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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 24458 条。当前显示第 190 / 245 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
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TkA07G118010
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TkA07G118110
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复杂
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JCVI_TKOH_00305 TkA07G134740
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Chr07:35008762-35009412 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_039348
ChrUn:3708626-3709369 (-)
JAJTUU010000010.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
97.700
查询 88.667 / 对象 73.481
TkA07G134960
TkA07G135180
Chr07:35057834-35068055 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_008933
Chr02:113112357-113124751 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
45.100
查询 53.856 / 对象 18.122
TkA07G135180
TkA07G136210
Chr07:35298795-35302604 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_016385
Chr03:120959945-120974281 (-)
CM104801.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
85.200
查询 100.000 / 对象 5.536
TkA07G136210
TkA07G136480
Chr07:35355871-35356570 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_010555
Chr02:148994112-148999951 (+)
CM104800.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
94.000
查询 91.156 / 对象 14.455
TkA07G136480
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