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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 20 条。当前显示第 1 / 1 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA01G396850
Chr01:98951949-98954188 (+)
GWHBCHF00000002
LXL04_025460
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
58.200
查询 92.412 / 对象 22.321
TkA01G396850
TkA01G402830
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LXL04_025460
Chr05:112062747-112071342 (+)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
88.500
查询 95.980 / 对象 10.658
TkA01G402830
TkA01G422500
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GWHBCHF00000002
LXL04_025460
Chr05:112062747-112071342 (+)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
94.200
查询 100.000 / 对象 19.085
TkA01G422500
TkA01G422510
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CM104803.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
98.200
查询 92.916 / 对象 19.029
TkA01G422510
TkA02G178570
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
87.400
查询 100.000 / 对象 10.156
TkA02G178570
TkA02G434480
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GWHBCHF00000003
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
62.800
查询 87.500 / 对象 37.277
TkA02G434480
TkA02G568290
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GWHBCHF00000003
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
93.900
查询 100.000 / 对象 19.085
TkA02G568290
TkA03G125080
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CM104803.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
97.700
查询 92.916 / 对象 19.029
TkA03G125080
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
94.400
查询 96.460 / 对象 18.917
TkA03G125090
TkA04G130320
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
94.100
查询 96.460 / 对象 18.917
TkA04G130320
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
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查询 77.725 / 对象 18.917
TkA04G319870
TkA05G418680
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
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查询 93.991 / 对象 12.221
TkA05G418680
TkA05G463450
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
75.400
查询 86.525 / 对象 6.641
TkA05G463450
TkA06G080550
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
94.200
查询 100.000 / 对象 19.085
TkA06G080550
TkA06G155810
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CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
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查询 98.974 / 对象 35.714
TkA06G155810
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GWHBCHF00000007
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CM104803.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
97.600
查询 100.000 / 对象 14.174
TkA06G247480
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.800
查询 90.821 / 对象 10.491
TkA08G036030
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GWHBCHF00000009
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
98.200
查询 93.933 / 对象 25.056
TkA08G127300
TkA08G127310
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GWHBCHF00000009
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CM104803.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
98.500
查询 87.821 / 对象 7.645
TkA08G127310
TkA08G423410
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GWHBCHF00000009
LXL04_025460
Chr05:112062747-112071342 (+)
CM104803.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
94.400
查询 96.460 / 对象 18.917
TkA08G423410
1 / 1