基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkAUNG092120
当前版本: TK1151
染色体: ChrUn
坐标: 26110131-26114987
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2857 bp · TkAUNG092120|TK1151|cDNA
CTCATTTCCTTTCTTTTCCCTCGATAAATTAAACTCGGGAACAAGGTGTAACGGCGCGGGTTACTGGTTAGGACTTAGGACCTCGTAAACATGGAGTGGGTTTTGCAATGGAGTTGCTCTAAGAAACCAGTCCCTCTGTAACCTTTTAGGGCAAACACGATTAACTAACGAGGAAGACGAAGCTGCAAACACATTTCATAACCATTACCCGACCACCATTCGCCGTCGGCAATGATTCCGACCACCAGGCGACCCAAAAC...
CDS
下载 CDS FASTA2001 bp · TkAUNG092120|TK1151|CDS
ATGGGCTATCTCAATAGAGCGTCCAAAGCAATACAAGTAGCCAATCGCATACACAGACTCAGCTCCAATCATCACCACCACTACAGTTACAGGTTAGGGTTACCTTATTTTAGATCACATGAACACGGATTCTGCTCAAATTCACGGAATAGTAACCGCAAAGACGATAACAATGCCGTAGATTTGAGCCAATACCCTACCGACAAAATTCGAAACTTCTCAATTATTGCTCATGTTGATCATGGAAAATCTACACTCGC...
666 aa · TkAUNG092120|TK1151|PROTEIN
MGYLNRASKAIQVANRIHRLSSNHHHHYSYRLGLPYFRSHEHGFCSNSRNSNRKDDNNAVDLSQYPTDKIRNFSIIAHVDHGKSTLADRLLELTGTIKRGHGAQYLDKLQVERERGITVKAQTATMFYNYEPKETTSTSYLLNLVDTPGHVDFSYEVSRSLAACQGALLVVDAAQGVQAQTVANFYLAFESNLSIIPIINKIDQPTADPDRVKSQLQSMFDLDPKDVLLTSAKTGQGLEHVIPAVIERIPPPPGNCDSNL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkAUNG092120 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkAUNG092120 |
| OH-1004 ID | LXL04_019998 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 27.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 64.565 / OH-1004 63.596覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkAUNG092120 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | ChrUn:26110131-26114987 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to bipA: 50S ribosomal subunit assembly factor BipA (Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000027 ribosomal large subunit assembly 生物过程 GO:0006412 translation 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0010467 gene expression 生物过程 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:1990904 ribonucleoprotein complex 细胞组分 GO:0000049 tRNA binding 分子功能 GO:0003924 GTPase activity 分子功能 GO:0005525 GTP binding 分子功能 GO:0019843 rRNA binding 分子功能 GO:0043022 ribosome binding 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ecc:c4820 ecj:JW5571 eco:b3871 ecoc:C3026_20930 heo:C694_02460 hpj:jhp_0432 hpy:HP_0480 sfl:SF3941 sfx:S3805 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
线粒体0.820
质体0.158
细胞质0.050
细胞核0.034
细胞膜0.014
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00009GTP_EFTU69-251 aaPF01926MMR_HSR179-201 aaPF09439SRPRB114-187 aaPF00071Ras134-249 aaPF03170CBM_BcsB_1st147-170 aaPF14492EFG_III207-225 aaPF03144GTP_EFTU_D2274-343 aaPF14492EFG_III362-431 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkAUNG092120 | PF00009 | GTP_EFTU | 69 | 251 | 1e-53 | 182.4 |
| TkAUNG092120 | PF01926 | MMR_HSR1 | 79 | 201 | 0.00047 | 21.0 |
| TkAUNG092120 | PF09439 | SRPRB | 114 | 187 | 0.088 | 12.9 |
| TkAUNG092120 | PF00071 | Ras | 134 | 249 | 0.05 | 13.9 |
| TkAUNG092120 | PF03170 | CBM_BcsB_1st | 147 | 170 | 0.043 | 14.3 |
| TkAUNG092120 | PF14492 | EFG_III | 207 | 225 | 0.00075 | 20.2 |
| TkAUNG092120 | PF03144 | GTP_EFTU_D2 | 274 | 343 | 5.9e-05 | 24.1 |
| TkAUNG092120 | PF14492 | EFG_III | 362 | 431 | 0.00075 | 20.2 |
| TkAUNG092120 | PF16658 | RF3_C | 363 | 432 | 0.013 | 16.0 |
| TkAUNG092120 | PF00679 | EFG_C | 471 | 554 | 3.3e-22 | 79.0 |
| TkAUNG092120 | PF03170 | CBM_BcsB_1st | 531 | 567 | 0.043 | 14.3 |
| TkAUNG092120 | PF06421 | LepA_C | 558 | 664 | 1.3e-49 | 167.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。