TkAUNG096090 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG096090

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27175466-27177255 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1585 bp · TkAUNG096090|TK1151|cDNA

AACTCTCTGGTGAAATTCCGGCAAGTTTGTCTTCACCAAGGCTAAGCCTTATTGATTTGTCTAACAATATGCTGAGTGGGCGGGTGCCGGAATCTTTATTGGCGGTAGAGTATGGTGGTAGCTTCGCCGGAAATCCAGGGTTATGTGGCGACGGTAGCAGAGGTCTCAGGCAATGTTCGCTGGTTTCTCGTAGGTCCGGCGGGTTGGGAGTTGCGAAGTATTGCATCATCGGCGGTGTGCTAGTTTTAGTGTTGTCGTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

687 bp · TkAUNG096090|TK1151|CDS

ATGAGTGAGGACTCAAATCTACTTGTTTATGAGTACATGACTAGAGGTAGCTTATGGGATCGGCTACATACGGATCAGAAGATTGATATGGATTGGAAGGTTCGCTATGAAATTGCAGTGGGGGCCGCAAGGGGATTGGAGTACCTACATCACGGGTGTGATATACCTGTGATACATCGGGATGTGAAGTCGAGCAATATTTTGTTGGATGAGGACATGAAGCCGAAAATAGCTGATTTTGGACTTGCGAAGATCGTGCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

228 aa · TkAUNG096090|TK1151|PROTEIN

MSEDSNLLVYEYMTRGSLWDRLHTDQKIDMDWKVRYEIAVGAARGLEYLHHGCDIPVIHRDVKSSNILLDEDMKPKIADFGLAKIVQINNVMDSTHVIAGTYGYIAPEYGYTLNVNEKSDIYSFGVVLMELITGKKPVQPEFGENKDIVRWVQDKLRGNENPIALVDPTIPDDFKGHAVNAFTIAMHCTMRIPTLRPSMRMVVQMLEKIKPYSHIDIAIENDINVVKN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG096090`
TK1151 ID	TkAUNG096090
OH-1004 ID	LXL04_017256
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	75.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.053 / OH-1004 22.393 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG096090

位置 ChrUn:27175466-27177255 (+)

描述 Similar to RLK7: Receptor-like protein kinase 7

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g09970`	在病原体相关分子模式诱导的模式触发免疫信号传导中发挥作用。	RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4 The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331
`At3g19700`	通过负调控合胞体胚乳的细胞化来调节种子大小。	MINISEED3 (MINI3), a WRKY family gene, and HAIKU2 (IKU2), a leucine-rich repeat (LRR) KINASE gene, are regulators of seed size in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0508418102
`At5g49660`	受体激酶参与 C 末端编码的植物信号肽的感知以及根和芽发育的后续调节。	XYLEM INTERMIXED WITH PHLOEM1, a leucine-rich repeat receptor-like kinase required for stem growth and vascular development in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1489-6 CEP5 and XIP1/CEPR1 regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw231
`At1g08590`	参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。	暂无已核实直接文献
`At4g28650`	参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。	A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017256 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0009845 seed germination 生物过程

GO:0009960 endosperm development 生物过程

GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程

GO:0010311 lateral root formation 生物过程

GO:0010555 response to mannitol 生物过程

GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0048437 floral organ development 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G09970

ath:AT1G28440

ath:AT1G72180

ath:AT3G19700

ath:AT5G49660

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.509

排名 1 · TkAUNG096090 · TK1151

细胞质0.426

排名 2 · TkAUNG096090 · TK1151

细胞核0.205

排名 3 · TkAUNG096090 · TK1151

高尔基体0.049

排名 4 · TkAUNG096090 · TK1151

内质网0.045

排名 5 · TkAUNG096090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase3-203 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3-161 aa

PF12260PIP49_C7-81 aa

PF03109ABC147-90 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG096090	`PF00069`	Pkinase	3	203	1e-31	111.0
TkAUNG096090	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	3	161	3.5e-30	105.9
TkAUNG096090	`PF12260`	PIP49_C	7	81	0.076	13.3
TkAUNG096090	`PF03109`	ABC1	47	90	0.095	12.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4I2N7`	拟南芥	sp\|F4I2N7\|RLK7_ARATH Receptor-like protein kinase 7	60.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LJM4`	拟南芥	sp\|Q9LJM4\|IKU2_ARATH Receptor-like protein kinase HAIKU2	59.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FGL5`	拟南芥	sp\|Q9FGL5\|CEPR1_ARATH Receptor protein-tyrosine kinase CEPR1	51.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FRS6`	拟南芥	sp\|Q9FRS6\|PXL1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXL1	45.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9M0G7`	拟南芥	sp\|Q9M0G7\|MIK1_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 1	47.900%	Swiss-Prot	中等置信

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