PAP8512周龄正常流乳对照生物学重复13
PAP8612周龄正常流乳对照生物学重复23
PAP8712周龄正常流乳对照生物学重复33
PAP8812周龄正常流乳对照生物学重复43
PAP8912周龄正常流乳转基因对照生物学重复13
PAP9012周龄正常流乳转基因对照生物学重复23
PAP9112周龄正常流乳转基因对照生物学重复33
PAP9212周龄正常流乳转基因对照生物学重复43
PAP9312周龄乳汁不外流株系生物学重复13
PAP9412周龄乳汁不外流株系生物学重复23
PAP9512周龄乳汁不外流株系生物学重复33
PAP9612周龄乳汁不外流株系生物学重复43
PAP9724周龄正常流乳对照生物学重复13
PAP9824周龄正常流乳对照生物学重复23
PAP9924周龄正常流乳对照生物学重复33
PAP10024周龄正常流乳对照生物学重复43
PAP10124周龄正常流乳转基因对照生物学重复13
PAP10224周龄正常流乳转基因对照生物学重复23
PAP10324周龄正常流乳转基因对照生物学重复33
PAP10424周龄正常流乳转基因对照生物学重复43
PAP10524周龄乳汁不外流株系生物学重复13
PAP10624周龄乳汁不外流株系生物学重复23
PAP10724周龄乳汁不外流株系生物学重复33
PAP10824周龄乳汁不外流株系生物学重复43