ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID，列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料，不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换；复杂映射需按类别和证据复核。

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版本	组装/注释 accession	来源数据库	论文	DOI / PMID	下载日期
TK1151 Taraxacum kok-saghyz	GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein	NGDC Genome Warehouse (GWH)	Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022	10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160	2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz	GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF	NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly	NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文（截至 2026-08-17）未发现	未发现	2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集：TK1151；45224 个基因；当前筛选 13 条。当前显示第 1 / 1 页。

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示例 TkA01G624900 LXL04_000258

全部严格 1:1: 6347 较可信 1:1: 1703 一对多: 826 多对一: 24458 未映射: 2782 注释冲突: 9108

严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性；较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算；查询侧为 TK1151，对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。

TK1151 基因 ID	OH-1004 基因 ID	类别	关系 / 置信度	相似度 / 覆盖度	说明
TkA02G261180 Chr02:66647544-66649142 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	92.000 查询 97.995 / 对象 45.017	TkA02G261180
TkA02G408020 Chr02:103774978-103776576 (-) GWHBCHF00000003	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	92.000 查询 97.995 / 对象 45.017	TkA02G408020
TkA03G091070 Chr03:23189968-23191760 (-) GWHBCHF00000004	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	86.200 查询 86.280 / 对象 33.371	TkA03G091070
TkA04G025730 Chr04:6734805-6736403 (+) GWHBCHF00000005	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	92.000 查询 97.995 / 对象 45.017	TkA04G025730
TkA04G143770 Chr04:37202710-37204500 (+) GWHBCHF00000005	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	注释冲突	序列支持，但注释或基因模型存在冲突需复核	97.500 查询 96.995 / 对象 39.754	TkA04G143770
TkA04G166830 Chr04:43111916-43113724 (+) GWHBCHF00000005	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	90.700 查询 83.986 / 对象 27.660	TkA04G166830
TkA04G176800 Chr04:45758952-45760750 (-) GWHBCHF00000005	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	93.000 查询 100.000 / 对象 36.730	TkA04G176800
TkA04G179520 Chr04:46470361-46472166 (+) GWHBCHF00000005	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	91.600 查询 100.000 / 对象 26.764	TkA04G179520
TkA05G400940 Chr05:99755017-99756825 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	93.500 查询 89.311 / 对象 43.337	TkA05G400940
TkA05G428100 Chr05:106749161-106750071 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	注释冲突	序列支持，但注释或基因模型存在冲突需复核	97.700 查询 100.000 / 对象 29.115	TkA05G428100
TkA05G428110 Chr05:106750458-106751254 (-) GWHBCHF00000006	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	89.500 查询 89.720 / 对象 23.404	TkA05G428110
TkA07G163200 Chr07:41940055-41941837 (+) GWHBCHF00000008	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	一对多	multi candidate from TK1151 复杂	88.600 查询 93.763 / 对象 51.736	TkA07G163200
TkA08G177020 Chr08:46321860-46323458 (+) GWHBCHF00000009	LXL04_004192 Chr01:128723428-128726613 (-) CM104799.1	多对一	non reciprocal best hit 复杂	92.000 查询 97.995 / 对象 45.017	TkA08G177020

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