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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 10 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA02G059500
Chr02:15518544-15519512 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
56.700
查询 100.000 / 对象 29.473
TkA02G059500
TkA02G201930
Chr02:51634681-51636004 (-)
GWHBCHF00000003
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
38.700
查询 92.481 / 对象 56.215
TkA02G201930
TkA03G038000
Chr03:10028221-10029006 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
54.100
查询 97.500 / 对象 22.599
TkA03G038000
TkA05G148440
Chr05:38501638-38509965 (+)
GWHBCHF00000006
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
54.900
查询 95.573 / 对象 39.736
TkA05G148440
TkA06G178470
Chr06:46726660-46735732 (-)
GWHBCHF00000007
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
51.600
查询 97.041 / 对象 75.706
TkA06G178470
TkA07G220680
Chr07:55352234-55354639 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
93.200
查询 74.009 / 对象 31.638
TkA07G220680
TkA07G246260
Chr07:61428421-61435383 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
61.300
查询 100.000 / 对象 59.605
TkA07G246260
TkA07G275290
Chr07:68859599-68864988 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
59.100
查询 96.263 / 对象 83.522
TkA07G275290
TkA07G348640
Chr07:87110998-87117157 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
69.100
查询 73.969 / 对象 48.682
TkA07G348640
TkA08G080360
Chr08:20646033-20650475 (-)
GWHBCHF00000009
LXL04_007196
Chr02:38995697-38999584 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
77.400
查询 100.000 / 对象 40.395
TkA08G080360
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