ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 3 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G075490
Chr01:19316556-19317511 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_021695
Chr04:135428997-135436454 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.200 查询 61.290 / 对象 28.178 |
TkA01G075490 | |
|
TkA01G075780
Chr01:19389033-19389362 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005211
Chr01:157804162-157804833 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
72.900 查询 98.165 / 对象 47.982 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G075780 |
|
TkA01G075810
Chr01:19393748-19394187 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005210
Chr01:157799482-157802344 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.180 / 对象 50.207 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G075810 |
|
TkA01G076490
Chr01:19546499-19546840 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005199
Chr01:157667143-157667484 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G076490 |
|
TkA01G076720
Chr01:19599771-19600172 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_000500
Chr01:9146906-9147373 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
42.400 查询 97.744 / 对象 95.484 |
TkA01G076720 | |
|
TkA01G076870
Chr01:19646611-19649701 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005194
Chr01:157529510-157532494 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 90.654 / 对象 45.972 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G076870 |
|
TkA01G077080
Chr01:19676293-19676682 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_008118
Chr02:87011612-87014160 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
74.600 查询 51.938 / 对象 24.906 |
TkA01G077080 | |
|
TkA01G077100
Chr01:19681451-19683692 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005197
Chr01:157558701-157563454 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.500 查询 94.605 / 对象 46.566 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G077100 |
|
TkA01G077360
Chr01:19735018-19738005 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005190
Chr01:157462733-157465437 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 97.610 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G077360 |
|
TkA01G077970
Chr01:19918455-19920866 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005177
Chr01:157199416-157202681 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 100.000 / 对象 59.459 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G077970 |
|
TkA01G078000
Chr01:19924164-19927621 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005176
Chr01:157194436-157197466 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 99.155 / 对象 85.167 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G078000 |
|
TkA01G078460
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_020184
Chr04:54948159-54951835 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.900 查询 21.512 / 对象 27.007 |
TkA01G078460 | |
|
TkA01G078520
Chr01:20062711-20064676 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005170
Chr01:157054740-157055947 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G078520 |
|
TkA01G079160
Chr01:20240744-20255697 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005162
Chr01:156778445-156794514 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 39.655 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G079160 |
|
TkA01G079290
Chr01:20281468-20282574 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005159
Chr01:156752161-156753813 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 99.185 / 对象 66.364 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G079290 |
|
TkA01G079300
Chr01:20283955-20287116 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005158
Chr01:156746806-156750112 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 47.028 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G079300 |
|
TkA01G079320
Chr01:20297113-20300011 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005157
Chr01:156732958-156736175 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 98.039 / 对象 41.737 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G079320 |
|
TkA01G079350
Chr01:20321446-20323326 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_034225
Chr07:92271751-92282025 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.700 查询 21.687 / 对象 32.331 |
TkA01G079350 | |
|
TkA01G079620
Chr01:20376449-20376820 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005156
Chr01:156655189-156656447 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 96.748 / 对象 53.604 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G079620 |
|
TkA01G080980
Chr01:20674765-20675633 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005108
Chr01:155002373-155002771 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00006 | TkA01G080980 |
|
TkA01G080990
Chr01:20676640-20677035 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005107
Chr01:155000791-155001186 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00006 | TkA01G080990 |
|
TkA01G081280
Chr01:20748322-20748792 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_006827
Chr02:26920798-26923156 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 99.359 / 对象 64.315 |
TkA01G081280 | |
|
TkA01G081310
Chr01:20757012-20757407 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005104
Chr01:154901682-154902077 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00006 | TkA01G081310 |
|
TkA01G083180
Chr01:21189501-21198637 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005049
Chr01:153728193-153732635 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.600 查询 98.371 / 对象 99.588 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G083180 |
|
TkA01G083370
Chr01:21255321-21259110 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005035
Chr01:153375750-153387934 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 100.000 / 对象 55.597 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G083370 |
|
TkA01G083500
Chr01:21301682-21304801 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005035
Chr01:153375750-153387934 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 99.430 / 对象 43.899 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G083500 |
|
TkA01G083710
Chr01:21362200-21366663 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005033
Chr01:153354628-153359572 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 47.132 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G083710 |
|
TkA01G083780
Chr01:21386638-21387548 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_034090
Chr07:80943708-80945666 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.500 查询 92.366 / 对象 56.034 |
TkA01G083780 | |
|
TkA01G083860
Chr01:21419414-21420625 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005029
Chr01:153315019-153325383 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 100.000 / 对象 23.818 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G083860 |
|
TkA01G084020
Chr01:21470230-21474755 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005027
Chr01:153301917-153309844 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 93.233 / 对象 30.718 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G084020 |
|
TkA01G084030
Chr01:21474891-21477484 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005027
Chr01:153301917-153309844 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.900 查询 98.870 / 对象 57.803 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G084030 |
|
TkA01G084570
Chr01:21593972-21597092 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005022
Chr01:153183119-153186109 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G084570 |
|
TkA01G087040
Chr01:22179266-22179664 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005005
Chr01:152547700-152551584 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 86.364 / 对象 44.882 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G087040 |
|
TkA01G088300
Chr01:22484157-22485597 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005084
Chr01:154315597-154322083 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.000 查询 100.000 / 对象 35.159 |
JCVI_TKOH_00008 | TkA01G088300 |
|
TkA01G088390
Chr01:22508564-22512154 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005082
Chr01:154307751-154313819 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.100 查询 96.893 / 对象 80.823 |
JCVI_TKOH_00008 | TkA01G088390 |
|
TkA01G088400
Chr01:22512487-22513277 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005082
Chr01:154307751-154313819 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 95.172 / 对象 10.714 |
JCVI_TKOH_00008 | TkA01G088400 |
|
TkA01G088610
Chr01:22557908-22558376 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005085
Chr01:154344819-154345287 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00008 | TkA01G088610 |
|
TkA01G088620
Chr01:22559171-22560349 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_014874
Chr03:58462601-58479414 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.900 查询 12.500 / 对象 9.703 |
TkA01G088620 | |
|
TkA01G088970
Chr01:22619982-22625878 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005089
Chr01:154362741-154367666 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.800 查询 95.445 / 对象 42.252 |
JCVI_TKOH_00008 | TkA01G088970 |
|
TkA01G089410
Chr01:22718115-22728834 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005094
Chr01:154400705-154420995 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 36.795 |
JCVI_TKOH_00008 | TkA01G089410 |
|
TkA01G089480
Chr01:22745062-22745604 (+)
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|
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.500 查询 68.462 / 对象 73.859 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.100 查询 38.710 / 对象 60.432 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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89.600 查询 59.503 / 对象 76.768 |
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100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.300 查询 96.133 / 对象 16.747 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 99.259 / 对象 24.453 |
TkA01G113410 |