TkA07G415530 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G415530

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 105037725-105039673 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1760 bp · TkA07G415530|TK1151|cDNA

TCTCTCTCTCTCTCTCTCCAAAACCAGTATTTAGGGGCTTAAGTCCTTGAATCTTTTCCTCTTTTTCTTTCAAACCTCTCAATCTTTAAGCTTACACTACTTTATGGTTTTTCTTTCTTCCATGGCTTGCTCCTTTCTGCTTCTTTATAACCTCCTCATAGCTTTCATTTCCATTTCAAAATTACAACAATCTACGCCTACTCTTGTTAACTAGATTTACTTCTTTCCCTCCCTCCTTTTTTCTCTCTTAAGTTCAATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1056 bp · TkA07G415530|TK1151|CDS

ATGATCATGGAGAATTACTCTGGGTTTGCTAAAGAAGACGACCAGCAGCTGGATTTACCTCCCGGATTCCGATTTCATCCGACGGATGAAGAGCTGATCACGCATTATTTAATCAAGAAGGTTGTCGATAACACCTTCTCCGCTAAAGCAATCGGGGAGGTCGATATGAACAGAATTGAGCCATGGCAGTTACCTGGGCTGGCGAAAATGGGCGAAAAGGAATGGTATTTTTTCTGTGTGAGGGATAAGAAGTATCCCAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

351 aa · TkA07G415530|TK1151|PROTEIN

MIMENYSGFAKEDDQQLDLPPGFRFHPTDEELITHYLIKKVVDNTFSAKAIGEVDMNRIEPWQLPGLAKMGEKEWYFFCVRDKKYPTGLRTNRATDAGYWKATGKDKEIFRGKLLVGMKKTLVFYKGRAPKGEKTNWVIHEFRLEGKSSVQTIPKSAKNEWVICRVFHKGSGDKKLNPPGTTNANSGENQLNPTHFPLLTDTSSPYTGGRVIKSDSLDVPCFSSPITMQTPHNNFLNNPSYPFDPNSNGNYSFPASESTP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G415530`
TK1151 ID	TkA07G415530
OH-1004 ID	LXL04_030619
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G415530

位置 Chr07:105037725-105039673 (-)

描述 Similar to NAC100: NAC domain-containing protein 100

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g61430`	结合于参与叶绿素分解过程基因的启动子区域，如NYC1、SGR1、SGR2和PAO。	暂无已核实直接文献
`At5g07680`	含NAC结构域的蛋白79。	暂无已核实直接文献
`At5g39610`	转录激活因子，可结合靶基因启动子上的特定双部分基序 5'-[ACG][CA]GT[AG](5-6n)[CT]AC[AG]-3'。	The delayed leaf senescence mutants of Arabidopsis, ore1, ore3, and ore9 are tolerant to oxidative stress.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch110 Trifurcate feed-forward regulation of age-dependent cell death involving miR164 in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1126/science.1166386 Forward and reverse genetics to identify genes involved in the age-related resistance response in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1364-3703.2009.00557.x A gene regulatory network controlled by the NAC transcription factor ANAC092/AtNAC2/ORE1 during salt-promoted senescence.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04151.x ORS1, an H₂O₂-responsive NAC transcription factor, controls senescence in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq080 NAC transcription factor ORE1 and senescence-induced BIFUNCTIONAL NUCLEASE1 (BFN1) constitute a regulatory cascade in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst012 ORE1 balances leaf senescence against maintenance by antagonizing G2-like-mediated transcription.2013 · DOI: 10.1038/embor.2013.24
`At3g29035`	转录激活剂，可与特定二分基序 5'-[AG]CGT[AG][AG][CT]ACGCAA-3' 上靶基因启动子中的 DNA 结合。	ORS1, an H₂O₂-responsive NAC transcription factor, controls senescence in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq080

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0460600`	转录因子参与分蘖芽生长的调节，但似乎不调节分蘖芽的萌发。	Overexpression of a NAC-domain protein promotes shoot branching in rice.2007 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2007.02177.x OsNAC2 encoding a NAC transcription factor that affects plant height through mediating the gibberellic acid pathway in rice.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12819 A Rice NAC Transcription Factor Promotes Leaf Senescence via ABA Biosynthesis.2017 · DOI: 10.1104/pp.17.00542 Overexpression of miR164b-resistant OsNAC2 improves plant architecture and grain yield in rice.2018 · DOI: 10.1093/jxb/ery017 OsNAC2 positively affects salt-induced cell death and binds to the OsAP37 and OsCOX11 promoters.2018 · DOI: 10.1111/tpj.13867 OsNAC2 integrates auxin and cytokinin pathways to modulate rice root development.2020 · DOI: 10.1111/pbi.13209 Overexpression of a microRNA-targeted NAC transcription factor improves drought and salt tolerance in Rice via ABA-mediated pathways.2019 · DOI: 10.1186/s12284-019-0334-6 OsNAC2 Is Involved in Multiple Hormonal Pathways to Mediate Germination of Rice Seeds and Establishment of Seedling.2021 · DOI: 10.3389/fpls.2021.699303

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030619 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009723 response to ethylene 生物过程

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G29035

ath:AT5G07680

ath:AT5G39610

ath:AT5G61430

dosa:Os04g0460600

osa:4336052

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.970

排名 1 · TkA07G415530 · TK1151

细胞质0.083

排名 2 · TkA07G415530 · TK1151

细胞膜0.032

排名 3 · TkA07G415530 · TK1151

内质网0.024

排名 4 · TkA07G415530 · TK1151

质体0.014

排名 5 · TkA07G415530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365NAM20-144 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G415530	`PF02365`	NAM	20	144	1.1e-47	162.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FLJ2`	拟南芥	sp\|Q9FLJ2\|NC100_ARATH NAC domain-containing protein 100	57.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FLR3`	拟南芥	sp\|Q9FLR3\|NAC79_ARATH NAC domain-containing protein 79	54.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FKA0`	拟南芥	sp\|Q9FKA0\|NAC92_ARATH NAC domain-containing protein 92	65.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LJW3`	拟南芥	sp\|Q9LJW3\|NAC59_ARATH NAC domain-containing protein 59	46.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q7XUV6`	水稻	sp\|Q7XUV6\|NAC4_ORYSJ NAC domain-containing protein 4	47.100%	Swiss-Prot	中等置信

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