基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkAUNG085760
当前版本: TK1151
染色体: ChrUn
坐标: 24411492-24416156
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2486 bp · TkAUNG085760|TK1151|cDNA
ATGAAAGTAAGATCATAACCAAATCCAGAATAAGACCTAAAAAAGTCAGTAACCTCATGACAAATTCTGCTGTTTATTCAAACTAAAATTATAGGGCTGGAGTTCTTCCCGTAACTACTCAAAGCTCTGGTTCTACTGTATACTTCAATCAATTCAAATGTCGCAATTTTGGAAGCCAGGGACGGCGAAGCCTCGCCTGCTCGACGACGAAGAAGGCGGCGTTCTTTTCTACTCCGCTTCCCCCTCCTCCTCATCCACAT...
CDS
下载 CDS FASTA2088 bp · TkAUNG085760|TK1151|CDS
ATGTCGCAATTTTGGAAGCCAGGGACGGCGAAGCCTCGCCTGCTCGACGACGAAGAAGGCGGCGTTCTTTTCTACTCCGCTTCCCCCTCCTCCTCATCCACATATGGGTTTGCGAGCTTAGAGAGCCAGAGGCACCGATTACCTGTATTCAAGTACAGAACGCAAATTCTATATCTGGTGGAGACTCACTCCACTACCATAATAGTCGGCGAAACAGGGAGTGGGAAAACGACTCAAATCCCTCAGTATCTTAAGGAAGC...
695 aa · TkAUNG085760|TK1151|PROTEIN
MSQFWKPGTAKPRLLDDEEGGVLFYSASPSSSSTYGFASLESQRHRLPVFKYRTQILYLVETHSTTIIVGETGSGKTTQIPQYLKEAGWADGGRIIACTQPRRLAVQSVAARVAEEMGVKLGEEVGYTIRFEDVTNSEFTRIKFLTDGVLLREMMDDPLLSKYSVIMVDEAHERSVSTDILLGLLKKIQRRRPELRLIIASATIEAKSMAEFFHNRKRRAQLEGEDNKLQIEPAILSVEGRGYNVEMFYVEEPVSDYLQA...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkAUNG085760 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkAUNG085760 |
| OH-1004 ID | LXL04_027311 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 99.600 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkAUNG085760 |
|---|---|
| 位置 | ChrUn:24411492-24416156 (-) |
| 描述 | Similar to At4g18465: Probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH9 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程 GO:0006397 mRNA processing 生物过程 GO:0008380 RNA splicing 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 GO:0005681 spliceosomal complex 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0016604 nuclear body 细胞组分 GO:0071006 U2-type catalytic step 1 spliceosome 细胞组分 GO:0071007 U2-type catalytic step 2 spliceosome 细胞组分 GO:0071013 catalytic step 2 spliceosome 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G18465 ddi:DDB_G0291183 hsa:60625 mmu:217207 pon:100172442 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.437
细胞质0.433
线粒体0.107
过氧化物酶体0.089
质体0.061
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12775AAA_752-86 aaPF20720nSTAND357-81 aaPF13086AAA_1158-150 aaPF00270DEAD59-210 aaPF00437T2SSE59-86 aaPF04851ResIII61-176 aaPF13401AAA_2262-190 aaPF13245AAA_1962-191 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkAUNG085760 | PF12775 | AAA_7 | 52 | 86 | 0.036 | 14.3 |
| TkAUNG085760 | PF20720 | nSTAND3 | 57 | 81 | 0.076 | 13.4 |
| TkAUNG085760 | PF13086 | AAA_11 | 58 | 150 | 0.099 | 13.1 |
| TkAUNG085760 | PF00270 | DEAD | 59 | 210 | 3.6e-08 | 34.1 |
| TkAUNG085760 | PF00437 | T2SSE | 59 | 86 | 0.14 | 11.5 |
| TkAUNG085760 | PF04851 | ResIII | 61 | 176 | 0.054 | 14.1 |
| TkAUNG085760 | PF13401 | AAA_22 | 62 | 190 | 3e-07 | 31.5 |
| TkAUNG085760 | PF13245 | AAA_19 | 62 | 191 | 0.00024 | 22.0 |
| TkAUNG085760 | PF13604 | AAA_30 | 62 | 198 | 0.00091 | 19.8 |
| TkAUNG085760 | PF13476 | AAA_23 | 62 | 78 | 0.15 | 13.4 |
| TkAUNG085760 | PF13555 | AAA_29 | 62 | 79 | 0.17 | 12.4 |
| TkAUNG085760 | PF25199 | nSTAND_NTPase5 | 64 | 103 | 0.17 | 12.4 |
| TkAUNG085760 | PF00448 | SRP54 | 65 | 123 | 0.34 | 11.2 |
| TkAUNG085760 | PF00437 | T2SSE | 139 | 152 | 0.14 | 11.5 |
| TkAUNG085760 | PF25199 | nSTAND_NTPase5 | 164 | 208 | 0.17 | 12.4 |
| TkAUNG085760 | PF22590 | Cas3-like_C_2 | 176 | 206 | 0.092 | 13.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。