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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 11 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G004750
Chr01:1243555-1244606 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
69.100
查询 97.561 / 对象 36.105
TkA01G004750
TkA01G015550
Chr01:3973297-3974848 (-)
GWHBCHF00000002
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
59.100
查询 95.972 / 对象 46.947
TkA01G015550
TkA02G522540
Chr02:134768741-134770876 (+)
GWHBCHF00000003
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
59.300
查询 80.277 / 对象 54.105
TkA02G522540
TkA02G605780
Chr02:156284400-156285752 (+)
GWHBCHF00000003
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
58.800
查询 74.634 / 对象 16.000
TkA02G605780
TkA04G028510
Chr04:7511583-7513330 (-)
GWHBCHF00000005
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
55.800
查询 83.564 / 对象 47.053
TkA04G028510
TkA04G055560
Chr04:14840555-14843010 (+)
GWHBCHF00000005
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
99.000
查询 100.000 / 对象 52.000
TkA04G055560
TkA04G122240
Chr04:31763115-31764614 (+)
GWHBCHF00000005
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
96.300
查询 82.741 / 对象 34.316
TkA04G122240
TkA07G008300
Chr07:2302062-2306281 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
56.200
查询 74.825 / 对象 47.474
TkA07G008300
TkA07G087700
Chr07:22880695-22882088 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
55.100
查询 77.487 / 对象 30.842
TkA07G087700
TkA08G132690
Chr08:34473770-34474575 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
92.200
查询 52.968 / 对象 11.789
TkA08G132690
TkA08G232090
Chr08:60447234-60454937 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_006308
Chr02:6570308-6574110 (-)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
60.100
查询 97.101 / 对象 27.579
TkA08G232090
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