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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 13 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G165230
Chr01:42207644-42208054 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
43.300
查询 82.353 / 对象 35.357
TkA01G165230
TkA02G602530
Chr02:155313963-155314488 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
77.600
查询 65.686 / 对象 10.167
TkA02G602530
TkA03G387040
Chr03:95773580-95774438 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
78.700
查询 35.673 / 对象 9.256
TkA03G387040
TkA03G422920
Chr03:105296102-105296885 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
54.000
查询 99.070 / 对象 38.088
TkA03G422920
TkA03G564180
Chr03:143158051-143158955 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
57.900
查询 98.095 / 对象 45.068
TkA03G564180
TkA04G132550
Chr04:34502139-34502634 (+)
GWHBCHF00000005
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
60.200
查询 70.833 / 对象 13.354
TkA04G132550
TkA04G490390
Chr04:123977521-123979716 (+)
GWHBCHF00000005
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
56.700
查询 51.111 / 对象 24.734
TkA04G490390
TkA05G012720
Chr05:3620584-3621581 (-)
GWHBCHF00000006
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
55.200
查询 100.000 / 对象 27.466
TkA05G012720
TkA05G104440
Chr05:27946188-27946711 (-)
GWHBCHF00000006
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
88.600
查询 74.528 / 对象 11.988
TkA05G104440
TkA06G185400
Chr06:48367163-48368870 (+)
GWHBCHF00000007
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
91.200
查询 75.385 / 对象 44.613
TkA06G185400
TkA07G333270
Chr07:83314034-83315568 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
89.600
查询 50.130 / 对象 29.287
TkA07G333270
TkA08G180220
Chr08:47171203-47171768 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
64.700
查询 56.291 / 对象 12.898
TkA08G180220
TkAUNG049190
ChrUn:13811981-13812532 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_022482
Chr04:151228263-151237215 (-)
CM104802.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
69.300
查询 50.289 / 对象 13.354
TkAUNG049190
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