TkA07G399730 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G399730

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 100419461-100420276 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

816 bp · TkA07G399730|TK1151|cDNA

ATGACTTCTTTTACAGAAGTTAAACGCATTTCAGAGTGCTTCGTAAAGCCACTGCGTGACCTCTCGCCGGAGGCAAAGCAGCCTTTTTACTTCACACCCTTCGAGCTGCCCTGCCTCAACATCAACTACAGCCAAAAGGGTCTCCTCTTTTCAAAGCCACCACCGTCGGAAAATCAAGATTTCTCCATAACCGATTACTTAGATGACCTCCGACACTCCCTCTCCACCACCCTCGATCATTTCTACCCGCTCGCCGGCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

816 bp · TkA07G399730|TK1151|CDS

ATGACTTCTTTTACAGAAGTTAAACGCATTTCAGAGTGCTTCGTAAAGCCACTGCGTGACCTCTCGCCGGAGGCAAAGCAGCCTTTTTACTTCACACCCTTCGAGCTGCCCTGCCTCAACATCAACTACAGCCAAAAGGGTCTCCTCTTTTCAAAGCCACCACCGTCGGAAAATCAAGATTTCTCCATAACCGATTACTTAGATGACCTCCGACACTCCCTCTCCACCACCCTCGATCATTTCTACCCGCTCGCCGGCCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

272 aa · TkA07G399730|TK1151|PROTEIN

MTSFTEVKRISECFVKPLRDLSPEAKQPFYFTPFELPCLNINYSQKGLLFSKPPPSENQDFSITDYLDDLRHSLSTTLDHFYPLAGRLATRKEENPPSYVIYLDPGNTSGVKFIHATADATVSDILQPGDVPLVVRSFFDLNNAISHDAHTLPLLSIQVTELVDGIFIGGSVNHMVADGTSFWHFMGAWSEIFKSKEQYCGTISRPPVFKRWVLDGFDPIINLPFTHHDQFIERFEPPQFRERFFHFSAAAVSKLKKKAN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G399730`
TK1151 ID	TkA07G399730
OH-1004 ID	LXL04_030358
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 59.780 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G399730

位置 Chr07:100419461-100420276 (-)

描述 Similar to At3g50280: Uncharacterized acetyltransferase At3g50280

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g67160`	在病原物诱导的水杨酸（SA）积累及SA介导的对有毒和无毒病原体（如P.syringae）抗性中必需。	An important role of a BAHD acyl transferase-like protein in plant innate immunity.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03747.x
`At1g03940`	参与花青素 3-O-葡萄糖残基 6'' 位的酰化作用。	暂无已核实直接文献
`At1g03495`	参与花青素 3-O-葡萄糖残基 6'' 位的酰化作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030358 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009697 salicylic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程

GO:0009809 lignin biosynthetic process 生物过程

GO:0009813 flavonoid biosynthetic process 生物过程

GO:0009963 positive regulation of flavonoid biosynthetic process 生物过程

GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程

GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程

GO:0071555 cell wall organization 生物过程

GO:0090626 plant epidermis morphogenesis 生物过程

GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ag:CAB06427

ath:AT3G50280

ath:AT5G23940

ath:AT5G48930

ath:AT5G67160

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.696

排名 1 · TkA07G399730 · TK1151

细胞核0.379

排名 2 · TkA07G399730 · TK1151

内质网0.089

排名 3 · TkA07G399730 · TK1151

细胞膜0.058

排名 4 · TkA07G399730 · TK1151

溶酶体／液泡0.043

排名 5 · TkA07G399730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02458Transferase39-270 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G399730	`PF02458`	Transferase	39	270	2.8e-35	122.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FH97`	拟南芥	sp\|Q9FH97\|EPS1_ARATH Protein ENHANCED PSEUDOMONAS SUSCEPTIBILITY 1	36.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9ZWB4`	拟南芥	sp\|Q9ZWB4\|3AT1_ARATH Coumaroyl-CoA:anthocyanidin 3-O-glucoside-6''-O-coumaroyltransferase 1	30.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LR73`	拟南芥	sp\|Q9LR73\|3AT2_ARATH Coumaroyl-CoA:anthocyanidin 3-O-glucoside-6''-O-coumaroyltransferase 2	29.300%	Swiss-Prot	低置信

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