TkA07G400410 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G400410

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 100633154-100636244 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1483 bp · TkA07G400410|TK1151|cDNA

GAAAAACACGTTTTTCTCCACAAGAGAACCAAACACTCTGAAATCCGACTCGTTTGTGTATGTGCGTTTGCTTATCGACCTTTACTACTACAGGCGACGATTACAATGGCGAACTTGAAGGCGGATTCTCCTCTTTGTCGTCGCATCGCTCTATCTGTCATTGACTTCCTCACTTCTGTTGAACCTACCTCCGCTAGTGATGCTGAAAGCCTTGAGGTTGCAAAAGACTGTTTATCTGAGGTTTTCAAGGTTGATTCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1371 bp · TkA07G400410|TK1151|CDS

GAAAAACACGTTTTTCTCCACAAGAGAACCAAACACTCTGAAATCCGACTCGTTTGTGTATGTGCGTTTGCTTATCGACCTTTACTACTACAGGCGACGATTACAATGGCGAACTTGAAGGCGGATTCTCCTCTTTGTCGTCGCATCGCTCTATCTGTCATTGACTTCCTCACTTCTGTTGAACCTACCTCCGCTAGTGATGCTGAAAGCCTTGAGGTTGCAAAAGACTGTTTATCTGAGGTTTTCAAGGTTGATTCATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

456 aa · TkA07G400410|TK1151|PROTEIN

EKHVFLHKRTKHSEIRLVCVCAFAYRPLLLQATITMANLKADSPLCRRIALSVIDFLTSVEPTSASDAESLEVAKDCLSEVFKVDSSSTSSLPKSDSLIQIFSSQTGKNEIKSDQSHEEPQANTSSTSCTNNAADTKIPGTSQSLSDTDKGNAQPIGVLEDELFGQFFSSLEKIHYFGSTPNGDDEQALERATKLFHNALMEMKKSGSDEFDLKKLADTFKLQGNKAMQSKLYSDAIELYTISIALCDDNAVYYCNRAAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G400410`
TK1151 ID	TkA07G400410
OH-1004 ID	LXL04_005175
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	43.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 18.860 / OH-1004 12.015 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA07G400410`
位置	Chr07:100633154-100636244 (-)
描述	Similar to DNAJC7: DnaJ homolog subfamily C member 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_005175` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:1900034 regulation of cellular response to heat 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分 GO:0001671 ATPase activator activity 分子功能 GO:0031072 heat shock protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用	hsa:7266 mmu:56354 pon:100173101 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.699

排名 1 · TkA07G400410 · TK1151

细胞核0.407

排名 2 · TkA07G400410 · TK1151

线粒体0.098

排名 3 · TkA07G400410 · TK1151

过氧化物酶体0.075

排名 4 · TkA07G400410 · TK1151

内质网0.071

排名 5 · TkA07G400410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16546SGTA_dimer47-103 aa

PF13371TPR_950-66 aa

PF23914TPR_CcmH_CycH65-88 aa

PF30484ETO1_C66-85 aa

PF13374TPR_10185-196 aa

PF14559TPR_19186-205 aa

PF07719TPR_2189-199 aa

PF13176TPR_7190-204 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G400410	`PF16546`	SGTA_dimer	47	103	4.3e-12	46.3
TkA07G400410	`PF13371`	TPR_9	50	66	0.055	14.2
TkA07G400410	`PF23914`	TPR_CcmH_CycH	65	88	0.023	15.3
TkA07G400410	`PF30484`	ETO1_C	66	85	0.026	14.4
TkA07G400410	`PF13374`	TPR_10	185	196	3.2e-06	27.6
TkA07G400410	`PF14559`	TPR_19	186	205	9.4e-08	33.0
TkA07G400410	`PF07719`	TPR_2	189	199	1.1e-14	53.9
TkA07G400410	`PF13176`	TPR_7	190	204	0.0045	17.7
TkA07G400410	`PF13424`	TPR_12	214	240	5.2e-05	24.1
TkA07G400410	`PF13174`	TPR_6	215	227	0.2	13.1
TkA07G400410	`PF13181`	TPR_8	216	239	1.4e-06	28.7
TkA07G400410	`PF00515`	TPR_1	217	249	7e-18	64.3
TkA07G400410	`PF23914`	TPR_CcmH_CycH	218	241	0.023	15.3
TkA07G400410	`PF25575`	TPR_BSK1_C	219	288	1.1e-05	26.1
TkA07G400410	`PF25063`	ARM_TT21_C	219	286	0.0018	18.9
TkA07G400410	`PF07719`	TPR_2	220	250	1.1e-14	53.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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