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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G002190
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 550323-555665 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2912 bp · TkA08G002190|TK1151|cDNA

TAATTTCATTCATCAGCCGGCATCCCCTTTGTGCGACTCCATCGTTGCTTCGCTGCTTCACGCTTCAAACGCTGCTTCACGCCTCCATTGCTGCTTCCTTTTTCCTCGGTTCCTGCTGTACAGTTCTTCCGTGAGCCTCAATCGGTGAAGAAATTGCTTGTGGTGTTTATTGGTTGTAAAAGAGTTGAAAGATGGTGCAACATAAGGCTCAGCTGAAGAAGCAGCAGAAGCGCGGTGTAGACTTTAAAAAAATAAAGCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2508 bp · TkA08G002190|TK1151|CDS

ATGGTGCAACATAAGGCTCAGCTGAAGAAGCAGCAGAAGCGCGGTGTAGACTTTAAAAAAATAAAGCGAAAGATTGGAAGGAAATTGCCGCCACCAAAGAACACCACGAATACGGAAGTGAAATCGAAAGCAATTGTATTACCGGAACAAAGTTTGGCATCGGAGAAGGGTGGTCTAGCTGTCAGCAAAAAAGGTTTGACTTTAAAAGAGCTGCTTAGTCAAACATCTCATCACAATGCCAAAGTCCGTAGAGATGCATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

835 aa · TkA08G002190|TK1151|PROTEIN

MVQHKAQLKKQQKRGVDFKKIKRKIGRKLPPPKNTTNTEVKSKAIVLPEQSLASEKGGLAVSKKGLTLKELLSQTSHHNAKVRRDALIGIRDIFLKHPAELKIHRLTVIEKLRERMTDEDRVVRETLYQLLKAVVFPGCKEDNQGTFISLMMAYVFNAMTHLAFDVRLMAFKFFDLVVQHYPMSFSMYAEKIIQYYKEMLQQNQFNLHDKGKLKSVLAGLAYCLSLLPSNKRDDNSSENVVADRIILHAFESQVHEDRSV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G002190
TK1151 IDTkA08G002190
OH-1004 IDLXL04_026624
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G002190
位置Chr08:550323-555665 (+)
描述Similar to TEX10: Testis-expressed protein 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026624 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000448 cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0071339 MLL1 complex 细胞组分
GO:0120330 rixosome complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
gga:420993
hsa:54881
mmu:269536
pon:100171926
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.731
排名 1 · TkA08G002190 · TK1151
细胞质0.272
排名 2 · TkA08G002190 · TK1151
内质网0.039
排名 3 · TkA08G002190 · TK1151
高尔基体0.035
排名 4 · TkA08G002190 · TK1151
细胞膜0.035
排名 5 · TkA08G002190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24714TOR1L1_N67-206 aa
PF23271HEAT_GCN167-135 aa
PF23227HEAT_MROH2B_C68-178 aa
PF25757TPR_DNAAF568-130 aa
PF13646HEAT_269-131 aa
PF02985HEAT71-93 aa
PF02985HEAT109-134 aa
PF12333Ipi1_N147-213 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G002190PF24714TOR1L1_N672060.0001521.9
TkA08G002190PF23271HEAT_GCN1671350.01716.0
TkA08G002190PF23227HEAT_MROH2B_C681780.03314.2
TkA08G002190PF25757TPR_DNAAF5681301.29.0
TkA08G002190PF13646HEAT_2691310.1213.4
TkA08G002190PF02985HEAT71930.1812.9
TkA08G002190PF02985HEAT1091340.1812.9
TkA08G002190PF12333Ipi1_N1472132e-0732.1
TkA08G002190PF23271HEAT_GCN11482010.01716.0
TkA08G002190PF02985HEAT1571790.1812.9
TkA08G002190PF02985HEAT2712810.1812.9
TkA08G002190PF25757TPR_DNAAF52712881.29.0
TkA08G002190PF24714TOR1L1_N4034670.0001521.9
TkA08G002190PF23271HEAT_GCN14354570.01716.0
TkA08G002190PF02985HEAT4484660.1812.9
TkA08G002190PF25781TPR_TEX104825795.3e-1969.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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