RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G245250
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 64102986-64103481 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

361 bp · TkA08G245250|TK1151|cDNA

CCTCTATGGAGGGGCAATGGCTCAATCATCAGGGTGCACAAGTGTGCTAATTAGCTTGTCTCCATGTTTAAACTACATTTCTGGCAACACATCGACACCATCATCAGGATGTTGCAGCCAACTGGCTAGCGTGGTTCAGTCACAGCCACAATGCCTATGTCAAGTACTTAATGGTGGTGGCTCATCTTTGGGTCTTAGCATTAACCAAACTCAGGCTCTTGAGTTACCAAACGCCTGCAATGTCCAAACACCACCAACTA...

CDS

下载 CDS FASTA

345 bp · TkA08G245250|TK1151|CDS

ATGGCTCAATCATCAGGGTGCACAAGTGTGCTAATTAGCTTGTCTCCATGTTTAAACTACATTTCTGGCAACACATCGACACCATCATCAGGATGTTGCAGCCAACTGGCTAGCGTGGTTCAGTCACAGCCACAATGCCTATGTCAAGTACTTAATGGTGGTGGCTCATCTTTGGGTCTTAGCATTAACCAAACTCAGGCTCTTGAGTTACCAAACGCCTGCAATGTCCAAACACCACCAACTAGTCGATGCAATGCTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

115 aa · TkA08G245250|TK1151|PROTEIN

MAQSSGCTSVLISLSPCLNYISGNTSTPSSGCCSQLASVVQSQPQCLCQVLNGGGSSLGLSINQTQALELPNACNVQTPPTSRCNAASPSDSPSGTTPSSENTPSSSGNSPSGNP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G245250
TK1151 IDTkA08G245250
OH-1004 IDLXL04_033280
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 80.870 / OH-1004 56.707
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G245250
位置Chr08:64102986-64103481 (-)
描述Similar to At2g13820: Non-specific lipid-transfer protein-like protein At2g13820
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g22600 参与种子和胚珠成熟发育的脂质转移蛋白，可能通过调控木栓质和孢粉素生物合成或沉积过程中的脂肪酸稳态发挥作用。
Involvement of lipid transfer proteins in resistance against a non-host powdery mildew in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1111/mpp.12740
At4g14815 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g48130 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g03103 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g27130 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033280 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002240 response to molecule of oomycetes origin 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0015908 fatty acid transport 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03103
ath:AT2G13820
ath:AT2G48130
ath:AT3G22600
ath:AT4G14815
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.476
排名 1 · TkA08G245250 · TK1151
细胞膜0.177
排名 2 · TkA08G245250 · TK1151
细胞质0.165
排名 3 · TkA08G245250 · TK1151
内质网0.135
排名 4 · TkA08G245250 · TK1151
细胞核0.081
排名 5 · TkA08G245250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14368LTP_25-84 aa
PF00234Tryp_alpha_amyl7-84 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G245250PF14368LTP_25841.9e-1867.1
TkA08G245250PF00234Tryp_alpha_amyl7841.2e-1351.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJ86拟南芥sp|Q9LJ86|LTPG5_ARATH Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 572.600%Swiss-Prot高置信
Q2PE59拟南芥sp|Q2PE59|LTG26_ARATH Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 2663.200%Swiss-Prot高置信
Q7EB72拟南芥sp|Q7EB72|LTG15_ARATH Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1560.700%Swiss-Prot高置信
F4HZB9拟南芥sp|F4HZB9|LTG19_ARATH Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1956.800%Swiss-Prot中等置信
Q9ZVC7拟南芥sp|Q9ZVC7|LTG12_ARATH Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1233.300%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看