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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G433880
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 109780038-109781846 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

591 bp · TkA07G433880|TK1151|cDNA

ATGTCATTCAAGGGAAATGCTCTCATTCAAGGCTATAATAAATGCAAATTCAAAGCCAAAGTTCGGATTAATCAACACACTTCCTCAAGTGCTCACCAAGTTGTTTCATGGAAGAACTATCTATATGTTTATGGTGACGAATTTACCTCTCCTAATCAAGAGTGTTTCCATGACTACAAGGGGGATTATGAAATGTTGTTGGCTCTTGATGAGAATAATCACAGACATGGAGGTGCAACTTCTGCACAGATCAATAACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

591 bp · TkA07G433880|TK1151|CDS

ATGTCATTCAAGGGAAATGCTCTCATTCAAGGCTATAATAAATGCAAATTCAAAGCCAAAGTTCGGATTAATCAACACACTTCCTCAAGTGCTCACCAAGTTGTTTCATGGAAGAACTATCTATATGTTTATGGTGACGAATTTACCTCTCCTAATCAAGAGTGTTTCCATGACTACAAGGGGGATTATGAAATGTTGTTGGCTCTTGATGAGAATAATCACAGACATGGAGGTGCAACTTCTGCACAGATCAATAACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

196 aa · TkA07G433880|TK1151|PROTEIN

MSFKGNALIQGYNKCKFKAKVRINQHTSSSAHQVVSWKNYLYVYGDEFTSPNQECFHDYKGDYEMLLALDENNHRHGGATSAQINNLPESRVQAENLQECSICLETPTIGETIRHIPCLHRFHKAESVNDYFTLEVDNMYGGYSKEVFSNKNGHSDMWLFDLKTWVRIKEAFALASTSSEENNWAGLPHLIKFYKN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G433880
TK1151 IDTkA07G433880
OH-1004 IDLXL04_006356
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)59.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 67.532
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G433880
位置Chr07:109780038-109781846 (+)
描述Similar to AGT2: Alanine--glyoxylate aminotransferase 2 homolog 1, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g73960 TAF 是转录因子 IID (TFIID) 复合物的组成部分，对于介导 RNA 聚合酶转录的调节至关重要。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006356 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009436 glyoxylate catabolic process 生物过程
GO:0009853 photorespiration 生物过程
GO:0019265 glycine biosynthetic process, by transamination of glyoxylate 生物过程
GO:0019481 L-alanine catabolic process, by transamination 生物过程
GO:0043562 cellular response to nitrogen levels 生物过程
GO:0045429 positive regulation of nitric oxide biosynthetic process 生物过程
GO:2001299 N(omega),N(omega)-dimethyl-L-arginine catabolic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G08860
ath:AT4G39660
bta:521553
hsa:64902
pon:100171524
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.428
排名 1 · TkA07G433880 · TK1151
细胞核0.406
排名 2 · TkA07G433880 · TK1151
细胞膜0.112
排名 3 · TkA07G433880 · TK1151
线粒体0.102
排名 4 · TkA07G433880 · TK1151
内质网0.087
排名 5 · TkA07G433880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23314TASOR_alpha-beta26-59 aa
PF13415Beta-prop_FBX4228-59 aa
PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC732-48 aa
PF13445zf-RING_UBOX46-57 aa
PF13923zf-C3HC4_254-57 aa
PF00097zf-C3HC454-59 aa
PF23314TASOR_alpha-beta89-129 aa
PF13639zf-RING_298-124 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G433880PF23314TASOR_alpha-beta26590.1712.8
TkA07G433880PF13415Beta-prop_FBX4228590.0314.7
TkA07G433880PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC732480.03214.2
TkA07G433880PF13445zf-RING_UBOX46572.98.7
TkA07G433880PF13923zf-C3HC4_254570.1212.9
TkA07G433880PF00097zf-C3HC454590.5810.8
TkA07G433880PF23314TASOR_alpha-beta891290.1712.8
TkA07G433880PF13639zf-RING_2981240.0002222.1
TkA07G433880PF17123zf-RING_11991242.9e-0730.8
TkA07G433880PF13923zf-C3HC4_2991240.1212.9
TkA07G433880PF00097zf-C3HC41001240.5810.8
TkA07G433880PF13445zf-RING_UBOX1001242.98.7
TkA07G433880PF13415Beta-prop_FBX421391680.0314.7
TkA07G433880PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC71391660.03214.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LPF0拟南芥sp|Q8LPF0|TAF2_ARATH Transcription initiation factor TFIID subunit 273.300%Swiss-Prot低置信

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