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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 25 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G203740
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GWHBCHF00000002
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
80.100
查询 94.990 / 对象 16.307
TkA01G203740
TkA01G293270
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
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查询 100.000 / 对象 20.098
TkA01G293270
TkA01G356770
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
63.800
查询 57.883 / 对象 9.575
TkA01G356770
TkA02G551720
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
90.200
查询 54.400 / 对象 4.673
TkA02G551720
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
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查询 38.095 / 对象 3.399
TkA03G055760
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
53.500
查询 70.957 / 对象 10.327
TkA03G094280
TkA03G258640
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复杂
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TkA03G258640
TkA03G316030
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
50.200
查询 99.575 / 对象 36.667
TkA03G316030
TkA03G426740
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CM104804.1
一对多 multi candidate from TK1151
复杂
71.800
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TkA03G426740
TkA04G185340
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
60.500
查询 21.348 / 对象 1.242
TkA04G185340
TkA04G418850
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CM104804.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
66.500
查询 91.914 / 对象 35.588
TkA04G418850
TkA04G496270
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
90.200
查询 39.161 / 对象 3.660
TkA04G496270
TkA05G124910
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
61.500
查询 94.101 / 对象 10.229
TkA05G124910
TkA05G134120
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
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查询 95.968 / 对象 7.549
TkA05G134120
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
44.300
查询 85.973 / 对象 43.758
TkA05G254300
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
51.000
查询 99.716 / 对象 32.549
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TkA05G302090
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
70.700
查询 93.889 / 对象 12.810
TkA05G302090
TkA06G242820
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
54.400
查询 88.052 / 对象 15.556
TkA06G242820
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
75.000
查询 78.398 / 对象 11.471
TkA06G259430
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
46.100
查询 49.389 / 对象 8.824
TkA06G270710
TkA06G422390
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
82.000
查询 83.417 / 对象 5.784
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
55.800
查询 65.336 / 对象 16.569
TkA07G170640
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
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TkA08G370220
TkA08G384610
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
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TkA08G384610
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ChrUn:22949720-22950364 (+)
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CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
74.600
查询 97.549 / 对象 6.340
TkAUNG080500
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