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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG022790
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 6081432-6083913 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1684 bp · TkAUNG022790|TK1151|cDNA

CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTATATGTACTGAAAGCGCACACACAAACATCTGTAAATATATACAGATAAAACCCAGTGATTTATGCGATCTTTTGATTAAGCTAGAATGAGGACTTCAATGGCGGATTGGTGGGAAACTTGGCCAGCAAAAACAGCAGAATCTCTCTTTTCTTTCATGAACACATTAGTTTTCGTTTTTCTTGATTTGTTGGATACCATAATGTGCGTTTTCTTCAGATATGTTGATGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1293 bp · TkAUNG022790|TK1151|CDS

ATGAGGACTTCAATGGCGGATTGGTGGGAAACTTGGCCAGCAAAAACAGCAGAATCTCTCTTTTCTTTCATGAACACATTAGTTTTCGTTTTTCTTGATTTGTTGGATACCATAATGTGCGTTTTCTTCAGATATGTTGATGAGATTTTGGAGGGAAAGTCAACCCCATGTTATTGTCGAAGTCAAGGTCGAATTAATGGCTGTGAAGATAAAGACATTGGGATTTCAGATACTCTATTTGGAAGGAAAAACGTGTTTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

430 aa · TkAUNG022790|TK1151|PROTEIN

MRTSMADWWETWPAKTAESLFSFMNTLVFVFLDLLDTIMCVFFRYVDEILEGKSTPCYCRSQGRINGCEDKDIGISDTLFGRKNVFREIGFTRITQPKVSLSSNNTGTDDLREIRWSDCGCESCVSWINNGDDQKLHVVVKESSEGYQDSGKNVIFLHGFLSSSFLWTETVFPELGNSKYRLFAVDLLGFGNSPKPRECLYTLNDHLEMVEKSVIQRFNLTSFHLVAHSMGCIIALALAAKHPNNLKSITLIAPPYFLSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG022790
TK1151 IDTkAUNG022790
OH-1004 IDLXL04_026343
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG022790
位置ChrUn:6081432-6083913 (+)
描述Similar to BDG4: Probable lysophospholipase BODYGUARD 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g17780 参与角质层发育和形态发生。 暂无已核实直接文献
At5g17720 参与角质层发育和形态发生。 暂无已核实直接文献
At1g64670 通过促进角质和木栓质单体的装载，调控角质层的发育及形态发生。
The plant cuticle is required for osmotic stress regulation of abscisic acid biosynthesis and osmotic stress tolerance in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081943
At5g41900 参与角质层发育和形态发生。 暂无已核实直接文献
At4g24140 参与角质层发育和形态发生。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026343 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程
GO:0010148 transpiration 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:1901959 positive regulation of cutin biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64670
ath:AT4G24140
ath:AT5G17720
ath:AT5G17780
ath:AT5G41900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.306
排名 1 · TkAUNG022790 · TK1151
高尔基体0.205
排名 2 · TkAUNG022790 · TK1151
细胞核0.154
排名 3 · TkAUNG022790 · TK1151
细胞膜0.149
排名 4 · TkAUNG022790 · TK1151
细胞质0.117
排名 5 · TkAUNG022790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07819PGAP1150-162 aa
PF29535CMFA_C150-174 aa
PF12146Hydrolase_4152-404 aa
PF00561Abhydrolase_1153-405 aa
PF12697Abhydrolase_6154-415 aa
PF02089Palm_thioest154-249 aa
PF10230LIDHydrolase177-403 aa
PF07819PGAP1202-257 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG022790PF07819PGAP11501620.01116.2
TkAUNG022790PF29535CMFA_C1501740.2711.3
TkAUNG022790PF12146Hydrolase_41524046.1e-1762.5
TkAUNG022790PF00561Abhydrolase_11534051.4e-29104.2
TkAUNG022790PF12697Abhydrolase_61544153e-1867.9
TkAUNG022790PF02089Palm_thioest1542490.08713.2
TkAUNG022790PF10230LIDHydrolase1774031.1e-0629.3
TkAUNG022790PF07819PGAP12022570.01116.2
TkAUNG022790PF20408Abhydrolase_112122750.03414.6
TkAUNG022790PF12695Abhydrolase_52132540.01715.6
TkAUNG022790PF29535CMFA_C2192460.2711.3
TkAUNG022790PF06821Ser_hydrolase2222649.9e-0523.0
TkAUNG022790PF24322Tle32232660.1112.7
TkAUNG022790PF00756Esterase2252870.004717.4
TkAUNG022790PF20408Abhydrolase_113584040.03414.6
TkAUNG022790PF12695Abhydrolase_53664040.01715.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q700D5拟南芥sp|Q700D5|BDG4_ARATH Probable lysophospholipase BODYGUARD 451.400%Swiss-Prot高置信
Q9FN79拟南芥sp|Q9FN79|BDG5_ARATH Probable lysophospholipase BODYGUARD 548.100%Swiss-Prot中等置信
Q8LFX7拟南芥sp|Q8LFX7|BDG1_ARATH Probable lysophospholipase BODYGUARD 140.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FJ24拟南芥sp|Q9FJ24|BDG2_ARATH Probable lysophospholipase BODYGUARD 238.100%Swiss-Prot中等置信
O22977拟南芥sp|O22977|BDG3_ARATH Probable lysophospholipase BODYGUARD 345.000%Swiss-Prot中等置信

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