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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 12 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA02G143960
Chr02:37203008-37206837 (+)
GWHBCHF00000003
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
31.800
查询 44.348 / 对象 12.041
TkA02G143960
TkA02G193340
Chr02:49569392-49572500 (+)
GWHBCHF00000003
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
75.600
查询 82.609 / 对象 17.995
TkA02G193340
TkA02G472500
Chr02:120577102-120580207 (+)
GWHBCHF00000003
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
78.000
查询 92.373 / 对象 11.191
TkA02G472500
TkA03G268040
Chr03:66386215-66392701 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
62.300
查询 46.538 / 对象 15.891
TkA03G268040
TkA03G268470
Chr03:66490178-66492638 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
91.500
查询 71.756 / 对象 8.415
TkA03G268470
TkA05G172050
Chr05:44088798-44093155 (+)
GWHBCHF00000006
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
60.800
查询 80.696 / 对象 21.934
TkA05G172050
TkA05G247660
Chr05:61584906-61588290 (-)
GWHBCHF00000006
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
97.000
查询 34.639 / 对象 7.520
TkA05G247660
TkA05G391700
Chr05:97340915-97347166 (-)
GWHBCHF00000006
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
88.000
查询 97.650 / 对象 37.243
TkA05G391700
TkA06G383750
Chr06:94965880-94967494 (-)
GWHBCHF00000007
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
47.800
查询 47.872 / 对象 3.357
TkA06G383750
TkA08G147450
Chr08:38439525-38448747 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
73.000
查询 98.739 / 对象 29.320
TkA08G147450
TkA08G297760
Chr08:77166243-77174225 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
40.800
查询 85.370 / 对象 98.344
TkA08G297760
TkA08G405240
Chr08:103135334-103136202 (+)
GWHBCHF00000009
LXL04_028986
Chr06:77001557-77008279 (-)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
33.500
查询 95.154 / 对象 11.459
TkA08G405240
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