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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G234140
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 61036670-61038254 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

965 bp · TkA08G234140|TK1151|cDNA

GATAAAATGTGTTGCATCACTATTCAATCTTCATACAGAGCTCCGTAGAGAAGGAGAAAATGGCGTTTAACCTTTCTTCTCCTTCACCTTCCGCAATTACACTTCTGCCTTCTCAGTCAAACGCTCGACATGCTCTTAAATCCAATTTGAAGTTGATAAGCAATCATCGAGTGAGATGTAGCGCAGAACCCGAAAGCGCCTCAAATGTTCCAGACACCTCAGAGGAACCTATCACGACAAAGCCGCAAAACCAATTGACA...

CDS

下载 CDS FASTA

576 bp · TkA08G234140|TK1151|CDS

ATGGCGTTTAACCTTTCTTCTCCTTCACCTTCCGCAATTACACTTCTGCCTTCTCAGTCAAACGCTCGACATGCTCTTAAATCCAATTTGAAGTTGATAAGCAATCATCGAGTGAGATGTAGCGCAGAACCCGAAAGCGCCTCAAATGTTCCAGACACCTCAGAGGAACCTATCACGACAAAGCCGCAAAACCAATTGACATCACGAAGAATATGTCTAGCATGTTTAACTTCATCATTACCTTTAATAAGCAATTCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

191 aa · TkA08G234140|TK1151|PROTEIN

MAFNLSSPSPSAITLLPSQSNARHALKSNLKLISNHRVRCSAEPESASNVPDTSEEPITTKPQNQLTSRRICLACLTSSLPLISNSSSRHNQASAIGSDAKERPAACRNCGGGGAIICEMCGGTGKWKALNRKRAKDTYEFTECPNCYGRGKLVCPVCLGTGLPNNKGLLRRPDAKQLLEKMYNGRLLPNS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G234140
TK1151 IDTkA08G234140
OH-1004 IDLXL04_033138
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 88.426
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G234140
位置Chr08:61036670-61038254 (-)
描述Similar to PSA2: Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g34860 参与雌配子体发育。
A thylakoid membrane protein harboring a DnaJ-type zinc finger domain is required for photosystem I accumulation in plants.2014 · DOI: 10.1074/jbc.m114.587758
The DnaJ-Like Zinc Finger Domain Protein PSA2 Affects Light Acclimation and Chloroplast Development in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.3389/fpls.2016.00360

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0463900 核基因组编码的因子，在植物发育过程中光系统 I (PSI) 的积累中必需。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033138 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009561 megagametogenesis 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0048564 photosystem I assembly 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009543 chloroplast thylakoid lumen 细胞组分
GO:0031977 thylakoid lumen 细胞组分
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0047134 protein-disulfide reductase [NAD(P)H] activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G34860
dosa:Os08g0463900
osa:4345779
zma:100277608
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.982
排名 1 · TkA08G234140 · TK1151
细胞核0.022
排名 2 · TkA08G234140 · TK1151
线粒体0.020
排名 3 · TkA08G234140 · TK1151
细胞质0.013
排名 4 · TkA08G234140 · TK1151
细胞膜0.012
排名 5 · TkA08G234140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21002TMEM106_N42-75 aa
PF30758Orange_C56-77 aa
PF00684DnaJ_CXXCXGXG67-75 aa
PF30758Orange_C72-129 aa
PF23733GRXCR1-2_C72-75 aa
PF21002TMEM106_N89-126 aa
PF00684DnaJ_CXXCXGXG98-115 aa
PF15777Anti-TRAP105-116 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G234140PF21002TMEM106_N42756.88.1
TkA08G234140PF30758Orange_C56771.3e-0732.6
TkA08G234140PF00684DnaJ_CXXCXGXG67750.0006320.7
TkA08G234140PF30758Orange_C721291.3e-0732.6
TkA08G234140PF23733GRXCR1-2_C72750.002318.5
TkA08G234140PF21002TMEM106_N891266.88.1
TkA08G234140PF00684DnaJ_CXXCXGXG981150.0006320.7
TkA08G234140PF15777Anti-TRAP1051160.08413.6
TkA08G234140PF25436BSD2_CRD1061250.0004721.0
TkA08G234140PF25112zf-AtTam371061280.3312.4
TkA08G234140PF30758Orange_C1071631.3e-0732.6
TkA08G234140PF00684DnaJ_CXXCXGXG1071620.0006320.7
TkA08G234140PF23733GRXCR1-2_C1071580.002318.5
TkA08G234140PF17302DUF53511071144.58.4
TkA08G234140PF17302DUF53511131264.58.4
TkA08G234140PF15777Anti-TRAP1181520.08413.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64750拟南芥sp|O64750|PSA2_ARATH Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic69.000%Swiss-Prot中等置信
Q6YUA8水稻sp|Q6YUA8|PSA22_ORYSJ Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic65.200%Swiss-Prot高置信

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