TkA08G145590 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G145590

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 37945912-37951992 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1296 bp · TkA08G145590|TK1151|cDNA

CACACATTCATGCACCACACATCAAATGTTTTACATTCCGCATTACATATCTCTGTACAAAGCCATCATTACCTAGTACAATGAAGTATTGGGCTTTGAGTATTCATAACTCATGGTTATATTGTACGTTGATGCTGATGGTGATACATATTCTTATGTTTGGGCAAACACAAGGGAATTGTACAGAAGAGGAGCGAAAGGCACTACTTGAAATCAAAGCCTCCTATATGAAGTCACATGATTCAGAAATTGACAATTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3243 bp · TkA08G145590|TK1151|CDS

ATGAAGTATTGGGCTTTGAGTATTCATAACTCATGGTTATATTGTACGTTGATGCTGATGGTGATACATATTCTTATGTTTGGGCAAACACAAGGGAATTGTACAGAAGAGGAGCGAAAGGCACTACTTGAAATCAAAGCCTCCTATATGAAGTCACATGATTCAGAAATTGACAATTTTCTCCCCACCTGGGTTGATTATGGCGGTAGTACCCTTGAGGATGATGGCAGCGACTGCTGTGATTGGGAGAGGGTCACCTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1080 aa · TkA08G145590|TK1151|PROTEIN

MKYWALSIHNSWLYCTLMLMVIHILMFGQTQGNCTEEERKALLEIKASYMKSHDSEIDNFLPTWVDYGGSTLEDDGSDCCDWERVTCNTTTGHVIDLSLYKLRGLDTYNGYGSNLWALNVSLFLHFNELTSLSLSDDFIDKKTMQTGLENLKKLEVLDLSFNYDVGNDILQSFKTLTSLKILDLSHTSLNGYFPISELSHLTNLEELDLSYNQLNDTPDIQACNSLSRLKRLENINLSGNRFNNSIISCLTALPSLKILY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G145590`
TK1151 ID	TkA08G145590
OH-1004 ID	LXL04_032050
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.907 / OH-1004 79.955 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G145590

位置 Chr08:37945912-37951992 (-)

描述 Similar to RLP1: Receptor-like protein 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g74180`	类受体蛋白14。	暂无已核实直接文献
`At2g25470`	类受体蛋白 21。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q9SLI6`	推定受体样蛋白8。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q70CT4`	类受体蛋白8。	暂无已核实直接文献
`At1g58195`	类受体蛋白9b。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032050 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002218 activation of innate immune response 生物过程

GO:0002242 defense response to parasitic plant 生物过程

GO:0002752 cell surface pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程

GO:0002768 immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0051606 detection of stimulus 生物过程

GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G07390

ath:AT1G74170

ath:AT2G25470

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.861

排名 1 · TkA08G145590 · TK1151

内质网0.092

排名 2 · TkA08G145590 · TK1151

细胞质0.058

排名 3 · TkA08G145590 · TK1151

细胞核0.040

排名 4 · TkA08G145590 · TK1151

溶酶体／液泡0.027

排名 5 · TkA08G145590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_237-88 aa

PF25019LRR_R13L1-DRL21108-159 aa

PF29594LRR_SKP2109-184 aa

PF13855LRR_8113-162 aa

PF00560LRR_1121-133 aa

PF12799LRR_4122-162 aa

PF25013LRR_Zer-1123-191 aa

PF24758LRR_At5g56370124-166 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G145590	`PF08263`	LRRNT_2	37	88	2e-06	28.7
TkA08G145590	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	108	159	0.047	14.3
TkA08G145590	`PF29594`	LRR_SKP2	109	184	0.00029	20.9
TkA08G145590	`PF13855`	LRR_8	113	162	1.6e-51	172.6
TkA08G145590	`PF00560`	LRR_1	121	133	1.5e-46	147.0
TkA08G145590	`PF12799`	LRR_4	122	162	1.2e-33	115.0
TkA08G145590	`PF25013`	LRR_Zer-1	123	191	2.2e-06	28.6
TkA08G145590	`PF24758`	LRR_At5g56370	124	166	0.00081	19.8
TkA08G145590	`PF23598`	LRR_14	128	264	3e-28	99.3
TkA08G145590	`PF29594`	LRR_SKP2	129	275	0.00029	20.9
TkA08G145590	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	142	230	0.047	14.3
TkA08G145590	`PF23247`	LRR_RPS2	142	209	0.11	13.2
TkA08G145590	`PF24048`	LRR_NXF1-5	144	217	3.8	7.9
TkA08G145590	`PF23211`	LRR_LRWD1	146	215	0.011	16.2
TkA08G145590	`PF13516`	LRR_6	152	172	0.082	13.7
TkA08G145590	`PF13855`	LRR_8	153	214	1.6e-51	172.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4HTV4`	拟南芥	sp\|F4HTV4\|RLP14_ARATH Receptor-like protein 14	31.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SKK2`	拟南芥	sp\|Q9SKK2\|RLP21_ARATH Receptor like protein 21	33.800%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SLI6`	拟南芥	sp\|Q9SLI6\|RLP8X_ARATH Putative receptor-like protein 8	37.900%	Swiss-Prot	低置信
`Q70CT4`	拟南芥	sp\|Q70CT4\|RLP8_ARATH Receptor-like protein 8	37.900%	Swiss-Prot	低置信
`A0A1P8ATR9`	拟南芥	sp\|A0A1P8ATR9\|RLP9B_ARATH Receptor-like protein 9b	37.500%	Swiss-Prot	低置信

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