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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G034980
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 8948041-8949765 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

696 bp · TkA08G034980|TK1151|cDNA

ATGAACGAAGAAGTGATGTGCGACACAACATTAGCTCTTGGGATTGGAGTGGGGATGCAAAGGGAGAGGCAATCAAAGCAACACAAGAGGGGTGTTTGGTTGAATCTTTCATTGCCACTTCATCCAAAGATTGAAGCTAACAATGATGATCAAGACTCTAATTTTAGTTCTAAAACCATTGATGATCACGAAGAACAAGAAGAGAGAGGGATAAAACGAAGCGCTAGCAACACCGATGTCTATAATAACAATAGCGATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

696 bp · TkA08G034980|TK1151|CDS

ATGAACGAAGAAGTGATGTGCGACACAACATTAGCTCTTGGGATTGGAGTGGGGATGCAAAGGGAGAGGCAATCAAAGCAACACAAGAGGGGTGTTTGGTTGAATCTTTCATTGCCACTTCATCCAAAGATTGAAGCTAACAATGATGATCAAGACTCTAATTTTAGTTCTAAAACCATTGATGATCACGAAGAACAAGAAGAGAGAGGGATAAAACGAAGCGCTAGCAACACCGATGTCTATAATAACAATAGCGATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

231 aa · TkA08G034980|TK1151|PROTEIN

MNEEVMCDTTLALGIGVGMQRERQSKQHKRGVWLNLSLPLHPKIEANNDDQDSNFSSKTIDDHEEQEERGIKRSASNTDVYNNNSDGSRKKLKLTTEQTTSLENSFKINSTLNTGQKHELAKKLNLLPRQIEVWFQNRRARTKLKQIEQECALLKKCCETLNEENRRLKKELQEVRCYSIKFDQPPYPPLPFYIRYATTAEMLHPCDQDTKTVILPNGGSIAQSHAPVKLS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G034980
TK1151 IDTkA08G034980
OH-1004 IDLXL04_017987
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)80.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G034980
位置Chr08:8948041-8949765 (-)
描述Similar to HOX19: Homeobox-leucine zipper protein HOX19
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37790 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g06710 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XE76 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os03g0231000 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2Z1U1 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017987 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0001217 DNA-binding transcription repressor activity 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G37790
ath:AT5G06710
dosa:Os03g0231000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.981
排名 1 · TkA08G034980 · TK1151
细胞质0.071
排名 2 · TkA08G034980 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA08G034980 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA08G034980 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA08G034980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14151YfhD19-67 aa
PF15009STING_LBD23-121 aa
PF27450AtcB_C34-107 aa
PF11365SOGA69-102 aa
PF25450Rab11-FIP369-101 aa
PF21037CCDC138_cc72-108 aa
PF19776DUF626284-84 aa
PF00046Homeodomain89-143 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G034980PF14151YfhD19670.09813.6
TkA08G034980PF15009STING_LBD231210.04113.9
TkA08G034980PF27450AtcB_C341070.005617.4
TkA08G034980PF11365SOGA691020.008317.9
TkA08G034980PF25450Rab11-FIP3691012.39.3
TkA08G034980PF21037CCDC138_cc721080.4211.4
TkA08G034980PF19776DUF626284841.59.7
TkA08G034980PF00046Homeodomain891433.9e-1659.3
TkA08G034980PF24627PUMA_CC891070.006717.1
TkA08G034980PF02346Vac_Fusion901103.68.3
TkA08G034980PF12443AKNA951050.01516.6
TkA08G034980PF02183HALZ1161277.3e-0730.0
TkA08G034980PF05920Homeobox_KN1161410.0002621.5
TkA08G034980PF08847Crr61241950.2311.9
TkA08G034980PF19776DUF62621261741.59.7
TkA08G034980PF25450Rab11-FIP31361752.39.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P46604拟南芥sp|P46604|HAT22_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT2256.700%Swiss-Prot中等置信
P46665拟南芥sp|P46665|HAT14_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT1450.300%Swiss-Prot中等置信
A2XE76水稻sp|A2XE76|HOX19_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1955.700%Swiss-Prot中等置信
Q8GRL4水稻sp|Q8GRL4|HOX19_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX1955.700%Swiss-Prot中等置信
A2Z1U1水稻sp|A2Z1U1|HOX11_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1160.000%Swiss-Prot中等置信

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