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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G397570
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 99900025-99906568 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5130 bp · TkA07G397570|TK1151|cDNA

TACTTATAGAGAATCAAAAGTAAATAAACTTGAATTTCATCCAAAGTCACAATATATTTGTTTTGTGAATATATACACCCAAAGTTTTTTCTTTTATTACTATGCCGTACAAAATTCAACCCTTTTTCTCTCTCACTTCTTAAGTCGCGTTCGGGTCGAAATACGTCTCTTCTTGCTTATCGACGTGGTGCACAAATCCTGACCAAATCAAGGTTTTACCAGGGTAAATAAACGGAAGCTGAATCTTCATACAGATCGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

4419 bp · TkA07G397570|TK1151|CDS

ATGAATTTACAGACTCAAATGGCAGGACAGTTCTCAAGACAAGTTCCCAATCAATCTGGCACTTCATTACCTATTCAACAACAACAACAACAGAACATGATGCATAATTCTGAATCTTCCCATGCTTCACTAACCATGGAAACTGGTTTTGATAAAGCTCGAAGATTCATCCTAGATAGAATATATGAGTTCTTGATGCAAAGGCAACAAGCGCGTGAGATACCTCCAAATAATGTTTCGGATATTGTTAGACGATTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1472 aa · TkA07G397570|TK1151|PROTEIN

MNLQTQMAGQFSRQVPNQSGTSLPIQQQQQQNMMHNSESSHASLTMETGFDKARRFILDRIYEFLMQRQQAREIPPNNVSDIVRRLEEGLFKSATSKEEYMNLDTLEKRLHLLIRRPAQRYQQQQQQQQMNASTNTMIPTPGVPQSADVMVTSASGVNSGSYSMPMGNSQMMPTPGFNNSNPTTSNMSGDSTMVSQNQNQSQSQSQLQSQQQKQQQVVGGQNSRILHSLGSHMGVVGGIRSSLNQKAYGFQNGNNLGGMM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G397570
TK1151 IDTkA07G397570
OH-1004 IDLXL04_030328
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G397570
位置Chr07:99900025-99906568 (-)
描述Similar to HAC1: Histone acetyltransferase HAC1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g79000 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At1g16710 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At3g12980 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
At1g55970 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0137500 乙酰转移酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030328 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006473 protein acetylation 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0000123 histone acetyltransferase complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005667 transcription regulator complex 细胞组分
GO:0016592 mediator complex 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003713 transcription coactivator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G16710
ath:AT1G79000
dosa:Os02g0137500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.906
排名 1 · TkA07G397570 · TK1151
细胞质0.200
排名 2 · TkA07G397570 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA07G397570 · TK1151
线粒体0.022
排名 4 · TkA07G397570 · TK1151
内质网0.012
排名 5 · TkA07G397570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16987KIX_253-102 aa
PF09606Med15_N81-124 aa
PF29847KAT3191-216 aa
PF02135zf-TAZ476-545 aa
PF00628PHD510-529 aa
PF00628PHD739-747 aa
PF00569ZZ767-773 aa
PF31197PHD_JHD1797-819 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G397570PF16987KIX_2531020.02915.0
TkA07G397570PF09606Med15_N811240.03114.7
TkA07G397570PF29847KAT31912163.5e-77260.6
TkA07G397570PF02135zf-TAZ4765456.9e-2897.6
TkA07G397570PF00628PHD5105295e-0627.2
TkA07G397570PF00628PHD7397475e-0627.2
TkA07G397570PF00569ZZ7677732e-0525.0
TkA07G397570PF31197PHD_JHD17978190.001219.4
TkA07G397570PF00628PHD7988385e-0627.2
TkA07G397570PF23570PHD_P3008028220.03314.8
TkA07G397570PF00569ZZ8058122e-0525.0
TkA07G397570PF00569ZZ8328392e-0525.0
TkA07G397570PF29847KAT389911283.5e-77260.6
TkA07G397570PF00569ZZ117512082e-0525.0
TkA07G397570PF02135zf-TAZ117912066.9e-2897.6
TkA07G397570PF31197PHD_JHD1117912000.001219.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C5X9拟南芥sp|Q9C5X9|HAC1_ARATH Histone acetyltransferase HAC167.400%Swiss-Prot高置信
Q9FWQ5拟南芥sp|Q9FWQ5|HAC12_ARATH Histone acetyltransferase HAC1268.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LE42拟南芥sp|Q9LE42|HAC5_ARATH Histone acetyltransferase HAC560.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LG11拟南芥sp|Q9LG11|HAC4_ARATH Histone acetyltransferase HAC456.600%Swiss-Prot中等置信
Q6YXY2水稻sp|Q6YXY2|HACL1_ORYSJ Probable histone acetyltransferase HAC-like 164.100%Swiss-Prot中等置信

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