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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G040240
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 10228027-10236528 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1757 bp · TkA08G040240|TK1151|cDNA

CCATATTGCAACCTTCAAGATGGTGATCTTTTCCTTTGTAGGAAAGAAACTAGAACAACTTTGTAGTTCCTGTTTCCAGGCCTTGAGCTATTTCAAAATTTTATGTTTTCCAATCATTTTTTTCTATCATTATGTGTTGCGTCGTATGAACCAATTCTTTATCGAAGTTTTCTATTTTCTCTTTATTTCTTTCTTGGGTTTTCTTATCCTCAATGCAATGGATCCACGAACCCCGACATTTACTCCTAGAAAGTTAGACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1200 bp · TkA08G040240|TK1151|CDS

ATGAGTGATCTTGGTATCCCACCAAACTTCCATAGCCAACTTGAGCTAGGCACTATAGCAAACCCAGAATTTGAGAGCTCAAAATCAGATATCTTTGATTTTTACGATCAAGAACCCATGGATGATGATTATTCAGACCGGTTGAAGTTCAAATCCATAAAATTCTTAGGTCTTTTAGTATTGGGTTACTTATTATTGGTACAAATCTTGGGTATTGTCTCAGTTTTTGTCTACCTAAATGTCATCTCAAGTGCCAAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

399 aa · TkA08G040240|TK1151|PROTEIN

MSDLGIPPNFHSQLELGTIANPEFESSKSDIFDFYDQEPMDDDYSDRLKFKSIKFLGLLVLGYLLLVQILGIVSVFVYLNVISSAKNVLEQKGLKTFTFSLFTVVSTFASCGFVPTNENMMVFRKNTGLLLILIPQVLLGNNLFPSALRFSVWAIGKFKKKAETSYLLNNTKEIRFHHFLSHIHSSFLVITALVFILVQYVLFSCLEWNADALGGLNNYEKFIGVLFQTINTRHTGETIVDLSTIAAASLVLIVVMMYLP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G040240
TK1151 IDTkA08G040240
OH-1004 IDLXL04_017921
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 73.077
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G040240
位置Chr08:10228027-10236528 (-)
描述Similar to HKT1: Sodium transporter HKT1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10310 钠转运蛋白，在植物耐盐性中发挥核心作用。
The Arabidopsis HKT1 gene homolog mediates inward Na(+) currents in xenopus laevis oocytes and Na(+) uptake in Saccharomyces cerevisiae.2000 · DOI: 10.1104/pp.122.4.1249
AtHKT1 is a salt tolerance determinant that controls Na(+) entry into plant roots.2001 · DOI: 10.1073/pnas.241501798
Glycine residues in potassium channel-like selectivity filters determine potassium selectivity in four-loop-per-subunit HKT transporters from plants.2002 · DOI: 10.1073/pnas.082123799
Altered shoot/root Na+ distribution and bifurcating salt sensitivity in Arabidopsis by genetic disruption of the Na+ transporter AtHKT1.2002 · DOI: 10.1016/s0014-5793(02)03488-9
Functional analysis of AtHKT1 in Arabidopsis shows that Na(+) recirculation by the phloem is crucial for salt tolerance.2003 · DOI: 10.1093/emboj/cdg207
AtHKT1 facilitates Na+ homeostasis and K+ nutrition in planta.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.042234
Microarray-based rapid cloning of an ion accumulation deletion mutant in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0404780101

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0175000 具有高选择性钠转运蛋白的功能。
Diversity in expression patterns and functional properties in the rice HKT transporter family.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.138008
Identification of rice cornichon as a possible cargo receptor for the Golgi-localized sodium transporter OsHKT1;3.2015 · DOI: 10.1093/jxb/erv069
UniProt: A2WNZ9 钠转运蛋白，在盐胁迫下介导韧皮部的钠排斥，防止钠转移到幼叶片和生殖组织（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
Os01g0307500 钠转运蛋白，在盐胁迫下介导韧皮部钠排除，以防止钠向幼叶叶片和生殖组织转移。
OsHKT1;5 mediates Na+ exclusion in the vasculature to protect leaf blades and reproductive tissues from salt toxicity in rice.2017 · DOI: 10.1111/tpj.13595
Os04g0607600 可能的阳离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017921 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0035725 sodium ion transmembrane transport 生物过程
GO:2000649 regulation of sodium ion transmembrane transporter activity 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0008324 monoatomic cation transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015079 potassium ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G10310
dosa:Os01g0307500
dosa:Os02g0175000
osa:4328468
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.675
排名 1 · TkA08G040240 · TK1151
内质网0.133
排名 2 · TkA08G040240 · TK1151
溶酶体／液泡0.104
排名 3 · TkA08G040240 · TK1151
细胞质0.091
排名 4 · TkA08G040240 · TK1151
线粒体0.051
排名 5 · TkA08G040240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02386TrkH34-386 aa
PF06024Orf7857-82 aa
PF06024Orf78175-202 aa
PF31016Lunapark_N178-210 aa
PF06024Orf78242-258 aa
PF31016Lunapark_N274-316 aa
PF06024Orf78277-310 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G040240PF02386TrkH343861e-30107.5
TkA08G040240PF06024Orf7857820.0614.4
TkA08G040240PF06024Orf781752020.0614.4
TkA08G040240PF31016Lunapark_N1782100.01915.7
TkA08G040240PF06024Orf782422580.0614.4
TkA08G040240PF31016Lunapark_N2743160.01915.7
TkA08G040240PF06024Orf782773100.0614.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84TI7拟南芥sp|Q84TI7|HKT1_ARATH Sodium transporter HKT148.000%Swiss-Prot中等置信
Q6H501水稻sp|Q6H501|HKT13_ORYSJ Cation transporter HKT1;350.600%Swiss-Prot高置信
A2WNZ9水稻sp|A2WNZ9|HKT15_ORYSI Cation transporter HKT1;546.800%Swiss-Prot中等置信
Q0JNB6水稻sp|Q0JNB6|HKT15_ORYSJ Cation transporter HKT1;546.800%Swiss-Prot中等置信
Q7XPF7水稻sp|Q7XPF7|HKT14_ORYSJ Probable cation transporter HKT1;447.700%Swiss-Prot中等置信

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