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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG066120
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 19230470-19232412 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1254 bp · TkAUNG066120|TK1151|cDNA

ATGGAAAATGCTAATCACTTATCTCCCCTGCAGACTAAGAAGCGGAAGTTTTCGCCGATTGTTTGGGATAGAGATGATAGAGAGGTAAGCAGATCAAATAAAAGTAGAAATACACTGGATACTACTAACACTTCCACGCCATCACCCCGATTGGTTGAGTTGAATCGCCGATCACCTTTCCCGGAACCTACTCCAGATGAAAATGTGGAGACTTCAGTCACAGATGGAGATGAAGGTGAGATTTCTGATTACGAAAATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1254 bp · TkAUNG066120|TK1151|CDS

ATGGAAAATGCTAATCACTTATCTCCCCTGCAGACTAAGAAGCGGAAGTTTTCGCCGATTGTTTGGGATAGAGATGATAGAGAGGTAAGCAGATCAAATAAAAGTAGAAATACACTGGATACTACTAACACTTCCACGCCATCACCCCGATTGGTTGAGTTGAATCGCCGATCACCTTTCCCGGAACCTACTCCAGATGAAAATGTGGAGACTTCAGTCACAGATGGAGATGAAGGTGAGATTTCTGATTACGAAAATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

417 aa · TkAUNG066120|TK1151|PROTEIN

MENANHLSPLQTKKRKFSPIVWDRDDREVSRSNKSRNTLDTTNTSTPSPRLVELNRRSPFPEPTPDENVETSVTDGDEGEISDYENVANSRRKSSSEFGEVRGHSKSISPEVGDVKREGSEGTRGRSLGSDERVRSSSRDSYQDNDDNTDSMEIDDDRHHDGARFSHSETGSEDDHGSPGTPEPAQPPQRSVNMLQGCRSVDEFERLNKIDEGTYGVVFRARDKKTGEIVALKKVKMEKEREGFPMTSLREINILLSFDH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG066120
TK1151 IDTkAUNG066120
OH-1004 IDLXL04_035707
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)51.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 52.518 / OH-1004 43.015
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG066120
位置ChrUn:19230470-19232412 (-)
描述Similar to CDKC-1: Cyclin-dependent kinase C-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XUW1 细胞周期蛋白dependent kinase G-2。 暂无已核实直接文献
Os04g0488000 细胞周期蛋白dependent kinase G-2。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X6X1 细胞周期蛋白dependent kinase G-1。 暂无已核实直接文献
Os02g0602100 细胞周期蛋白dependent kinase G-1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035707 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0032968 positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II 生物过程
GO:0048440 carpel development 生物过程
GO:0050792 regulation of viral process 生物过程
GO:0000307 cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0016604 nuclear body 细胞组分
GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G10270
ath:AT5G64960
dosa:Os01g0958000
dosa:Os05g0389700
osa:9268645
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.893
排名 1 · TkAUNG066120 · TK1151
细胞质0.247
排名 2 · TkAUNG066120 · TK1151
细胞膜0.031
排名 3 · TkAUNG066120 · TK1151
线粒体0.025
排名 4 · TkAUNG066120 · TK1151
内质网0.016
排名 5 · TkAUNG066120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase204-411 aa
PF14531Kinase-like206-245 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr207-400 aa
PF03109ABC1216-234 aa
PF21208euk_SelB_III246-277 aa
PF06293Kdo261-344 aa
PF25593GldD_lipo273-297 aa
PF01163RIO1277-348 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG066120PF00069Pkinase2044111e-63215.9
TkAUNG066120PF14531Kinase-like2062453.9e-0730.4
TkAUNG066120PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2074006.7e-35121.4
TkAUNG066120PF03109ABC12162341.5e-0525.0
TkAUNG066120PF21208euk_SelB_III2462770.06514.5
TkAUNG066120PF06293Kdo2613440.07613.2
TkAUNG066120PF25593GldD_lipo2732970.08413.5
TkAUNG066120PF01163RIO12773480.03214.5
TkAUNG066120PF14531Kinase-like2783913.9e-0730.4
TkAUNG066120PF03109ABC12793561.5e-0525.0
TkAUNG066120PF12330Haspin_kinase3263530.06513.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A2XUW1水稻sp|A2XUW1|CDKG2_ORYSI Cyclin-dependent kinase G-258.200%Swiss-Prot高置信
Q7XUF4水稻sp|Q7XUF4|CDKG2_ORYSJ Cyclin-dependent kinase G-258.200%Swiss-Prot高置信
A2X6X1水稻sp|A2X6X1|CDKG1_ORYSI Cyclin-dependent kinase G-187.200%Swiss-Prot中等置信
Q6K5F8水稻sp|Q6K5F8|CDKG1_ORYSJ Cyclin-dependent kinase G-187.200%Swiss-Prot中等置信

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