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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG083360
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 23703087-23704991 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1023 bp · TkAUNG083360|TK1151|cDNA

TCTGCGTCTGTGGTCTCTGACGATTCCAAAGAAATTCTCGTCGTCTCTCTCTCGTCTCTCTCCCTCTCTCCACAACAGTTATCGAAATTGATCGGGGAGGAACATAGTTTCCTCACTTCTTAACATTACCATGGATACGCCAAGCTCCTGGGATTCCTTGCGAAAACAGGCAAGGAATCTTGAAGCAGAATTGGATGATCAAATGCATTTGTACCGTAAACTTGTGTCCACAAAAGTTGATGATGGCACTGAGAGTAACC...

CDS

下载 CDS FASTA

666 bp · TkAUNG083360|TK1151|CDS

ATGGATACGCCAAGCTCCTGGGATTCCTTGCGAAAACAGGCAAGGAATCTTGAAGCAGAATTGGATGATCAAATGCATTTGTACCGTAAACTTGTGTCCACAAAAGTTGATGATGGCACTGAGAGTAACCTTGGATCAAGTATAGAACAGCTACTTAAACAACTACACCAAGTAATCTCCCAAATGCAAGCTTGGGTGTCATCAGGTGGTTCAGAGATCTTTTCTCATACATTGACACGTCATCAAGAAATTCATCATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

221 aa · TkAUNG083360|TK1151|PROTEIN

MDTPSSWDSLRKQARNLEAELDDQMHLYRKLVSTKVDDGTESNLGSSIEQLLKQLHQVISQMQAWVSSGGSEIFSHTLTRHQEIHHDLTQEFNRLRSSLRAKREHASLLEDFREFDRARLDIEEGGGGEQQSLLKERASLMRNTGQVDGVISQAQETLGALVFQRSTFRGVNSKLSNVSSRLPSVNSIISAINKKKSMDTIILSLVASVCTFLILIYWLTK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG083360
TK1151 IDTkAUNG083360
OH-1004 IDLXL04_005354
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG083360
位置ChrUn:23703087-23704991 (-)
描述Similar to GOS11: Golgi SNAP receptor complex member 1-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15880 参与从内质网（ER）到高尔基体的运输以及高尔基体内部的运输。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005354 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0006891 intra-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0006906 vesicle fusion 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程
GO:0048219 inter-Golgi cisterna vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15880
ath:AT2G45200
bta:511030
cge:100689312
hsa:9527
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.696
排名 1 · TkAUNG083360 · TK1151
内质网0.265
排名 2 · TkAUNG083360 · TK1151
细胞质0.170
排名 3 · TkAUNG083360 · TK1151
细胞核0.059
排名 4 · TkAUNG083360 · TK1151
溶酶体／液泡0.053
排名 5 · TkAUNG083360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF127294HB_MCP_13-72 aa
PF25587Rv2743c5-33 aa
PF27017GOSR1_N6-112 aa
PF29080UPF0507_helical6-63 aa
PF03908Sec208-30 aa
PF18035Bap31_Bap29_C8-36 aa
PF25486DUF79098-60 aa
PF06785UPF024210-110 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG083360PF127294HB_MCP_13720.1312.6
TkAUNG083360PF25587Rv2743c5330.2311.8
TkAUNG083360PF27017GOSR1_N61123.8e-1660.2
TkAUNG083360PF29080UPF0507_helical6630.3212.5
TkAUNG083360PF03908Sec208300.001319.3
TkAUNG083360PF18035Bap31_Bap29_C8360.01116.5
TkAUNG083360PF25486DUF79098600.2611.5
TkAUNG083360PF06785UPF0242101101.010.1
TkAUNG083360PF00143Interferon11330.1712.7
TkAUNG083360PF15324TALPID3131090.111.1
TkAUNG083360PF01442Apolipoprotein141010.0713.5
TkAUNG083360PF20609pAdhesive_1719680.09312.9
TkAUNG083360PF10392COG5_N31990.1113.4
TkAUNG083360PF25587Rv2743c39970.2311.8
TkAUNG083360PF18052Rx_N42640.1812.6
TkAUNG083360PF04513Baculo_PEP_C42840.4811.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMP7拟南芥sp|Q9LMP7|GOS11_ARATH Golgi SNAP receptor complex member 1-173.200%Swiss-Prot高置信

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